军曹鱼养殖群体遗传多样性及基于基因组信息的微卫星标记初筛

发布时间：2024-02-15 15:04

　　军曹鱼(Rachycentron canadum),隶属于鲈形目(Perciformes)、海鲡科(Rachycentridae),是一种暖水性远洋洄游鱼类,因其肉质细嫩、味道鲜美、生长速度快等特性,已成为我国南方重要的海水养殖对象。现有军曹鱼的分子标记数目有限,国内对其养殖群体的遗传多样性研究也相对较少。为了进一步做好军曹鱼的选育工作,本研究对北海(BH)、陵水(LS)、硇洲(NZ)、徐闻(XW)和三亚(SY)的5个军曹鱼养殖群体,共174个军曹鱼个体进行遗传多样性分析,并基于新近完成的军曹鱼全基因组测序结果,开展军曹鱼微卫星序列搜索和筛选等工作。主要结果如下:1、12个微卫星标记在5个军曹鱼养殖群体中共检测到129个等位基因;各军曹鱼养殖群体的平均等位基因数为3.833～6.750,平均有效等位基因数为2.284～3.645,平均观测杂合度与平均期望杂合度分别是0.481～0.635和0.533～0.681,平均多态信息含量为0.463～0.630;哈迪-温伯格检测显示,各军曹鱼养殖群体在多个微卫星位点上均显著偏离平衡(P<0.05);军曹鱼养殖群体间的遗传分化指数(F

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图1-1军曹鱼采样点卫星地图

广东海洋大学硕士学位论文7图1-1军曹鱼采样点卫星地图Figure1-1SatellitemapofsamplingpointofCobia

图2-1基于Nei’s遗传距离构建的5个军曹鱼群体的UPGMA系统进化树

军曹鱼养殖群体遗传多样性及基于基因组信息的微卫星标记初筛16表2-55个军曹鱼养殖群体的AMOVA分析Table2-5AMOVAanalysisinthefiveculturedpopulationofcobia变异来源Sourceofvariation自由度d.f.平方和Sum....

图3-14个军曹鱼群体的UPGMA系统进化树

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图4-1基于军曹鱼养殖群体间的遗传距离构建的NJ进化树

军曹鱼养殖群体遗传多样性及基于基因组信息的微卫星标记初筛28图4-1基于军曹鱼养殖群体间的遗传距离构建的NJ进化树Figure4-1Theneighborjoiningphylogenetictreebasedongeneticdistances4.4讨论和小结通过对BH、LS、....

本文编号：3899946