三七根皂苷含量差异蛋白质组研究
发布时间:2021-09-25 15:23
三七(Panax notoginseng(Burk.)F.H.Chen)是一种五加科(Araliaceae)人参属(Panax)的多年生草本药用植物,三萜类人参皂苷是其重要的药用活性成分,目前人参皂苷生物合成与调控尚未完全清楚。本论文以皂苷含量差异的两组三七样品为材料,使用nanoLC-MS/MS液质联用技术进行蛋白质组学研究,以期获得三七中人参皂苷生物合成调控的新知识。主要研究结果如下:1.应用高相液相色谱测定100株三七根5种主要的皂苷(人参皂苷Rg1、Rb1、Re、Rd及三七皂苷R1)含量,上述5种皂苷以及其累积含量依次为0.22%±0.03至6.07%±0.28、1.07%±0.06至8.58%±0.58、0至3.25%±0.23、1.27%±0.06至10.74%±0.66、0.32%±0.01至2.33%±0.26;最高最低分别相差27.5、8.01、3.25、8.45、7.28倍;分别选择皂苷含量最高(H)和最低(L)的9株样品混合,分成三份为后续蛋白组研究材料。2.提取样品蛋白,应用基于nanoLC-MS/MS液质联用串联质谱的蛋白组学技术分析比较两组样品蛋白表达差异。...
【文章来源】:云南农业大学云南省
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略语表
1. 前言
1.1 三七及其皂苷种类
1.2 三七人参皂苷含量差异
1.3 三七的人参皂苷合成途径
1.3.1 甲羟戊酸途径
1.3.2 磷酸甲基赤藓糖醇途径
1.3.3 达玛烷型人参皂苷的形成
1.3.4 细胞色素P450与糖基转移酶
1.4 蛋白组学技术及其应用
1.5 本研究目的意义
2. 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 供试材料
2.1.2 主要仪器
2.1.3 主要试剂
2.2 试验方法
2.2.1 三七中皂苷含量的测定
2.2.2 蛋白质的提取
2.2.3 蛋白质的酶解与TMT标记
2.2.4 高PH反向分离
2.2.5 低PH NANOLC-MS/MS分析
2.2.6 蛋白质数据搜索
2.2.7 蛋白质鉴定标准
2.2.8 定量数据分析
2.2.9 生物信息学分析
3. 结果与分析
3.1 三七根中主要皂苷含量
3.2 总蛋白质组分析
3.2.1 液相数据质控
3.2.2 质谱准确度评估
3.2.3 肽段鉴定得分分布
3.2.4 肽段长度分布图
3.2.5 总蛋白质鉴定
3.2.6 总蛋白质生物信息学分析
3.3 差异蛋白质组分析
3.3.1 标记强度分布及定量权重
3.3.2 归一化计算及其质控
3.3.3 蛋白质定量信号分布
3.3.4 差异蛋白组
3.3.5 差异蛋白分布
3.3.6 蛋白差异表达
3.3.7 蛋白质数据生物信息学分析
3.4 差异蛋白与人参皂苷含量间的相关性分析
4. 讨论
4.1 皂苷含量差异与蛋白质质谱鉴定
4.2 三七蛋白质组
4.3 蛋白质的生物信息学分析
4.4 人参皂苷合成相关基因、防御反应蛋白及抗氧化酶
5. 结论
参考文献
附录
个人情况
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]砷胁迫对三七皂苷和黄酮含量、关键酶活性的影响及其蛋白质组分析[J]. 祖艳群,梅馨月,闵强,苏源,马妮,冯光泉,李元. 应用生态学报. 2016(12)
[2]Cloning and Bioinformatic Analysis of HMGS and HMGR Genes from Panax notoginseng[J]. Wan-jing Liu,Hai-zhou Lv,Liu He,Jing-yuan Song,Chao Sun,Hong-mei Luo,Shi-lin Chen. Chinese Herbal Medicines. 2016(04)
[3]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析[J]. 张海晨,李彩霞,王元忠,张晓东. 生物技术通报. 2016(04)
[4]冬凌草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因克隆与表达分析[J]. 朱畇昊,苏秀红,董诚明,陈随清,邵远洋,张风波. 广西植物. 2016(12)
[5]A rapid method for chemical fingerprint analysis of Panax notoginseng powders by ultra performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry[J]. LIU Peng,YU He-Shui,ZHANG Li-Juan,SONG Xin-Bo,KANG Li-Ping,LIU Jing-Yuan,ZHANG Jie,CAO Man,YU Kate,KANG Ting-Guo,MA Bai-Ping. Chinese Journal of Natural Medicines. 2015(06)
[6]基于质谱的定量蛋白质组学策略和方法研究进展[J]. 常乘,朱云平. 中国科学:生命科学. 2015(05)
[7]紫、绿三七的总花色苷和总皂苷含量及皂苷单体组成[J]. 赵昶灵,杨生超,陈中坚,沈勇,魏富刚,王武,龙庭菊. 中药材. 2014(10)
