广东省主要红树林植物DNA条形码评价

发布时间：2024-12-27 00:43

　　 为评估DNA条形码对鉴定红树林植物的通用性和有效性,在广东红树林分布区域共计采集红树林植物16科22属23种,共144个样品,并进行DNA条形码测序。结果表明:选择的rbcL、matK和trnH-psbA 3个DNA片段的PCR扩增成功率分别为100%、80.29%±8.49%、99.38%±1.25%。测序成果率最高为rbcL 100%,trnH-psbA次之94.57%±5.06%,matK最低75.04%±6.26%。表明rbcL和trnH-psbA片段在红树林群落中都具有较好的通用性。应用BLAST和NJ Tree两种方法计算红树植物的物种识别率。BLAST结果表明,单片段中trnH-psbA的物种识别率最高,为84.48%±12.09%,rbcL次之,matK最低。NJ Tree分析显示单片段中rbcL的物种识别率最高,为66.65%±17.35%;trnH-psbA片段次之,matK片段最低。两张分析方法都显示多个片段组合使用时,rbcL或trnH-psbA是提高物种平均识别率的主要片段。利用单片段rbcL即可获得平均节点支持率最高的红树植物系统发育树,且能准确区分不同树种...

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图1 运用rbcL片段构建的广东省红树林植物群落系统发育树

在本研究中,核心条形码中的rbcL片段在红树植物DNA样品中的PCR扩增和测序成功率都达到了100%,获得序列条带信息、质量良好。与Kressetal.[21]研究相比、表现出更高的通用性和成功率。与裴男才[44]研究同处于热带、亚热带的森林植物群落的测序成功率相比(90%-....

本文编号：4020876