麦类作物基因组结构解析与多倍化过程重构

发布时间：2024-04-03 01:51

　　小麦与其它禾本科植物在进化中经历了反复的多倍化事件,而小麦作为六倍体由祖先的A,B,D基因组杂交构成,结构与构成经历了复杂的变化。目前没有一个研究清晰的展示小麦与古多倍化事件相关联的基因组结构变化过程,解析与其他禾本科植物基因组同源进化关系。准确解析这一复杂的基因组,将有助于更好了解其基因组构成和功能进化。课题在先前对8个禾本科植物的研究基础上,着重对麦类作物,尤其是小麦进行分析,构建了三个外类群植物(水稻、二穗短柄草、菠萝)和四个麦类作物(粗山羊草、乌拉尔图小麦、小麦、大麦)之间与多倍化相关联的全基因组共线性比对列表,获得了禾本科植物共同祖先物种全基因组加倍及各物种分化过程中所产生的旁系和直系同源染色体片段,并进行区分确定由不同加倍事件产生的基因组内的重复基因,在小麦中由禾本科共同祖先全基因组加倍产生的有共线性支持的基因共有142个。在与其他物种相比,其三个子基因组之间和各个子基因组内存在的同源共线性基因要少得多。子基因组A、B、D中分别存在48、78、30个旁系同源共线性片段,包含有217,225和89个同源共线性基因。这表明小麦子基因组间发生了部分同源的重组,表明发生基因丢失,基...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1课题涉及物种的系统进化关系

图1课题涉及物种的系统进化关系Fig.1Phylogeneticrelationshipsofselectedspeciesinthisproject2.2研究方法

图2水稻和二穗短柄草基因组间同源性点阵图

图2水稻和二穗短柄草基因组间同源性点阵图Fig.2ThehomologydotplotbetweenthegenomeofO.sativaandB.distachyon注：图中展示的是水稻和二穗短柄草基因组同源共线信息。横轴由左向右依次排列的是水稻基因组的....

图3水稻和大麦基因组间同源性点阵图

图3水稻和大麦基因组间同源性点阵图Fig.3ThehomologydotplotbetweenthegenomeofO.sativaandH.vulgare在图3中，以水稻作为参考基因组与麦类作物中的大麦（2n=14）进行基因组间同源性的比较分析，两者....

图4粗山羊草和小麦基因组间同源性点阵图

图4粗山羊草和小麦基因组间同源性点阵图Fig.4ThehomologydotplotbetweenthegenomeofA.tauschiiandT.aestivum小麦（6n=42）是由乌拉尔图小麦（2n=14）、小麦B和粗山羊草（2n=14）杂交得....

本文编号：3946534