黄河流域特有种甘蒙柽柳和柽柳的谱系地理学研究
发布时间：2022-07-03 14:05
百万年来青藏高原的强烈隆升不仅极大地改变了亚洲的地形地貌,黄河的形成和演化也与之密切相关。黄河是中华民族的母亲河,也是影响物种地理分布的环境要素之一,对一些种子具毛或翅,能够通过风力或水力传播的物种、水生植物及河岸带植物的地理分布会产生重要影响。本研究中,我们以黄河流域广泛分布的两种柽柳属植物,柽柳（Tamarix chinensis）和中国特有种甘蒙柽柳（T.austromongolica）为研究材料,通过叶绿体基因组非编码区测序和SSR分子标记,对两种柽柳属植物的亲缘关系、谱系地理和种群遗传结构进行研究,并探讨两种柽柳种群历史动态与过去气候变化和黄河形成的关系,得出以下主要结果:（1）柽柳科3属9种植物的表型和rpl20-5’–rps12、rps16和trnL–trnF序列分析结果表明,柽柳和甘蒙柽柳为单系分支的近缘种。（2）通过21个甘蒙柽柳和24个柽柳群体共计382个个体的叶绿体基因组trn L–trnF、rps16测序和363个个体的核基因组ITS测序,共获得1127条序列。我们对这些序列进行了失配分布、中性检验和扩展贝叶斯天际图分析,发现甘蒙柽柳种群大约在0.15Ma,柽柳...
【文章页数】：96 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
致谢
摘要
第一章 文献综述
1.1 柽柳科植物研究进展
1.1.1 柽柳科系统学研究
1.1.2 柽柳属植物群体遗传学研究
1.2 我国柽柳属植物地理分布概况及影响因素
1.2.1 我国柽柳属植物的地理分布
1.2.2 黄河形成概况
1.2.3 河流对物种分布的影响
1.2.4 更新世气候变化对物种分布的影响
1.3 谱系地理学研究进展
1.3.1 谱系地理学概述
1.3.2 谱系地理学主要研究内容
1.3.3 谱系地理学研究成果
1.4 本研究的目的与意义
1.5 技术路线
第二章 中国柽柳属植物不同种的地理分布
2.1 材料与方法
2.1.1 数据准备
2.1.2 研究方法
2.2 结果及分析
2.2.1 我国柽柳属植物不同种的地理分布
2.2.2 我国各省、自治区的柽柳种数
2.3 小结
第三章 柽柳和甘蒙柽柳亲缘关系分析
3.1 材料与方法
3.1.1 材料采集
3.1.2 形态鉴别和性状编码
3.1.3 基因组DNA的提取和PCR扩增
3.1.4 数据分析
3.2 结果与分析
3.2.1 表型聚类结果
3.2.2 分子系统学分析
3.3 讨论
3.4 小结
第四章 基于叶绿体DNA和核基因组的谱系地理学研究
4.1 材料与方法
4.1.1 采样点及生境
4.1.2 DNA提取、引物筛选和扩增
4.1.3 单倍型和核苷酸多态性统计
4.1.4 种群遗传结构和种群间基因流水平
4.1.5 cpDNA单倍型分歧时间
4.1.6 种群历史动态
4.1.7 种群扩张演化推测
4.2 结果与分析
4.2.1 DNA和扩增产物检测
4.2.2 单倍型和核苷酸多态性统计结果
4.2.3 种群遗传结构和基因流水平
4.2.4 单倍型分歧时间估算结果
4.2.5 种群历史动态分析结果
4.2.6 种群扩张演化方向
4.3 讨论
4.4 小结
第五章 基于SSR的群体遗传多样性与遗传结构
5.1 材料与方法
5.1.1 供试材料
5.1.2 基因组DNA提取、PCR扩增和基因分型
5.1.3 群体遗传多样性分析
5.1.4 遗传距离和地理距离相关性检验
5.1.5 种群遗传结构
5.1.6 Bottleneck检验
5.2 结果与分析
5.2.1 PCR扩增结果
5.2.2 遗传多样性分析结果
5.2.3 种内群体间遗传分化
5.2.4 遗传距离和地理距离相关性检验结果
