棉花早熟性状相关基因的定位与鉴定
发布时间:2024-10-30 21:37
作物的早熟性是一个复杂的数量性状,而早花是陆地棉早熟性的一个重要标志。本研究采用早熟品种鲁棉研19号和中熟品种鲁棉研37号进行杂交,构建了F2和F2:3分离群体,对现蕾和开花性状进行了分析,并从F2群体中选择极早和极晚开花的单株分别组建了两个极端池,采用高通量测序技术对亲本和两个极端池进行全基因组重测序,利用鉴定筛选的SNP和In Del标记及已报道的早熟相关SSR标记构建了遗传图谱,对早熟性相关QTLs进行了精细定位,进一步确定了相关候选基因。主要结论如下:1、正常春播条件下,鲁棉研19号的开花时间比鲁棉研37号提前9-10d,播种至现蕾和播种至开花天数在F2:3分离群体呈正态分布,表明棉花早熟性状是由多基因控制的数量性状。2、采用BSA-seq方法对鲁棉研19号、鲁棉研37号以及早花池和晚花池进行了重测序,每个样本的检测指标均为Q20≥92.55%、Q30≥85.22%,GC含量分布正常。以鲁棉研37号为参考亲本,对早花池和晚花池的测序结果进行比对,筛选SNP、InDel,运用QTL-seq方法分...
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:4008514
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图2.1BSA测序原理Fig2.1TheprincipleofBSAsequencing图2.2建库测序流程Fig2.2Libraryconstructionandsequencingprocess
19图2.2建库测序流程Fig2.2Libraryconstructionandsequencingprocess.1.5.1QTL-seq分析作为一种重要的分析方法,BSA借助于高通量的发展逐步形成一种新的方:QTL-seq[118]。QTL-seq是一种....
选择亲本P1作为参考亲本,计算两个子代在P-index(即SNP的频率)。SNP-index计算方法如图2.1所相比较与其相同的记为0,不同的记为1。制两个极端池的SNP-index图:将计算出早花池和别以1Mb为单位窗口,以滑动窗口大小为1kb来计....
24图2.4F2和F2:3群体单株现蕾和开花天数的次数分布Fig2.4FrequencydistributionofsquaringandfloweringdaysinF2andF2:3generation注:a:F2群体的播种-开花(FT)的次数分....
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