日本鳗鲡Caspase6基因的克隆和表达分析
发布时间:2021-02-04 17:53
本研究首次获得了日本鳗鲡(Anguilla japonica)Caspase6基因cDNA全长序列,命名为AjCasp6(GenBank号KJ726738)。该基因全长为1524 bp,其中开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为903 bp,编码300个氨基酸。其蛋白三维空间结构图与人类Caspase6十分相似,具有Caspase家族典型的CASc结构域,包括一个P20结构域(54aa-178 aa)和一个P10结构域(204 aa-298 aa),半胱氨酸活性位点“KPKIFIFQACRG”及组氨酸活性位点“HADADCFVCVFLSHG”。同源性分析显示AjCasp6氨基酸序列与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)相似性最高,为75%,与其他鱼类相似性在61%75%之间。系统发育树表明,AjCasp6与其他鱼类Caspase6聚为一支,而哺乳类以及两栖类Caspase6聚为一支。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明:AjCasp6基因在日本鳗鲡各组织中均有表达,其中鳃中表达量最高,肠、肝脏、肾脏、皮肤和血细胞中也有较高表...
【文章来源】:集美大学福建省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
RACE-PCR产物琼脂糖凝胶电泳结果
日本鳗第 3 章 结果组织总 RNA 的提取结果检测 RNA 的浓度及纯度,结果表明明 RNA 样品的纯度较高。总 RNA 样且完整的 28 S 和 18 S rRNA 电泳条量良好,可用于后续试验。
学硕士学位论文 日本鳗鲡 Caspase6 基因的克隆和表 AjCasp6 基因在日本鳗鲡各组织中表达分析.1 AjCasp6 基因在天然状态下的组织表达分析光定量 PCR 检测结果表明:在天然状况下,日本鳗鲡 Caspase6 在各组织中表达水平差异较大。其中鳃中的表达量最高,肠、肝脏、肾脏、皮肤和血细的表达水平,但在心脏和肌肉中表达量相对较低(图 3-7)。其中,**表示 鳃中表达存在极显著性差异(P<0.01);*表示 AjCasp6 基因在肠和皮肤组织异(P<0.05)。AjCasp6 基因在体内和体外表达分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]团头鲂(Megahbrama amblycephala) Caspase 9基因全长cDNA的克隆及在氨氮胁迫下的表达分析[J]. 章琼,孙盛明,李冰,蒋高中,朱健,戈贤平. 渔业科学进展. 2016(01)
[2]欧洲鳗鲡Anguilla anguilla尾鳍细胞系的建立以及不同生长因子对其增殖的影响[J]. 庄道华,陈芸,张子平,王艺磊. 中国细胞生物学学报. 2013(06)
[3]海水鱼类细胞系建立、鉴定及应用[J]. 魏云波,刘书花,张瑞凌,李福伟,王兴民. 科技创新导报. 2011(31)
[4]鳗鲡细菌性疾病的研究概况[J]. 郭松林. 科学养鱼. 2011(07)
[5]大黄鱼鳍细胞系的建立及久效磷对其毒性作用的研究[J]. 樊廷俊,孙爱,杨秀霞,姜国建,徐晓辉,郭雪阳. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2010(12)
[6]条斑星鲽连续性鳍细胞系的建立与鉴定[J]. 樊廷俊,徐晓辉,姜国建,郭雪阳,孙爱,徐彬. 山东大学学报(理学版). 2010(05)
[7]Caspase Family Proteases and Apoptosis[J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[8]人重构型caspase-6基因在Hep-2细胞中的表达[J]. 许彦鸣,王立锋,刘大庆,张瑞,王成济,杨安钢. 第四军医大学学报. 2003(24)
[9]caspase-6基因诱导成骨肉瘤细胞凋亡[J]. 丁勇,范清宇,崔大祥,张殿忠,殷剑宁. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2002(04)
