火炬松萜类合成途径中PT、TPS和P450基因的鉴定与功能分析

发布时间：2024-05-12 16:08

　　萜类化合物是一类在植物、细菌及真菌中普遍存在的天然产物,有重要的生理、生态作用及药用价值。萜类化合物以异戊二烯(C5)为结构单元,根据结构单位数的不同将萜类化合物分为单萜、倍半萜、二萜等。萜类化合物的合成途径复杂,需要多种酶的共同参与及协调作用。异戊烯转移酶催化C5前体生成C10、C15、C20等异戊烯焦磷酸中间体。萜类合成酶作为萜类化合物合成的关键酶,催化这些中间体生成相应的单萜、倍半萜和二萜等。部分萜类物质还需要在细胞色素P450的修饰下生成具有特定功能的萜类化合物。火炬松是美国南方松中最重要的速生针叶用材树种,属于裸子植物松属,具有重要的经济价值与生态作用。由于松属基因组非常大且极其复杂,基因组测序工作是一项非常大的挑战。2014年加州大学科学家带领研究小组完成了火炬松基因组测序工作,在已测序的物种中火炬松的基因组最大。目前萜类合成途径中相关酶的研究大多集中在被子植物中,而裸子植物中研究较少。为了系统的探究裸子植物萜类合成途径相关酶,本研究选取裸子植物代表物种火炬松为研究对象利用生物信息学方法在火炬松全基因组范围内对萜类合成途径相关酶进行预测和鉴定,并对其蛋白特征序列、启动子、基...

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【部分图文】：

图３－１?ＨＭＧＲ基因与不同基因组大小物种间皮尔逊相关性??Ｆｉｇ．３－１?Ｐｅａｒｓｏｎ?ｃｏｒｒｅ?

图３－１?ＨＭＧＲ基因与不同基因组大小物种间皮尔逊相关性??Ｆｉｇ．３－１?Ｐｅａｒｓｏｎ?ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＨＭＧＲ?ｇｅｎｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ａｎｄ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｇｅｎｏｍｅ?ｓｉｚｅ?ｓｐｅｃｉｅｓ注：纵坐标为ＨＭＧＲ基因数，横坐标为不同....

图3-3拟南芥、水稻、番茄、高粱、江南卷柏、小立碗鲜、莱茵衣藻与火炬松异戊烯转移酶进化树

第３章研宂结果与分析??移酶［９７］与火炬松中识别的异戊烯转移酶进行多序列比对，根据多序列比对结果ｍ??ＭＥＧＡ６．０软件中的最大似然法构建系统进化树（如图３－２所示）。结果显示上述８??个物种中的异戊烯转移酶分为３个明Ｓ的进化支，ＦＰＳ家族形成一个独立的进化支，??ＧＦＰＰＳ和....

图3-3火炬松异戊烯转移酶表达谱

３．２．３基于相似性网络对火炬松ＰＴ的功能分析??结构功能联系数据库（Ｔｈｅ?Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ－Ｆｕｎｃｔｉｏｎ?Ｌｉｎｋａｇｅ?Ｄａｔａｂａｓｅ，ＳＦＬＤ，??ｈｔｔｐ?：／／ｓｆｌｄ?．ｒｂｖｉ?．ｕｃｓｆ．?ｅｄｕ／）是羊动管理的分类资源，描述丫功能多样的酿超家族的结??....

图３－７?ＭＥＭＥ分析结果中Ｍｏｔｉｆ种类??Ｆｉｇ．３－７?Ｔｈｅ?Ｍｏｔｉｆ?ｔｙｐｅ?ｆｒｏｍ?ｔｈｅ?ｒｅｓｕｌｔ?ｏｆ?ＭＥＭＥ??

?＾?，??图３－６火炬松ＴＰＳ启动子顺式作用元件分析??Ｆｉｇ．３－６?Ｃｉｓ－ａｃｔｉｎｇ?ｒｅｇｕｌａｔｏｒ?ｅｌｅｍｅｎｔｓ?ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?ｉｎ?ｔｈｅ?ｐｒｏｍｏｔｅｒ?ｒｅｇｉｏｎｓ?ｆｒｏｍ?ＴＰＳ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ｐｉｎｕｓ??ｔａｅｄａ??注：横坐标代....

本文编号：3971565