对虾科15种虾类的系统发育分析及DNA条形码研究

发布时间：2021-03-25 11:18

　　通过PCR扩增并测序,获得并分析了对虾科（Penaeidae）15个种类的线粒体基因组（mtDNA）中细胞色素C氧化酶亚基I基因（COI）部分序列,分析了基于COI基因的DNA条形码在鉴别对虾科虾类中的应用。并应用核蛋白编码基因PEPCK基因和NaK基因对对虾科15种虾类的分子系统进化进行了研究,主要结果如下:1、在对虾科15种虾类137个个体的长度为634bp的COI基因部分序列中,共检测到了 324个多态位点,其中有235个简约信息位点。基于COI基因序列的对虾科15个种类DNA条形码研究结果显示,对虾科物种的种间遗传距离平均值是0.223,是种内平均遗传距离（0.0185）的12倍以上,符合Hebert提出的利用COI基因序列有效鉴别物种的标准。所构建的分子系统树表明,基于COI基因的DNA条形码适用于对虾科物种的分类鉴别。2、15种虾类的PEPCK基因序列长度为549bp,存在碱基的插入和缺失,在549bp碱基中,共检测到204个多态位点,简约信息位点163个。基于PEPCK基因所构建的MP、ML和NJ系统发育树的分支结构图的拓扑结构基本一致,MP、ML和NJ系统发育树中同种虾... 

【文章来源】：厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：80 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

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【参考文献】：
期刊论文
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[10]生物分类学的新动向——DNA条形编码[J]. 肖金花,肖晖,黄大卫.  动物学报. 2004(05)

硕士论文
[1]东亚特有鲤科类群的DNA条形码研究及其系统发育分析[D]. 彭居俐.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2007



本文编号：3099590