玉米骨干自交系京2416杂种优势及遗传重组解析

发布时间：2024-11-03 03:12

　　【研究背景】玉米骨干自交系京2416是以(京24×5237)×京24构建基础选系群体,利用高大严及同群优系聚合等选系技术选育的优良黄改群自交系。以其为父本育成的审定品种已有20多个,其中代表性品种京农科728,突破了黄淮海夏玉米籽粒机收技术瓶颈,成为中国首批通过国家审定的机收籽粒品种。通过分析京2416与X群种质的杂种优势,及其形成过程中的重组事件和黄早四基因组片段传递规律,解析京2416形成的遗传机制,以期为黄改系的进一步遗传改良提供参考;【材料与方法】选用黄早四、京2416及其2个选系亲本(京24和5237)为材料,与5份X群代表性自交系根据NCII遗传设计组配杂交组合,利用F1产量相关性状单穗粒重的中亲优势、超高亲优势值和配合力效应值评估4份黄改系的杂种优势。对4份黄改系及5份X群自交系进行测序深度约为18×的全基因组重测序,用BWA、GATK等软件进行序列比对和变异检测,基于获得的SNP和InDel标记信息,利用GCTA和Treebest软件进行主成分分析和系统发生树构建,同源传递片段(identity-by-descent,IBD)使用IBDseq软件识别;【结果与分析】通过比...

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【部分图文】：

高通量测序为解析骨干亲本形成的遗传基础提供了丰富的数据信息。高密度SNP和InDel分子标记的发掘和已知的系谱关系可以高分辨率地解析骨干自交系京2416形成的遗传基础。京2416的选育过程：首先将京24与5237杂交，再与京24回交1次，构建基础选系群体，按照高大严育种技术（高....

图19份自交系的主成分分析（A）和系统发生树（B)2.4黄早四到京2416基因组片段传递

京2416保留了黄早四传递下来的很多优势性状，例如抗病抗逆性强、适宜区域广、早熟脱水快、自身产量及配合力高等，这些优势性状通过黄早四的IBD基因组片段进行传递。为了确定黄早四传递到京2416的IBD基因组片段，利用IBD方法对黄早四、京2416及其2个选系亲本京24和5237的全....

本文编号：4010589