野杏SSR标记多样性及其与表型性状的关联分析
发布时间：2021-06-06 15:08
本文以喀左县山杏国家林木种质资源保存库中60个野杏无性系为研究对象,观测了18个质量性状和25个数量性状,利用120对引物进行SSR分子标记扩增,分析了野杏表型性状和SSR标记的遗传多样性,并在此基础上进行了表型性状与SSR标记的关联分析,主要研究结果如下:（1）野杏无性系18个质量性状中,叶片形状、花瓣颜色、果肉口感、杏仁口感等主要性状符合野杏表型特征。25个数量性状的变异系数在7.8%42.6%之间,其中22个数量性状的变异系数高于10%。（2）聚类结果主要反映了表型性状的差异。第一类叶形指数最小,表型性状总体表现中庸。第二类果核仁性状数值及嫩枝生长量最大。第三类叶形指数最大,出仁率最小,花果变异类型较多。第四类果形、核形、仁形指数最大,出核率和出仁率较大。第五类出核率、出仁率最高,花变异类型较多。各类分别具有果用、核用、仁用、观赏及特殊类型的用途。（3）在120对引物中筛选出64对多态性高的引物,其平均等位基因数为7.438,有效等位基因数平均值为3.359,多态信息含量平均值为0.639。STRUCTURE分类结果为3个亚群,NTsys聚类结果为4类,主要...
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于表型性状的野杏无性系聚类树状图
图 3-1 DNA 提取后电泳结果Fig. 3-1 Parts of DNA extraction results in this study注:各编号为样本编号Note:The Numbers for samples number2.2 引物的筛选基于课题组前期山杏引物开发筛选出的 600 对引物，对其进行 PIC 值计算，挑选出C 值大于 0.5 的引物，在此基础上挑选扩増效果好、多态性高、PIC 高的重复引物，筛选出 120 对引物，部分引物信息见附表 1。部分非变性聚丙烯酰胺凝胶检测结果见 3-2。
图 3-2 部分扩增产物电泳结果Fig. 3-2 Parts of PCR amplification results in this study3.2.3 SSR 分子标记的遗传多样性分析利用 120 对引物对野杏群体进行 SSR 标记，其中目标条带清晰、多态性好的引物有64 对，扩增片段大小在 100~200 之间，多态性指标如表 3-1 所示。64 对引物均能扩增较多的多态性谱带，平均等位基因数为 7.438，分布范围在 4~16 之间；有效等位基因数平均值为 3.359，分布范围在 2.179~8.392 之间；Shannon 信息指数平均值为 1.433，分布范围在 1.03~2.441 之间；多态信息含量平均值为 0.639，分布范围在 0.502~0.872 之间，这些位点的 PIC 值均大于 0.5，说明其具有中等以上水平的多态性。综上可知，64 个引物在 60 个野杏无性系群体扩增条带方面皆表现出多态性高，遗传多样性丰富，同时也说明野杏无性系群体在分子水平上有较高的遗传多样性。观测杂合度的平均值为 0.2，分布范围为 0~0.95；期望杂合度的平均值为 0.683，分布范围为 0.546~0.888。其中有 61 个 SSR 标记期望杂合度高于观测杂合度，占全部 SSR位点的 95.31%，说明野杏无性系样木群体杂合性低。
【参考文献】：
期刊论文
[1]野杏花粉离体培养条件筛选及花粉生活力研究[J]. 苗阳,董胜君,吴月亮,刘明国,李欢,陈建华. 北方园艺. 2018(04)
[2]福建省茶树品种资源初步关联分析[J]. 杨军,孔祥瑞,王让剑,郑国华. 茶叶学报. 2017(03)
