利用双向回交导入系和种质资源剖析水稻品质相关性状的遗传基础
发布时间:2024-06-29 01:49
本试验以优质晚粳品种秀水09和抗旱籼稻品系IR2061为亲本构建的高代双向回交导入系(introgression lines,ILs)群体和重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体为材料,利用高密度的SNP标记对双向回交导入系的遗传结构进行分析,同时挖掘控制水稻外观品质、碾磨品质、蒸煮和食用品质以及营养品质等品质相关性状的主效QTL,分析品质相关性状QTL表达的遗传背景和环境互作效应,鉴定遗传背景特异性低且具有环境稳定性的QTL,为水稻品质分子育种提供条件。与此同时,本试验利用258份材料种质资源对水稻品质相关性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)分析,结合基于基因的关联分析和单倍型分析,确定重要QTL的候选基因,为后续进一步转基因验证、挖掘水稻品质相关性状有利等位基因提供便利。主要研究结果如下:1.双向导入系群体遗传结构分析利用25,206个SNP标记对秀水09背景的高代回交导入系(XS09-ILs)和IR2061背景的高代回交导入系(IR2061-ILs)进行遗传结构分析,发现双向导入系中...
【文章页数】:100 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本文编号:3996979
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图2.155K芯片SNP位点筛选流程
嘉兴市农业科学研究院选育的优质晚粳品种,IR2061为国以秀水09为母本与IR2061杂交得到杂交种F1,F1同时与得到两套BC2F1,再经过多代自交至稳定,最终获得23709-ILs)和240份IR2061背景的高代回交导入系(IR2061获得235....
图2.2双向导入系和重组自交系群体秀水09基因组所占比例的频率分布图
院博士学位论文第二章双向导入系群体遗传导入系供体导入频率及X2检验偏分离入系群体大部分恢复了轮回亲本的基因型,其中在237份XS09-ILs中,供体入频率平均为8.10%,变幅为2.16%~27.71%,而在240份IR2061-ILs中,导入频率平均为....
图4.322,488个SNP标记的最小等位基因频率分布图
Table4.1DistributionsofSNPmarkersonchromosomes染色体标记数量基因组大小(Mb)标记间隔(kb)ChrMarkerNo.Size(Mb)Spacing(kb)Chr12,78343.215.5Chr....
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