砂生槐群体遗传特性与代表群体表型性状研究
发布时间：2021-01-19 11:56
砂生槐（Sophora moorcroftiana）是西藏雅鲁藏布江流域特有的多年生豆科矮灌木,具有无可替代的经济和生态价值。一些研究发现,在雅鲁藏布江流域不同海拔生长的砂生槐群体在表型上有明显的差异,但对这些差异群体的遗传学研究却很少。对不同砂生槐天然群体进行遗传特性研究,了解不同地区砂生槐群体间的遗传结构及其形成的驱动因素和群体的扩展方向和方式,评价具有代表性的群体的表型特性,对于砂生槐的开发、利用以及后续研究尤为重要。本研究采用高通量基因分型测序技术（Genotyping-by-Sequencing）对来自不同地理位置的15个群体的225个个体进行了简化基因组测序,平均每个个体得到了大小为2,828.95 M的序列,鉴定出了2,394,536个单核苷酸多态性（SNP）,通过群体遗传多样性评估、系统发育分析、主成分分析和群体遗传结构分析,了解了每个群体以及亚群的遗传特性。为了探究不同亚群的表型性状和遗传特性之间的关联、选择出具有沙化治理及引种潜力优势群体,研究选取了3个代表性群体（Pop 1、Pop 7和Pop 15）,并对这3个代表性群体做了以下表型性状研究:测定了5个种实性状指...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：51 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
砂生槐样本群体在雅鲁藏布江流域的地理分布
个体 1~15）和 Pop 7（个体 16~30）相比，位于同一流域（拉萨河）上游 166~180）与其它两个群体距离较远。在日喀则群体中，Pop 6（个体 1其它群体分开（包括 Pop 5、Pop 3、Pop 4、Pop 1 和 Pop 2），其次为 P~210）。Pop 1 接近 Pop 2 而 Pop 3 接近 Pop 4。总的来说，林芝群体在与其他群体亲缘关系最远，接下来是山南、拉萨群体，然后是 Pop 7、日喀则群体。
显示了当遗传分类亚群数为 4 和 5 时 225 个砂生槐个体的聚类信息。当样本四个分类群时，Pop 14 和 Pop 15 的遗传信息来自祖先 I，Pop 12 大约 70％的遗来自于祖先 I；Pop 9、Pop 10 和 Pop 11 来自祖先 II；Pop 7 和 Pop 8 有大约一遗传信息来自祖先 II，剩下的一半遗传信息来自祖先 III；日喀则群体 Pop 1、Pop 3、Pop 4、Pop 5 和 Pop 6 的遗传信息都来自祖先 III；只有 Pop 13 的遗传信于祖先 IV。4 个遗传分类群的聚类情况大致符合 225 个砂生槐样本的地理分布分日喀则个体分为一个亚群体；Pop 7、Pop 8 位于日喀则亚群和拉萨和山南混体之间；拉萨和山南混合群体；林芝低海拔；林芝工布江达县）。当所有样本 5 个分类群时，在 4 个分类群中本为同一分类群 II（Pop 9、Pop 10、Pop 11）p 9 被分为另一个分类群，Pop 7 和 Pop 8 的遗传信息仍然来自两个祖先，但原分类群 II（Pop 9、Pop 10 和 Pop 11）的遗传信息被计算为来自拉萨墨竹的 Po喀则群体中的 Pop 5 和 Pop 6 也包含来自 Pop 9 的遗传信息。
【参考文献】：
期刊论文
[1]西藏不同生长地砂生槐群体种子生物碱含量及其相关性分析[J]. 王玉婷,普布次仁,麻文俊,刘莹,单增罗布. 西北植物学报. 2018(10)
[2]外源物质处理促进砂生槐种子萌发的效应分析[J]. 刘莹,李媛,刘彬,普布次仁,王玉婷,杨桂娟,王军辉,麻文俊. 西北林学院学报. 2018(04)
[3]SNP分子标记及其在木本植物遗传育种的应用[J]. 周琳,段玉,文博,马媛春,朱旭君,王玉花,房婉萍. 亚热带植物科学. 2018(02)
[4]雅鲁藏布江流域水文分区研究[J]. 姬海娟,刘金涛,李瑶,江玉吉,汪银奎. 水文. 2018(02)
[5]应用FastTree2.1.8快速构建HIV-1 pol区基因的最大似然系统进化树[J]. 张亚丽,韩志刚,吴昊,夏云. 中国艾滋病性病. 2017(08)
[6]铅胁迫对几种乔木种子萌发及活力的影响研究[J]. 宋清玉,王进鑫,杨楠. 西北林学院学报. 2017(04)
[7]药用植物研究中的分子标记技术应用进展[J]. 陈红波,余金芮,杨春先,钱刚. 湖北农业科学. 2017(13)
