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鲤疱疹病毒2型ddPCR检测方法的建立及其抗体库的筛选

发布时间:2020-08-26 02:01
【摘要】:鲤疱疹病毒2型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2),是一种高致病性双链DNA病毒。因该病毒是第2个分离自鲤科鱼类的疱疹病毒,国际病毒系统分类与命名委员会(ICTV)将其命名为鲤疱疹病毒2型,该病毒属于鱼疱疹病毒科(Alloherpesviridae),鲤疱疹病毒属(Cyprinivirus)。本研究建立了定量检测CyHV-2的微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)方法,并且与实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)方法就其灵敏性、特异性、重复性和临床样品检测作了比较分析。结果表明,与RT-qPCR相比,ddPCR具有相同的特异性,其灵敏性比RT-qPCR方法低20倍。在定量CyHV-2 DNA时,ddPCR(R2=0.994)和RT-qPCR(R2=0.994)均表现出良好的线性关系,并且这两种检测方法的定量值呈正相关(R2=0.989)。但是,在定量检测相同稀释度CyHV-2 DNA时,RT-qPCR的定量值始终比ddPCR高10倍。ddPCR的组内和组间重复变异系数(CV)各为0.59%-11.26%和6.55%-23.21%,而RT-qPCR各为16.57%-27.56%和22.31%-56.73%,说明ddPCR具有更好的稳定性。在临床样品定量检测时,ddPCR的检出率稍高于RT-qPCR。本研究建立的ddPCR能够准确定量检测CyHV-2,将为CyHV-2相关研究提供有益参考。为获得可检测CyHV-2的单链抗体,本研究利用噬菌体抗体库技术,经过4轮淘选富集后获得2株抗CyHV-2单链抗体(scFv)。Dot blot结果分析表明,2个可溶性单链抗体均能特异性识别CyHV-2;Western blot结果显示,2个可溶性单链抗体的分子量约为27 kDa。由免疫组化试验结果可知2个可溶性单链抗体均能检测到CyHV-2在肝组织和鳃组织中的分布。ELISA试验结果表明可溶性单链抗体均不与CyHV-3、EHNV、CCV、ISNV发生交叉反应。本研究期望能为CyHV-2的快速检测提供借鉴,并为CyHV-2检测试剂盒的研发奠定基础。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S941.4

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本文编号:2804514

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