PtrGATA12在毛果杨树次生生长中生物学功能分析
发布时间:2021-10-19 14:17
GATA转录因子是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物光响应调控、细胞分裂素响应以及碳、氮代谢等与次生生长相关的生物学过程中发挥重要作用。目前,对GATA家族的基因只局限于对其家族基因及其编码蛋白基本特性的分析。前期研究中,利用生物信息学手段推测出GATA12参与植物次生生长。本文对毛果杨(GATA12在其次生生长中的生物学功能进行初步的探讨,主要结果如下。1.从毛果杨中克隆到拟南芥GATA12直系同源基因PtrGATA12全长cDNA序列,与毛果杨GATA家族的PtrGATA18.1和PtrGATAT1相似性到86%,将其命名为PtrGATA12。PtrGATA12编码373个氨基酸、分子量为41397.57、等电点(PI)为6.04,且在260-310个氨基酸处具有GATA家族转录因子典型结构域:存在C-X2-C-X17-20-C-X2-C锌指结构域。2.通过农杆菌介导法获得7个过表达PtrG4T4A2转基因毛果杨株系,对其中GATA12表达量最高的3个株系的表型进行了连续观测,结果表明,转基因株系生长正常,表型与野生型无明显差异,但在生长90天时,PtrGATA12转基因毛...
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1木质素合成相关功能基因??Fig.?1-1?The?functional?genes?involved?in?lignin?synthesis??
图2-1毛果杨RNA??Fig.2-1?Total?RNA??
?2?ftrGJU/2的克隆与表达分析???2.3.2?构建?pEASYTM-BIunt-P"?GL47>^?载体以及克隆??将上述RNA进行反转录,以其为模板,以P/rG47^2-F/R为引物,进行克隆,P电泳检??测结果如图2-2A所示。将PCR产物进行胶回收,并与/7£^Sy?-Blunt载体连接,转化大肠??杆菌,菌液检测结果如图2-2B所示,选取正确位置的菌液送到生物公司测序,结果比对与毛??果洋网站数据一致,序列全长为1122?bp,将其命名为乃rGJUW。??图2-2?PW24Z4/2基因CDS全长PCR扩增产物及菌液PCR检测??A:?/VG^472基因编码区全长的PCR扩增产物;B:菌液PCR检测??Fig.2-2?Amplification?of?the?PtrATGAT12?gene?CDS?and?Bacterial?liquid?PCR?of?Pti<}ATA12?recombinant??A:?Amplification?of?the?PtrGATA12?gene?CDS;?B:?Bacterial?liquid?PCR?of?PtrGATA12?recombinant??2.3.3?/VKZ47^72的生物信息学分析??2.3.3.1?PtrGATAU??通过尸/7<^及/2相关基因的理化性质分析发现:蛋白的氧基酸总数位373,??且其分子量高达41808.29,等电点(PI)为6.04,结构式为CmsH^oNsMOwSw,由5643个??原子组成,正、负电荷残基数分别是37与47个,其他的GATA家族成员的情况如下(表2-3)。??表2-3毛果杨G-42:4基因概况??Tab.2-3?
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物次生细胞壁加厚调控研究进展[J]. 黄成,李来庚. 植物生理学报. 2016(01)
[2]植物转录因子分类、预测和数据库构建[J]. 靳进朴,郭安源,何坤,张禾,朱其慧,陈新,高歌,罗静初. 生物技术通报. 2015(11)
[3]香蕉枯萎病菌GATA转录因子基因Fnr1的克隆及序列分析[J]. 漆艳香,张欣,张贺,陆英,蒲金基,喻群芳,谢艺贤. 果树学报. 2014(04)
[4]植物GRAS家族转录因子的研究现状[J]. 李桂英,田玉富,杨成君. 安徽农业科学. 2014(14)
[5]植物bHLH转录因子研究进展[J]. 刘文文,李文学. 生物技术进展. 2013(01)
[6]沙冬青GATA型锌指蛋白基因序列及表达分析[J]. 史军娜,刘美芹,师静,王艳萍,智冠华,陈玉珍,卢存福. 北京林业大学学报. 2011(03)
[7]植物bZIP转录因子的研究进展[J]. 杨颖,高世庆,唐益苗,冶晓芳,王永波,刘美英,赵昌平. 麦类作物学报. 2009(04)
[8]锌指蛋白结构及功能研究进展[J]. 赵楠,赵飞,李玉花. 生物技术通讯. 2009(01)
[9]GATA转录因子研究进展[J]. 史莹华,许梓荣. 生物学通报. 2005(03)
[10]植物细胞次生壁形成的研究进展[J]. 贺新强,崔克明. 植物学通报. 2002(05)
博士论文
[1]杨树PtoVNS11和PtoMYB156转录因子在次生壁形成及类黄酮代谢途径中的功能分析[D]. 杨立.西南大学 2016
[2]杨树木质素合成酶PAL基因的克隆、鉴定及其表达载体的构建[D]. 薛永常.中国林业科学研究院 2001
本文编号:3445029
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1木质素合成相关功能基因??Fig.?1-1?The?functional?genes?involved?in?lignin?synthesis??