[8]基于叶片解剖结构的砂生槐群体抗旱性评价[J]. 刘彬,麻文俊,王军辉,普布次仁,项艳. 植物研究. 2017(03)
[9]砂生槐多糖提取物对免疫抑制模型小鼠Treg和Th17的影响[J]. 雒艳萍,贾天玉,管彬,冯燕海,史彦斌,马兴铭. 天然产物研究与开发. 2016(10)
[10]植物群体遗传进化研究方法探析[J]. 郎娜,刘之慧,宋艰难,董清华. 北京农学院学报. 2016(02)
硕士论文
[1]西藏砂生槐的抗旱性研究[D]. 尼玛曲珍.西藏大学 2009
本文编号：2986942
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：51 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
砂生槐样本群体在雅鲁藏布江流域的地理分布
个体 1~15）和 Pop 7（个体 16~30）相比，位于同一流域（拉萨河）上游 166~180）与其它两个群体距离较远。在日喀则群体中，Pop 6（个体 1其它群体分开（包括 Pop 5、Pop 3、Pop 4、Pop 1 和 Pop 2），其次为 P~210）。Pop 1 接近 Pop 2 而 Pop 3 接近 Pop 4。总的来说，林芝群体在与其他群体亲缘关系最远，接下来是山南、拉萨群体，然后是 Pop 7、日喀则群体。
显示了当遗传分类亚群数为 4 和 5 时 225 个砂生槐个体的聚类信息。当样本四个分类群时，Pop 14 和 Pop 15 的遗传信息来自祖先 I，Pop 12 大约 70％的遗来自于祖先 I；Pop 9、Pop 10 和 Pop 11 来自祖先 II；Pop 7 和 Pop 8 有大约一遗传信息来自祖先 II，剩下的一半遗传信息来自祖先 III；日喀则群体 Pop 1、Pop 3、Pop 4、Pop 5 和 Pop 6 的遗传信息都来自祖先 III；只有 Pop 13 的遗传信于祖先 IV。4 个遗传分类群的聚类情况大致符合 225 个砂生槐样本的地理分布分日喀则个体分为一个亚群体；Pop 7、Pop 8 位于日喀则亚群和拉萨和山南混体之间；拉萨和山南混合群体；林芝低海拔；林芝工布江达县）。当所有样本 5 个分类群时，在 4 个分类群中本为同一分类群 II（Pop 9、Pop 10、Pop 11）p 9 被分为另一个分类群，Pop 7 和 Pop 8 的遗传信息仍然来自两个祖先，但原分类群 II（Pop 9、Pop 10 和 Pop 11）的遗传信息被计算为来自拉萨墨竹的 Po喀则群体中的 Pop 5 和 Pop 6 也包含来自 Pop 9 的遗传信息。
【参考文献】：
期刊论文
[1]西藏不同生长地砂生槐群体种子生物碱含量及其相关性分析[J]. 王玉婷,普布次仁,麻文俊,刘莹,单增罗布. 西北植物学报. 2018(10)
[2]外源物质处理促进砂生槐种子萌发的效应分析[J]. 刘莹,李媛,刘彬,普布次仁,王玉婷,杨桂娟,王军辉,麻文俊. 西北林学院学报. 2018(04)
[3]SNP分子标记及其在木本植物遗传育种的应用[J]. 周琳,段玉,文博,马媛春,朱旭君,王玉花,房婉萍. 亚热带植物科学. 2018(02)
[4]雅鲁藏布江流域水文分区研究[J]. 姬海娟,刘金涛,李瑶,江玉吉,汪银奎. 水文. 2018(02)
[5]应用FastTree2.1.8快速构建HIV-1 pol区基因的最大似然系统进化树[J]. 张亚丽,韩志刚,吴昊,夏云. 中国艾滋病性病. 2017(08)
[6]铅胁迫对几种乔木种子萌发及活力的影响研究[J]. 宋清玉,王进鑫,杨楠. 西北林学院学报. 2017(04)
[7]药用植物研究中的分子标记技术应用进展[J]. 陈红波,余金芮,杨春先,钱刚. 湖北农业科学. 2017(13)
[8]基于叶片解剖结构的砂生槐群体抗旱性评价[J]. 刘彬,麻文俊,王军辉,普布次仁,项艳. 植物研究. 2017(03)
[9]砂生槐多糖提取物对免疫抑制模型小鼠Treg和Th17的影响[J]. 雒艳萍,贾天玉,管彬,冯燕海,史彦斌,马兴铭. 天然产物研究与开发. 2016(10)
[10]植物群体遗传进化研究方法探析[J]. 郎娜,刘之慧,宋艰难,董清华. 北京农学院学报. 2016(02)
硕士论文
[1]西藏砂生槐的抗旱性研究[D]. 尼玛曲珍.西藏大学 2009
本文编号：2986942
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