卵形鲳鲹分子标记的筛选与应用
发布时间：2021-03-08 18:03
卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）具有生长速度快，食性简单，肉质鲜美，容易饲养等一系列优点，已经成为我国华南沿海地区一种重要的海水养殖品种。由于目前卵形鲳鲹未经过人工选育，在繁、育过程中随机挑取亲本可能导致近交衰退，因此急需评价卵形鲳鲹育种群体的遗传多样性水平和遗传结构，为在遗传选育中亲本选择和配对策略的制定提供参考依据。本研究采用FIASCO法构建了卵形鲳鲹微卫星（Microsatellite, SSR）富集文库，测序筛选到21个多态性微卫星位点，利用筛选的多态性微卫星位点评价了广东大亚湾和海南三亚两个育种群体遗传多样性水平和种群遗传结构，为育种群体亲本配对策略的制定提供了依据；测序获得了卵形鲳鲹线粒体基因组DNA，利用卵形鲳鲹线粒体基因组DNA序列与从GenBank数据库中下载的6种鲹科鱼类线粒体基因组DNA序列进行了系统发育关系的研究；由于从形态上很难区分卵形鲳鲹雌雄个体，给遗传育种过程中雌雄亲本的配对带来了很大的困难，为了建立雌雄个体的分子识别技术，本研究尝试利用AFLP和RAPD技术对卵形鲳鲹雌雄个体进行了全基因组扫描，以期筛选雌雄个体特异的分子标记。本研究取得...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：92 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
卵形鲳鲹Fig.1-1Trachinotusovatus
[26]，其中FIASCO法是目前应用最为普遍的一种方法，其基本原理如图1-2：是利用被生物素标记的探针与含有微卫星序列的片段进行杂交，然后通过磁珠上包被的链霉亲和素（Streptavidin）与探针上的生物素结合，通过磁力将所需的微卫星序列分离出来，然后利用磁力将磁珠与溶液中分离开，最后将含有微卫星的片段从磁珠上洗脱下来。
链复制起始区，非编码控制区和一系列的非编码区[33-35]，如图1-3所示。鱼类的mtDNA的大小一般在15000bp-20000bp之间，不同的物种间的差异主要表现在CR区，主要原因为CR区存在长度以及重复程度不同的重复序列[36]，不同物种的鱼类的mtDNA的大小存在明显的差异，但是其结构以及各基因的组成顺序基本保持一致[56]，Zhu等[57]认为鱼类的线粒体DNA（mitochondrial DNA, mtDNA）作为一种分子标记技术已经在群体遗传学研究领域得到了广泛的关注。图1-3 线粒体DNA结构模式图Fig.1-3The pattern of mitochondrial DNA structure
【参考文献】：
期刊论文
[1]吉富罗非鱼群体遗传多样性的AFLP分析[J]. 燕涛,郭昱嵩,王中铎,刘丽,刘楚吾. 基因组学与应用生物学. 2013(02)
[2]蓝鳃太阳鱼F1-F3三个子代遗传多样性的RAPD分析[J]. 阮瑞霞,宣云峰,滕利荣,陈文华,徐海华,王荣泉. 水产养殖. 2013(04)
[3]半滑舌鳎微卫星标记遗传连锁图谱的构建[J]. 赵永伟,宋文涛,廖小林,牛余泽,庞仁谊,高峰涛,沙珍霞,陈松林. 中国水产科学. 2012(06)
[4]三疣梭子蟹选育家系微卫星分析[J]. 韩智科,刘萍,李健,高保全,陈萍. 水产学报. 2012(01)
[5]卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析[J]. 彭敏,陈晓汉,陈秀荔,蒋伟明,杨春玲,李咏梅. 西南农业学报. 2011(05)
[6]鲤遗传连锁图谱的构建[J]. 王宣朋,孙效文,李文升,张天奇,李超. 上海海洋大学学报. 2011(05)
[7]一个奥利亚罗非鱼雌性特异性SCAR标记的建立[J]. 杨玲,孟庆磊,李娴,付佩胜,安丽,董学飒,张龙岗,刘羽清. 渔业科学进展. 2011(04)
[8]卵形鲳鲹3个养殖群体的微卫星多态性分析[J]. 吉磊,区又君,李加儿. 热带海洋学报. 2011(03)
[9]2010年华南地区金鲳鱼养殖报告[J]. 刘贤敏,刘晋,刘康,庞观宏,曾凡归,马学坤. 当代水产. 2011(02)
