橡胶树白粉菌分子检测技术的建立及初步评价
发布时间:2024-11-28 22:46
橡胶树白粉病在我国各主要植胶区均有发生,对橡胶树的生长和天然橡胶产量造成严重损失。Oidium heveae B.A.Steinmn是引起橡胶树白粉病的一类专性寄生菌。目前,对橡胶树白粉菌的检测鉴定主要是依据其症状、形态、生理生化反应,分子检测技术报道甚少。本研究建立了关于橡胶树白粉菌PCR、nested-PCR、LAMP分子检测技术,并对其检测效果做了初步评价,目的在于能够检测叶片组织中处于潜育期的橡胶树白粉病菌,为该病害的早期诊断、防治方案的制定以及预测预报模型的搭建提供科学依据。具体结果如下:在ITS序列上设计了数对橡胶树白粉菌引物,经筛选验证特异性均不强。在橡胶树白粉病菌全基因组测序的基础上,经比对分析找到一条橡胶树白粉菌特异性保守序列(专利申请号:201510577343.9),根据该条特异序列,设计特异性引物,对不同检测方法的反应体系均做了优化试验。PCR的最适退火温度为57℃;nested-PCR的最适退火温度也为57℃;LAMP的最适退火温度为63℃,最适反应时间为50min。并且尝试使用PCR来筛选LAMP的最适引物,也将引物的纯化方式从HPLC降低到PAGE,引物纯度...
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:4012883
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【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图14凝胶电泳检测不同溫度对LAMP反应体系的影响??
同的温度梯度,分别放置于不同温度的水浴锅中进行扩增反应,反应结束后,采??用两种检测方法检测。??凝胶电泳检测,结果表明(图14):当温度设置为6PC时有非常微弱的梯状??条带出现,随着温度逐渐升高,条带的的亮度也越来越亮,当温度达到63°C时,??出现的条带最亮,随后再升高温度....
图17?SYBR?Green?I检测不同时间对LAMP反应体系的影响??
??紫外荧光检测,结果表明(图17)?:3?7号PCR管的绿色荧光亮度逐渐増强,??6号管与7号管亮度相同均达到最强,说明反应时间为50?min、60?min时,反应??体系均达到最佳反应状态
图27橡胶树叶片在白粉菌不同接种量下使用常规PCR、nedted?PCR及LAMP在接种后不??同天数时测得的平均检出率的比较??Fig.27?Comparisons?in?average?det?
图27橡胶树叶片在白粉菌不同接种量下使用常规PCR、nedted?PCR及LAMP在接种后不??同天数时测得的平均检出率的比较??
图28不同接种量与病情指数之间的关系??
图28不同接种量与病情指数之间的关系??Fig.?28?The?relationship?between?amount?of?inoculum?and?disease?index??3.?6便携式孢子捕捉器玻片上DNA的提取??
本文编号:4012883
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