[8]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因GrDXR的克隆、序列分析与原核表达[J]. 张晓东,赵静,李彩霞,李涛,王元忠. 中草药. 2014(16)
[9]鱼腥草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶1基因克隆与表达分析[J]. 魏麟,伍贤进,李胜华,刘胜贵,唐玉莲,贺安娜,王丹,宁鹏飞,李昭君. 中草药. 2014(11)
[10]三七种子质量分级标准的研究[J]. 韩春艳,张蕊蕊,孙卫邦. 种子. 2014(04)
本文编号:3409975
【文章来源】:云南农业大学云南省
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略语表
1. 前言
1.1 三七及其皂苷种类
1.2 三七人参皂苷含量差异
1.3 三七的人参皂苷合成途径
1.3.1 甲羟戊酸途径
1.3.2 磷酸甲基赤藓糖醇途径
1.3.3 达玛烷型人参皂苷的形成
1.3.4 细胞色素P450与糖基转移酶
1.4 蛋白组学技术及其应用
1.5 本研究目的意义
2. 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 供试材料
2.1.2 主要仪器
2.1.3 主要试剂
2.2 试验方法
2.2.1 三七中皂苷含量的测定
2.2.2 蛋白质的提取
2.2.3 蛋白质的酶解与TMT标记
2.2.4 高PH反向分离
2.2.5 低PH NANOLC-MS/MS分析
2.2.6 蛋白质数据搜索
2.2.7 蛋白质鉴定标准
2.2.8 定量数据分析
2.2.9 生物信息学分析
3. 结果与分析
3.1 三七根中主要皂苷含量
3.2 总蛋白质组分析
3.2.1 液相数据质控
3.2.2 质谱准确度评估
3.2.3 肽段鉴定得分分布
3.2.4 肽段长度分布图
3.2.5 总蛋白质鉴定
3.2.6 总蛋白质生物信息学分析
3.3 差异蛋白质组分析
3.3.1 标记强度分布及定量权重
3.3.2 归一化计算及其质控
3.3.3 蛋白质定量信号分布
3.3.4 差异蛋白组
3.3.5 差异蛋白分布
3.3.6 蛋白差异表达
3.3.7 蛋白质数据生物信息学分析
3.4 差异蛋白与人参皂苷含量间的相关性分析
4. 讨论
4.1 皂苷含量差异与蛋白质质谱鉴定
4.2 三七蛋白质组
4.3 蛋白质的生物信息学分析
4.4 人参皂苷合成相关基因、防御反应蛋白及抗氧化酶
5. 结论
参考文献
附录
个人情况
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]砷胁迫对三七皂苷和黄酮含量、关键酶活性的影响及其蛋白质组分析[J]. 祖艳群,梅馨月,闵强,苏源,马妮,冯光泉,李元. 应用生态学报. 2016(12)
[2]Cloning and Bioinformatic Analysis of HMGS and HMGR Genes from Panax notoginseng[J]. Wan-jing Liu,Hai-zhou Lv,Liu He,Jing-yuan Song,Chao Sun,Hong-mei Luo,Shi-lin Chen. Chinese Herbal Medicines. 2016(04)
[3]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析[J]. 张海晨,李彩霞,王元忠,张晓东. 生物技术通报. 2016(04)
[4]冬凌草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因克隆与表达分析[J]. 朱畇昊,苏秀红,董诚明,陈随清,邵远洋,张风波. 广西植物. 2016(12)
[5]A rapid method for chemical fingerprint analysis of Panax notoginseng powders by ultra performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry[J]. LIU Peng,YU He-Shui,ZHANG Li-Juan,SONG Xin-Bo,KANG Li-Ping,LIU Jing-Yuan,ZHANG Jie,CAO Man,YU Kate,KANG Ting-Guo,MA Bai-Ping. Chinese Journal of Natural Medicines. 2015(06)
[6]基于质谱的定量蛋白质组学策略和方法研究进展[J]. 常乘,朱云平. 中国科学:生命科学. 2015(05)
[7]紫、绿三七的总花色苷和总皂苷含量及皂苷单体组成[J]. 赵昶灵,杨生超,陈中坚,沈勇,魏富刚,王武,龙庭菊. 中药材. 2014(10)
[8]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因GrDXR的克隆、序列分析与原核表达[J]. 张晓东,赵静,李彩霞,李涛,王元忠. 中草药. 2014(16)
[9]鱼腥草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶1基因克隆与表达分析[J]. 魏麟,伍贤进,李胜华,刘胜贵,唐玉莲,贺安娜,王丹,宁鹏飞,李昭君. 中草药. 2014(11)
[10]三七种子质量分级标准的研究[J]. 韩春艳,张蕊蕊,孙卫邦. 种子. 2014(04)
本文编号:3409975
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