草鱼3种丙酮酸激酶和α-淀粉酶基因的结构、表达分析和生长相关标记筛选

发布时间：2023-03-04 00:45

　　饲料中的糖类物质是成本较低的供能物质,但与哺乳动物相比,鱼类对糖的利用率是较低的。本研究选取了鱼类糖利用关键酶中的丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PK)和α-淀粉酶(α-amylase,AMY)作为研究对象,分析了PK基因和AMY基因的c DNA序列,组织表达特征以及早期发育的表达谱,并将编码这两种酶的基因作为筛选草鱼生长相关SNPs的候选基因,以期对草鱼饲料中糖类物质的合理添加量提供一定的指导,同时为草鱼分子标记辅助育种提供更多的标记。具体研究内容如下:1.草鱼三种丙酮酸激酶基因的c DNA序列分析、组织表达特征和早期发育的表达谱。c DNA序列分析结果显示:草鱼的PKL基因ORF长1617bp,编码538个氨基酸;PKMb基因ORF长1587bp,编码528个氨基酸;PK-like基因ORF长1599bp,编码532个氨基酸。应用实时定量PCR(real-time PCR)检测了草鱼三种类型的丙酮酸激酶基因PKL、PKMb和PK-like在不同组织和早期发育不同时期的相对表达量。组织表达定量分析结果显示:PKL主要在肝脏、前肠、中肠和肾脏中表达,PKMb在肌肉中表达量最...

【文章页数】：72 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 鱼类丙酮酸激酶（PK）的研究进展
    1.2 鱼类a-淀粉酶的研究进展
    1.3 鱼类生长性状相关SNP分子标记的研究进展
    1.4 草鱼研究简介
    1.5 小结
    1.6 本研究的目的与意义
第二章 草鱼3种丙酮酸激酶基因的结构和表达特征
    2.1 材料与方法
        2.1.1 实验鱼和样品准备
        2.1.2 总RNA的提取及cDNA的合成
        2.1.3 荧光定量PCR
        2.1.4 生物信息学分析
        2.1.5 数据分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 目的基因cDNA序列分析
        2.2.2 草鱼PKL、PKMb和PK-like相对组织定量
    2.3 讨论
        2.3.1 草鱼PKL、PKMb和PK-like的同工酶类型分析
        2.3.2 草鱼PKL、PKMb和PK-like在不同组织和早期发育的相对表达分析
第三章 草鱼2种丙酮酸激酶基因SNP筛选及生长关联分析
    3.1 2 种丙酮酸激酶基因SNP在随机群体中与生长的关联分析
        3.1.1 材料与方法
        3.1.2 结果与分析
    3.2 2 种丙酮酸激酶基因在不同糖水平下与生长的关联分析
        3.2.1 材料与方法
        3.2.2 结果与分析
    3.3 讨论
第四章 草鱼 α -淀粉酶基因的结构和表达特征
    4.1 材料与方法
        4.1.1 实验鱼和样品准备
        4.1.2 总RNA的提取及cDNA的合成
        4.1.3 荧光定量PCR
        4.1.4 生物信息学分析
        4.1.5 数据分析
    4.2 结果与分析
        4.2.1 草鱼AMY基因cDNA序列及其编码的氨基酸分析
        4.2.2 草鱼α -淀粉酶的相对组织定量
        4.2.3 草鱼α -淀粉酶基因在早期发育不同阶段的表达
    4.3 讨论
第五章 草鱼 α -淀粉酶基因SNP筛选及其与生长的关联分析
    5.1 α -淀粉酶基因SNP在随机群体中与生长的关联分析
        5.1.1 材料与方法
        5.1.2 结果与分析
    5.2 α -淀粉酶基因SNP在不同糖水平下与生长的关联分析
        5.2.1 材料与方法
        5.2.2 结果与分析
    5.3 讨论
全文总结
参考文献
致谢
附录1 攻读硕士学位期间发表的论文



本文编号：3753411