图2-1毛果杨RNA??Fig.2-1?Total?RNA??
?2?ftrGJU/2的克隆与表达分析???2.3.2?构建?pEASYTM-BIunt-P"?GL47>^?载体以及克隆??将上述RNA进行反转录,以其为模板,以P/rG47^2-F/R为引物,进行克隆,P电泳检??测结果如图2-2A所示。将PCR产物进行胶回收,并与/7£^Sy?-Blunt载体连接,转化大肠??杆菌,菌液检测结果如图2-2B所示,选取正确位置的菌液送到生物公司测序,结果比对与毛??果洋网站数据一致,序列全长为1122?bp,将其命名为乃rGJUW。??图2-2?PW24Z4/2基因CDS全长PCR扩增产物及菌液PCR检测??A:?/VG^472基因编码区全长的PCR扩增产物;B:菌液PCR检测??Fig.2-2?Amplification?of?the?PtrATGAT12?gene?CDS?and?Bacterial?liquid?PCR?of?Pti<}ATA12?recombinant??A:?Amplification?of?the?PtrGATA12?gene?CDS;?B:?Bacterial?liquid?PCR?of?PtrGATA12?recombinant??2.3.3?/VKZ47^72的生物信息学分析??2.3.3.1?PtrGATAU??通过尸/7<^及/2相关基因的理化性质分析发现:蛋白的氧基酸总数位373,??且其分子量高达41808.29,等电点(PI)为6.04,结构式为CmsH^oNsMOwSw,由5643个??原子组成,正、负电荷残基数分别是37与47个,其他的GATA家族成员的情况如下(表2-3)。??表2-3毛果杨G-42:4基因概况??Tab.2-3?
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物次生细胞壁加厚调控研究进展[J]. 黄成,李来庚. 植物生理学报. 2016(01)
[2]植物转录因子分类、预测和数据库构建[J]. 靳进朴,郭安源,何坤,张禾,朱其慧,陈新,高歌,罗静初. 生物技术通报. 2015(11)
[3]香蕉枯萎病菌GATA转录因子基因Fnr1的克隆及序列分析[J]. 漆艳香,张欣,张贺,陆英,蒲金基,喻群芳,谢艺贤. 果树学报. 2014(04)
[4]植物GRAS家族转录因子的研究现状[J]. 李桂英,田玉富,杨成君. 安徽农业科学. 2014(14)
[5]植物bHLH转录因子研究进展[J]. 刘文文,李文学. 生物技术进展. 2013(01)
[6]沙冬青GATA型锌指蛋白基因序列及表达分析[J]. 史军娜,刘美芹,师静,王艳萍,智冠华,陈玉珍,卢存福. 北京林业大学学报. 2011(03)
[7]植物bZIP转录因子的研究进展[J]. 杨颖,高世庆,唐益苗,冶晓芳,王永波,刘美英,赵昌平. 麦类作物学报. 2009(04)
[8]锌指蛋白结构及功能研究进展[J]. 赵楠,赵飞,李玉花. 生物技术通讯. 2009(01)
[9]GATA转录因子研究进展[J]. 史莹华,许梓荣. 生物学通报. 2005(03)
[10]植物细胞次生壁形成的研究进展[J]. 贺新强,崔克明. 植物学通报. 2002(05)
博士论文
[1]杨树PtoVNS11和PtoMYB156转录因子在次生壁形成及类黄酮代谢途径中的功能分析[D]. 杨立.西南大学 2016
[2]杨树木质素合成酶PAL基因的克隆、鉴定及其表达载体的构建[D]. 薛永常.中国林业科学研究院 2001
本文编号:3445029
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/lylw/3445029.html