[10]Caspase-6诱导肾癌细胞株GRC-1细胞凋亡的研究[J]. 刘贺亮,崔大祥,陈勇,王禾,陈宝琦,邵国兴,陈长生. 疾病控制杂志. 2002(03)
博士论文
[1]大黄鱼(Pseudosciaena crocea)三种组织细胞系的建立、鉴定及其应用的初步研究[D]. 孙爱.中国海洋大学 2010
[2]几种重要海水养殖鱼类细胞系的建立、鉴定及应用[D]. 任国诚.中国海洋大学 2007
硕士论文
[1]大黄鱼HSP及caspase家族部分基因对温度胁迫的响应[D]. 杨启莲.集美大学 2011
本文编号:3018705
【文章来源】:集美大学福建省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
RACE-PCR产物琼脂糖凝胶电泳结果
日本鳗第 3 章 结果组织总 RNA 的提取结果检测 RNA 的浓度及纯度,结果表明明 RNA 样品的纯度较高。总 RNA 样且完整的 28 S 和 18 S rRNA 电泳条量良好,可用于后续试验。
学硕士学位论文 日本鳗鲡 Caspase6 基因的克隆和表 AjCasp6 基因在日本鳗鲡各组织中表达分析.1 AjCasp6 基因在天然状态下的组织表达分析光定量 PCR 检测结果表明:在天然状况下,日本鳗鲡 Caspase6 在各组织中表达水平差异较大。其中鳃中的表达量最高,肠、肝脏、肾脏、皮肤和血细的表达水平,但在心脏和肌肉中表达量相对较低(图 3-7)。其中,**表示 鳃中表达存在极显著性差异(P<0.01);*表示 AjCasp6 基因在肠和皮肤组织异(P<0.05)。AjCasp6 基因在体内和体外表达分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]团头鲂(Megahbrama amblycephala) Caspase 9基因全长cDNA的克隆及在氨氮胁迫下的表达分析[J]. 章琼,孙盛明,李冰,蒋高中,朱健,戈贤平. 渔业科学进展. 2016(01)
[2]欧洲鳗鲡Anguilla anguilla尾鳍细胞系的建立以及不同生长因子对其增殖的影响[J]. 庄道华,陈芸,张子平,王艺磊. 中国细胞生物学学报. 2013(06)
[3]海水鱼类细胞系建立、鉴定及应用[J]. 魏云波,刘书花,张瑞凌,李福伟,王兴民. 科技创新导报. 2011(31)
[4]鳗鲡细菌性疾病的研究概况[J]. 郭松林. 科学养鱼. 2011(07)
[5]大黄鱼鳍细胞系的建立及久效磷对其毒性作用的研究[J]. 樊廷俊,孙爱,杨秀霞,姜国建,徐晓辉,郭雪阳. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2010(12)
[6]条斑星鲽连续性鳍细胞系的建立与鉴定[J]. 樊廷俊,徐晓辉,姜国建,郭雪阳,孙爱,徐彬. 山东大学学报(理学版). 2010(05)
[7]Caspase Family Proteases and Apoptosis[J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[8]人重构型caspase-6基因在Hep-2细胞中的表达[J]. 许彦鸣,王立锋,刘大庆,张瑞,王成济,杨安钢. 第四军医大学学报. 2003(24)
[9]caspase-6基因诱导成骨肉瘤细胞凋亡[J]. 丁勇,范清宇,崔大祥,张殿忠,殷剑宁. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2002(04)
[10]Caspase-6诱导肾癌细胞株GRC-1细胞凋亡的研究[J]. 刘贺亮,崔大祥,陈勇,王禾,陈宝琦,邵国兴,陈长生. 疾病控制杂志. 2002(03)
博士论文
[1]大黄鱼(Pseudosciaena crocea)三种组织细胞系的建立、鉴定及其应用的初步研究[D]. 孙爱.中国海洋大学 2010
[2]几种重要海水养殖鱼类细胞系的建立、鉴定及应用[D]. 任国诚.中国海洋大学 2007
硕士论文
[1]大黄鱼HSP及caspase家族部分基因对温度胁迫的响应[D]. 杨启莲.集美大学 2011
本文编号:3018705
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3018705.html