鳙鱼蛋白磷酸酶（PP1）基因家族的克

发布时间：2023-05-03 11:43

　　鳜鱼是我国主要的名贵经济鱼类之一,具有无肌间刺,肉质鲜美等特点。在野生自然环境中,鳜鱼从一开口就只摄食活的饵料鱼,拒绝摄食死饵料鱼和人工饲料。但是,当通过适当方法进行人工驯养后,部分鳜鱼可以摄食冰鲜饵料鱼,甚至是人工饲料。目前对鳜鱼驯食人工饲料个体差异的分子机制还很少有文章报道。本课题组通过对易驯食和不易驯食冰鲜的鳜鱼转录组分析,发现鳜鱼驯食与视觉、食欲、节律、学习记忆等相关通路有着重要的关系。丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶1(Serine/threonine protein phosphatase,PP1)是学习记忆通路中一个重要的蛋白磷酸酶。许多研究已表明PP1在哺乳动物脑中具有抑制学习和长时程记忆的作用。在本研究中,我们探究鳜鱼PP1家族中四个亚型基因与鳜鱼接受人工饲料个体差异的关系,试图为研究鳜鱼接受人工饲料个体差异的分子机制提供理论知识。我们采用了PCR和RACE技术克隆了鳜鱼四个PP1亚型PP1caa、PP1cab、PP1cb和PP1cc基因的c DNA序列。通过序列分析发现,PP1caa基因c DNA序列3131bp,编码325个氨基酸;PP1cab基因cDNA序列1336bp...

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
中英文缩写对照表
第一章 文献综述
    1. 研究背景
        1.1 鳜鱼的养殖现状及养殖中的问题
        1.2 鳜鱼驯食研究现状
    2. 学习记忆与摄食的关系研究进展
        2.1 学习记忆的研究进展以及与摄食的关系
        2.2 学习记忆与鳜鱼摄食行为的关系研究进展
    3. 蛋白磷酸酶（PP1）基因家族研究进展
        3.1 PP1成员类型及生理功能
        3.2 PP1与学习记忆的关系
    4. 单核苷酸多态性
        4.1 SNP及其检测技术
        4.2 SNP与性状的关系
        4.3 SNP在辅助育种上的应用
    5. 本文研究目的与意义
第二章 材料与方法
    1. 实验材料
        1.1 主要试剂
        1.2 主要仪器
        1.3 实验鱼
    2. 实验方法
        2.1 鳜鱼驯化与取样
        2.2 DNA的提取与检测
        2.3 RNA的提取与检测
        2.4 鳜鱼PP1基因核心片段扩增
            2.4.1 cDNA第一条链的合成
            2.4.2 PP1基因核心片段PCR扩增
            2.4.3 切胶纯化基因片段
        2.5 PP1cab基因 3’- RACE克隆
            2.5.1 引物设计和合成特异性cDNA第一链
            2.5.2 3’-RACE扩增
            2.5.3 目的片段的连接转化
            2.5.4 序列拼接与分析
        2.6 鳜鱼PP1基因mRNA表达水平分析
            2.6.1 特异性引物的设计
            2.6.2 标准曲线的制作
            2.6.3 荧光定量PCR检测
        2.7 鳜鱼PP1基因组SNP位点筛查
            2.7.1 鳜鱼PP1四个亚型基因组序列的克隆
            2.7.2 鳜鱼PP1四个亚型基因组SNP位点筛查
            2.7.3 鳜鱼PP1caa和PP1cb基因SNP位点的分型
            2.7.4 SNP位点与鳜鱼驯食性状的相关性分析
        2.8 PP1caa和PP1cb突变位点转录因子预测分析
第三章 结果与分析
    1. 基因组DNA提取以及检测
    2. 总RNA提取以及反转录
    3. 鳜鱼PP1基因cDNA的克隆
    4. 鳜鱼PP1基因序列分析
    5. 鳜鱼PP1基因mRNA的组织分布
    6. 在易驯食和不易驯食鳜鱼中PP1基因mRNA表达分析
    7. 鳜鱼PP1caa和PP1cb基因SNP筛查和分型
    8. 鳜鱼PP1caa和PP1cb基因突变位点转录因子结合预测分析
第四章 讨论
第五章 小结
参考文献
硕士期间发表的论文
致谢



本文编号：3806725