[3]基于SSR标记的杜鹃品种亲缘关系分析[J]. 罗清,於艳萍,卢业飞,梁春. 北方园艺. 2017(19)
[4]甘肃省梨地方品种资源遗传多样性及亲缘关系SSR分析[J]. 欧巧明,王玉安,崔文娟,李红旭,罗俊杰,王发林. 中国果树. 2017(05)
[5]天山樱桃野生居群遗传多样性SSR分析[J]. 李春侨,周龙,陆彪,董凯向,刘春燕. 经济林研究. 2017(03)
[6]基于SSR标记的楸树遗传多样性及核心种质构建[J]. 方乐成,夏慧敏,麻文俊,张新叶. 东北林业大学学报. 2017(08)
[7]现代月季6个表型性状和SSR标记的关联分析[J]. 周俐宏,王金刚,王志刚,张兴,龚束芳,樊金萍,车代弟. 辽宁农业科学. 2017(03)
[8]榆树叶形性状遗传变异与SSR标记关联分析[J]. 史亚朋,左力辉,张文林,王进茂,杨敏生,梁海永. 分子植物育种. 2017(05)
[9]内蒙古西伯利亚杏种质资源表型多样性研究[J]. 尹明宇,高福玲,乌云塔娜. 植物遗传资源学报. 2017(02)
[10]基于SSR标记技术的南丰柑橘种质资源亲缘关系研究[J]. 辜青青,曾涛,魏清江,邹菊花,陈金印. 果树学报. 2017(06)
博士论文
[1]月季品种分子鉴定与遗传关系分析[D]. 黄平.中国林业科学研究院 2012
[2]水稻关联定位群体的构建及若干品质性状的关联分析[D]. 金亮.浙江大学 2009
[3]核桃遗传多样性分析及核心种质的构建[D]. 王红霞.河北农业大学 2006
硕士论文
[1]喀左县野杏引种适应性及优树遗传测定研究[D]. 张悦炀.沈阳农业大学 2017
[2]东北杏种质资源多样性研究[D]. 张皓凯.沈阳农业大学 2017
[3]梨SSR遗传图谱的构建及部分农艺性状的QTL定位分析[D]. 王磊.新疆农业大学 2016
[4]西伯利亚杏优选无性系SSR标记多样性及其与表型性状的关联分析[D]. 张欣.沈阳农业大学 2016
[5]东北野生杏居群遗传多样性及遗传结构分析[D]. 马丽娟.吉林农业大学 2013
[6]利用AFLP分子标记分析山杏的遗传多样性[D]. 王磊.河北农业大学 2008
[7]吉林省野生西伯利亚杏种质资源遗传多样性研究[D]. 芦宁超.吉林农业大学 2008
[8]半干旱地区山杏种质资源调查及遗传特性的研究[D]. 赵桂玲.沈阳农业大学 2003
本文编号：3214626
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于表型性状的野杏无性系聚类树状图
图 3-1 DNA 提取后电泳结果Fig. 3-1 Parts of DNA extraction results in this study注:各编号为样本编号Note:The Numbers for samples number2.2 引物的筛选基于课题组前期山杏引物开发筛选出的 600 对引物，对其进行 PIC 值计算，挑选出C 值大于 0.5 的引物，在此基础上挑选扩増效果好、多态性高、PIC 高的重复引物，筛选出 120 对引物，部分引物信息见附表 1。部分非变性聚丙烯酰胺凝胶检测结果见 3-2。