[10]二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析[J]. 郑鹏飞,张桂蓉,魏开建,邹桂伟,王卫民,周玲玲,冉伟. 水生态学杂志. 2011(01)
博士论文
[1]鲢、鳙鱼遗传连锁图谱构建和鳙鱼蛋白感染因子基因的克隆[D]. 廖梅杰.中国海洋大学 2007
硕士论文
[1]斜带石斑鱼和赤点石斑鱼线粒体基因组全序列研究[D]. 庄轩.厦门大学 2007
本文编号：3071433
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：92 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
卵形鲳鲹Fig.1-1Trachinotusovatus
[26]，其中FIASCO法是目前应用最为普遍的一种方法，其基本原理如图1-2：是利用被生物素标记的探针与含有微卫星序列的片段进行杂交，然后通过磁珠上包被的链霉亲和素（Streptavidin）与探针上的生物素结合，通过磁力将所需的微卫星序列分离出来，然后利用磁力将磁珠与溶液中分离开，最后将含有微卫星的片段从磁珠上洗脱下来。
链复制起始区，非编码控制区和一系列的非编码区[33-35]，如图1-3所示。鱼类的mtDNA的大小一般在15000bp-20000bp之间，不同的物种间的差异主要表现在CR区，主要原因为CR区存在长度以及重复程度不同的重复序列[36]，不同物种的鱼类的mtDNA的大小存在明显的差异，但是其结构以及各基因的组成顺序基本保持一致[56]，Zhu等[57]认为鱼类的线粒体DNA（mitochondrial DNA, mtDNA）作为一种分子标记技术已经在群体遗传学研究领域得到了广泛的关注。图1-3 线粒体DNA结构模式图Fig.1-3The pattern of mitochondrial DNA structure
【参考文献】：
期刊论文
[1]吉富罗非鱼群体遗传多样性的AFLP分析[J]. 燕涛,郭昱嵩,王中铎,刘丽,刘楚吾. 基因组学与应用生物学. 2013(02)
[2]蓝鳃太阳鱼F1-F3三个子代遗传多样性的RAPD分析[J]. 阮瑞霞,宣云峰,滕利荣,陈文华,徐海华,王荣泉. 水产养殖. 2013(04)
[3]半滑舌鳎微卫星标记遗传连锁图谱的构建[J]. 赵永伟,宋文涛,廖小林,牛余泽,庞仁谊,高峰涛,沙珍霞,陈松林. 中国水产科学. 2012(06)
[4]三疣梭子蟹选育家系微卫星分析[J]. 韩智科,刘萍,李健,高保全,陈萍. 水产学报. 2012(01)
[5]卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析[J]. 彭敏,陈晓汉,陈秀荔,蒋伟明,杨春玲,李咏梅. 西南农业学报. 2011(05)
[6]鲤遗传连锁图谱的构建[J]. 王宣朋,孙效文,李文升,张天奇,李超. 上海海洋大学学报. 2011(05)
[7]一个奥利亚罗非鱼雌性特异性SCAR标记的建立[J]. 杨玲,孟庆磊,李娴,付佩胜,安丽,董学飒,张龙岗,刘羽清. 渔业科学进展. 2011(04)
[8]卵形鲳鲹3个养殖群体的微卫星多态性分析[J]. 吉磊,区又君,李加儿. 热带海洋学报. 2011(03)
[9]2010年华南地区金鲳鱼养殖报告[J]. 刘贤敏,刘晋,刘康,庞观宏,曾凡归,马学坤. 当代水产. 2011(02)
[10]二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析[J]. 郑鹏飞,张桂蓉,魏开建,邹桂伟,王卫民,周玲玲,冉伟. 水生态学杂志. 2011(01)
博士论文
[1]鲢、鳙鱼遗传连锁图谱构建和鳙鱼蛋白感染因子基因的克隆[D]. 廖梅杰.中国海洋大学 2007
硕士论文
[1]斜带石斑鱼和赤点石斑鱼线粒体基因组全序列研究[D]. 庄轩.厦门大学 2007
本文编号：3071433
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3071433.html