5.2.5 种群遗传结构
5.2.6 种群Bottleneck检验结果
5.3 讨论
5.4 小结
第六章 柽柳和甘蒙柽柳生态位模型预测
6.1 材料与方法
6.1.1 数据准备
6.1.2 研究方法
6.2 结果及分析
6.2.1 两种柽柳分布点的气候条件
6.2.2 模型预测效果评价
6.2.3 模型预测结果
6.3 讨论
6.4 小结
第七章 结论与展望
7.1 结论
7.2 展望
7.3 创新点
参考文献
英文摘要
读博期间发表论文及参与项目情况
本文编号：3655003
【文章页数】：96 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
致谢
摘要
第一章 文献综述
1.1 柽柳科植物研究进展
1.1.1 柽柳科系统学研究
1.1.2 柽柳属植物群体遗传学研究
1.2 我国柽柳属植物地理分布概况及影响因素
1.2.1 我国柽柳属植物的地理分布
1.2.2 黄河形成概况
1.2.3 河流对物种分布的影响
1.2.4 更新世气候变化对物种分布的影响
1.3 谱系地理学研究进展
1.3.1 谱系地理学概述
1.3.2 谱系地理学主要研究内容
1.3.3 谱系地理学研究成果
1.4 本研究的目的与意义
1.5 技术路线
第二章 中国柽柳属植物不同种的地理分布
2.1 材料与方法
2.1.1 数据准备
2.1.2 研究方法
2.2 结果及分析
2.2.1 我国柽柳属植物不同种的地理分布
2.2.2 我国各省、自治区的柽柳种数
2.3 小结
第三章 柽柳和甘蒙柽柳亲缘关系分析
3.1 材料与方法
3.1.1 材料采集
3.1.2 形态鉴别和性状编码
3.1.3 基因组DNA的提取和PCR扩增
3.1.4 数据分析
3.2 结果与分析
3.2.1 表型聚类结果
3.2.2 分子系统学分析
3.3 讨论
3.4 小结
第四章 基于叶绿体DNA和核基因组的谱系地理学研究
4.1 材料与方法
4.1.1 采样点及生境
4.1.2 DNA提取、引物筛选和扩增
4.1.3 单倍型和核苷酸多态性统计
4.1.4 种群遗传结构和种群间基因流水平
4.1.5 cpDNA单倍型分歧时间
4.1.6 种群历史动态
4.1.7 种群扩张演化推测
4.2 结果与分析
4.2.1 DNA和扩增产物检测
4.2.2 单倍型和核苷酸多态性统计结果
4.2.3 种群遗传结构和基因流水平
4.2.4 单倍型分歧时间估算结果
4.2.5 种群历史动态分析结果
4.2.6 种群扩张演化方向
4.3 讨论
4.4 小结
第五章 基于SSR的群体遗传多样性与遗传结构
5.1 材料与方法
5.1.1 供试材料
5.1.2 基因组DNA提取、PCR扩增和基因分型
5.1.3 群体遗传多样性分析
5.1.4 遗传距离和地理距离相关性检验
5.1.5 种群遗传结构
5.1.6 Bottleneck检验
5.2 结果与分析
5.2.1 PCR扩增结果
5.2.2 遗传多样性分析结果
5.2.3 种内群体间遗传分化
5.2.4 遗传距离和地理距离相关性检验结果
5.2.5 种群遗传结构
5.2.6 种群Bottleneck检验结果
5.3 讨论
5.4 小结
第六章 柽柳和甘蒙柽柳生态位模型预测
6.1 材料与方法
6.1.1 数据准备
6.1.2 研究方法
6.2 结果及分析
6.2.1 两种柽柳分布点的气候条件
6.2.2 模型预测效果评价
6.2.3 模型预测结果
6.3 讨论
6.4 小结
第七章 结论与展望
7.1 结论
7.2 展望
7.3 创新点
参考文献
英文摘要
读博期间发表论文及参与项目情况
本文编号：3655003
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