草鱼肿瘤坏死因子配体15（TNFSF15/TL1A）及其受体25（TNFRSF25）的进化与表达分析

发布时间：2021-01-01 21:05

　　肿瘤坏死因子配体（TNFSF）和受体（TNFRSF）超家族在机体免疫炎症,增殖分化和造血功能中发挥着多种作用。迄今为止,在人类中已经鉴定出19种配体超家族和29种受体超家族成员;在硬骨鱼中先后鉴定出14种配体超家族成员。TNFSF15/TL1A基因是在2002年由Migone等人首次报道,是由四个外显子和三个内含子组成。TNFRSF25（又名DR3、Wsl-1、TR3、Apo-3、TRAMP、TNFRSF12）是在1996年由Kitson等人在人类基因组中挖掘与TNFR1同源并含有死亡结构域的序列时被首次报道。草鱼在我国养殖历史悠久,是最重要的经济鱼类。然而,我国养殖产业一直备受草鱼疾病的困扰。研究草鱼免疫炎症无论是对实际生产养殖还是对免疫理论的发展都有重要意义。本研究克隆了草鱼TNFSF15/TL1A及TNFRSF25基因,分析其序列。并用柱状黄杆菌（F.cloumnare）和草鱼出血病病毒（GCRV）对健康的草鱼进行感染,检测TNFSF15/TL1A及TNFRSF25基因在草鱼不同组织中的表达情况。利用大肠杆菌原核表达技术表达并纯化了目的基因的重组蛋白。取得了以下成果:1.分别克隆... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：101 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

TNFSF15/TL1A和TNFRSF25结合诱导两种不同的信号转导途径Fig.1-1LigationofTNFSF15/TL1AtoTNFRSF25activatestwodistinctdownstreamsignaling

237) 的TNF家族同源结构域THD。如图2-1中分别用黄色高亮和灰色阴影标出TM和THD区域。Disphos预测CiTNFSF15/TL1A蛋白序列中存在一个丝氨酸磷酸化位点 (phosphorylatedserines site) 位于Ser82，在图2-1中用红色标记。图 2-1 草鱼 TNFSF15/TL1A 核苷酸和氨基酸序列分析Fig 2-1 Nucleotide and amino acid cequence analysis of CiTNFSF15/TL1A.在NCBI及Ensembl中搜索人、鼠、鸡和斑马鱼的TNFSF15/TL1A及电鳗、虹鳟TNFSF15-like (TNFSF15L) 的基因序列并进行氨基酸序列比对。表 2-1 显示CiTNFSF15/TL1A 与 人 、 鸡 和 小 鼠 的 TNFSF15/TL1A 蛋 白 序 列 一 致 性 较 低(18%-21%)。同样CiTNFSF15/TL1A与电鳗和虹鳟的TNFSF15L蛋白的序列一致性也低于30%。而斑马鱼TNFSF15/TL1A与草鱼TNFSF15/TL1A蛋白序列一致性可达53.3%。图2-2的氨基酸多序列比对结果同样清晰的证明，CiTNFSF15/TL1A蛋白序

同样CiTNFSF15/TL1A与电鳗和虹鳟的TNFSF15L蛋白的序列一致性也低于30%。而斑马鱼TNFSF15/TL1A与草鱼TNFSF15/TL1A蛋白序列一致性可达53.3%。图2-2的氨基酸多序列比对结果同样清晰的证明，CiTNFSF15/TL1A蛋白序

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]长牡蛎肿瘤坏死因子（CgTNF-1）免疫调节机制的初步研究[D]. 孙颖.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2014



本文编号：2951992