图 3-2 部分扩增产物电泳结果Fig. 3-2 Parts of PCR amplification results in this study3.2.3 SSR 分子标记的遗传多样性分析利用 120 对引物对野杏群体进行 SSR 标记，其中目标条带清晰、多态性好的引物有64 对，扩增片段大小在 100~200 之间，多态性指标如表 3-1 所示。64 对引物均能扩增较多的多态性谱带，平均等位基因数为 7.438，分布范围在 4~16 之间；有效等位基因数平均值为 3.359，分布范围在 2.179~8.392 之间；Shannon 信息指数平均值为 1.433，分布范围在 1.03~2.441 之间；多态信息含量平均值为 0.639，分布范围在 0.502~0.872 之间，这些位点的 PIC 值均大于 0.5，说明其具有中等以上水平的多态性。综上可知，64 个引物在 60 个野杏无性系群体扩增条带方面皆表现出多态性高，遗传多样性丰富，同时也说明野杏无性系群体在分子水平上有较高的遗传多样性。观测杂合度的平均值为 0.2，分布范围为 0~0.95；期望杂合度的平均值为 0.683，分布范围为 0.546~0.888。其中有 61 个 SSR 标记期望杂合度高于观测杂合度，占全部 SSR位点的 95.31%，说明野杏无性系样木群体杂合性低。
【参考文献】：
期刊论文
[1]野杏花粉离体培养条件筛选及花粉生活力研究[J]. 苗阳,董胜君,吴月亮,刘明国,李欢,陈建华. 北方园艺. 2018(04)
[2]福建省茶树品种资源初步关联分析[J]. 杨军,孔祥瑞,王让剑,郑国华. 茶叶学报. 2017(03)
[3]基于SSR标记的杜鹃品种亲缘关系分析[J]. 罗清,於艳萍,卢业飞,梁春. 北方园艺. 2017(19)
[4]甘肃省梨地方品种资源遗传多样性及亲缘关系SSR分析[J]. 欧巧明,王玉安,崔文娟,李红旭,罗俊杰,王发林. 中国果树. 2017(05)
[5]天山樱桃野生居群遗传多样性SSR分析[J]. 李春侨,周龙,陆彪,董凯向,刘春燕. 经济林研究. 2017(03)
[6]基于SSR标记的楸树遗传多样性及核心种质构建[J]. 方乐成,夏慧敏,麻文俊,张新叶. 东北林业大学学报. 2017(08)
[7]现代月季6个表型性状和SSR标记的关联分析[J]. 周俐宏,王金刚,王志刚,张兴,龚束芳,樊金萍,车代弟. 辽宁农业科学. 2017(03)
[8]榆树叶形性状遗传变异与SSR标记关联分析[J]. 史亚朋,左力辉,张文林,王进茂,杨敏生,梁海永. 分子植物育种. 2017(05)
[9]内蒙古西伯利亚杏种质资源表型多样性研究[J]. 尹明宇,高福玲,乌云塔娜. 植物遗传资源学报. 2017(02)
[10]基于SSR标记技术的南丰柑橘种质资源亲缘关系研究[J]. 辜青青,曾涛,魏清江,邹菊花,陈金印. 果树学报. 2017(06)
博士论文
[1]月季品种分子鉴定与遗传关系分析[D]. 黄平.中国林业科学研究院 2012
[2]水稻关联定位群体的构建及若干品质性状的关联分析[D]. 金亮.浙江大学 2009
[3]核桃遗传多样性分析及核心种质的构建[D]. 王红霞.河北农业大学 2006
硕士论文
[1]喀左县野杏引种适应性及优树遗传测定研究[D]. 张悦炀.沈阳农业大学 2017
[2]东北杏种质资源多样性研究[D]. 张皓凯.沈阳农业大学 2017
[3]梨SSR遗传图谱的构建及部分农艺性状的QTL定位分析[D]. 王磊.新疆农业大学 2016
[4]西伯利亚杏优选无性系SSR标记多样性及其与表型性状的关联分析[D]. 张欣.沈阳农业大学 2016
[5]东北野生杏居群遗传多样性及遗传结构分析[D]. 马丽娟.吉林农业大学 2013
[6]利用AFLP分子标记分析山杏的遗传多样性[D]. 王磊.河北农业大学 2008
[7]吉林省野生西伯利亚杏种质资源遗传多样性研究[D]. 芦宁超.吉林农业大学 2008
[8]半干旱地区山杏种质资源调查及遗传特性的研究[D]. 赵桂玲.沈阳农业大学 2003
本文编号：3214626
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