许氏平鲉（Sebastes schlegelii）EST-SSR标记开发及快速生长选育系遗传结构分析

发布时间：2023-12-27 18:45

　　许氏平鲉(Sebastes schlegelii)是我国北方近海重要的岩礁性鱼类,由于具有广温广盐习性,可以自然越冬,也是我国北方沿海深水网箱养殖和增殖放流的适宜经济鱼种,但近年来其渔业资源减少严重,因此进行许氏平鲉人工繁育及良种选育具有重要的经济效益和社会效益。微卫星标记技术能够为许氏平鲉良种选育提供一定的技术支持,尤其是在分子标记辅助育种等方面。EST-SSR开发成本低,且在不同物种间具有一定的通用性,已经成为新型高效的开发微卫星标记的途径。许氏平鲉是卵胎生鱼类,具有一雌多雄的交配模式,对其选育系的遗传结构进行监测、分析其遗传多样性以及遗传分化情况具有十分重要的实践意义。本研究首次利用已发表的许氏平鲉EST序列进行EST-SSR标记开发,以期为许氏平鲉良种选育提供更多标记选择,同时选用8对扩增效果好、多态性丰富的微卫星引物对17个许氏平鲉快速生长选育系的遗传结构进行分析,以期为许氏平鲉种质资源保护、良种选育等工作提供支持。1、许氏平鲉EST-SSR标记的开发及通用性检测从NCBI公共数据库下载的1980条EST序列经拼接、SSR位点查找后,发现EST-SSR位点的发现率为9.14%...

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
abstract
引言
    1 许氏平鲉概况
        1.1 许氏平鲉的生物学特征
        1.2 许氏平鲉良种选育概况
        1.3 许氏平鲉研究进展
    2 微卫星标记概述
        2.1 微卫星标记的发展历程
        2.2 微卫星标记的特征及形成原理
        2.3 微卫星标记的类型
        2.4 微卫星标记的开发
    3 微卫星标记在经济鱼类研究中的应用
        3.1 遗传连锁图谱构建
        3.2 遗传多样性检测
        3.3 遗传结构分析
        3.4 亲缘关系鉴定（家系鉴定和亲子鉴定）
    4 本研究目的与意义
第一章 许氏平鲉(SEBASTES SCHLEGELII)EST-SSR标记筛选
    1 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 实验方法
    2 结果与分析
        2.1 基因组DNA的提取结果
        2.2 许氏平鲉EST序列中SSR位点种类、数量及出现频率
        2.3 引物筛选与优化
    3 讨论
第二章 许氏平鲉EST-SSR引物多态性和通用性检测
    1 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 实验方法
    2 结果与分析
        2.1 许氏平鲉野生群体多态性检测结果
        2.2 EST-SSR位点在野生群体中的多态性评价
        2.3 许氏平鲉多态性微卫星引物的通用性检测结果
    3 讨论
第三章 许氏平鲉17个快速生长选育系的遗传结构分析
    1 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 实验方法
    2 结果与分析
        2.1 引物筛选结果
        2.2 PCR扩增和SSR分型结果
        2.3 8 个微卫星标记的多态性分析
        2.4 选育系遗传多样性分析
        2.5 选育系遗传结构分析
    3 讨论
小结
参考文献
发表文章
项目支持
致谢



本文编号：3875698