白菜A07染色体中部抽薹QTL鉴定及初定位

发布时间：2020-09-22 14:59

　　 白菜类作物是一种具重要经济价值的作物,在欧洲栽培了数个世纪后扩展到中亚及东亚地区。未熟抽薹会大大降低此类作物的产量和商品价值。染色体片段代换系是进行作物QTL定位和基因功能研究的理想材料。本研究利用前期成功构建的包含抽薹QTL的染色体片段代换系为试验材料,对其表型和基因型进行鉴定,并对白菜Chr.7中部抽薹QTL进行初定位,研究结果如下:1.对6个染色体片段代换系株系(16SWD003、16SWD004、16SWD005、16SWD0014、16SWD0015和16SWD0016)进行进一步基因型鉴定试验。结果表明:有三个株系均包含供体亲本‘08A061’的一个代换片段,有两个株系包含供体亲本的2个代换片段,一个株系包含供体亲本的3个代换片段。对6个染色体片段代换系株系抽薹性状进行表型鉴定,所有株系均与RcBr间有显著差异,说明代换片段可能存在抽薹性状相关的QTL。2.通过染色体片段代换系16AWD004与RcBr杂交,构建NIL-F_2分离群体。利用两个侧翼标记Cnu_m553a和Cnu_m044a,对NIL-F_2分离群体约760单株进行重组体筛选,重组单株后代进行表型鉴定。通过基因型与表型联合分析,最终将控制抽薹早晚QTL定位在标记Nia_m030a和Cnu_m044a之间,标记间物理距离793.046kb。3.基于基因注释信息(http://brassicadb.org/brad/index.php),发现此候选区间共有2个与开花相关基因Bra004007、Bra003913。Bra004007基因和拟南芥中的基因AT1G69120有类似的功能,编码与SRF转录因子同源的MADS结构域蛋白的花同源异型基因,对AGAMOUS的转录激活起决定性作用,可与启动子结合并调节开花时间基因SVP,SOC1和AGL24的表达。Bra003913基因和拟南芥中的基因BAT1G71800有类似的功能,介导花抑制基因FLC的沉默。
【学位单位】：沈阳农业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：S634
【部分图文】：

沈阳农业大学硕士学位论文与了调控过程(Fornara et al.,2010)。将模式植物拟南芥调控抽薹开花的遗传方式划分为五个途径。其中春化路径中的抽薹开花时间是由 FLC 以及控制 FLC 表达的 FRI 等位基因共同调控(Michaels and Amasino,1999;Johanson et al.,2000)。FLC作为控制拟南芥开花时间的枢纽基因其表达既受 FRI 正调控又受自主途径和春化作用负调控。当 FLC 作为编码 MADS-box 的转录调控因子时，通过抑制 FT和 SOC1 基因的表达，阻止顶端分生组织从营养生长转向生殖生长转，对拟南芥植物开花调控起到抑制作用(Zachco et al.,1997;Michaels and Amasino,1999;Jungenand Llha,2010)。在拟南芥中，前期已发现 6 个与春化作用直接相关的基因(Lrvy etal.,2002)。发现了 3 条独立的分子春化反应支路，即 FLA-、AGL24-和AGL19(Alexander and Henning,2008)。(图 1-1)

第一章 文献综述克隆出了 7 个基因，分别是 FCA、FPA、FY、FLD、LD、FVE 和 FLK(Lim et al.,2004)他们分别通过不同的机制调节开花时间。植物中参与 GA 合成的基因有很多，目前已克隆了一些 GA 生物合成基因，如 GA1、GA3、GA4 和 GA5(Blazquez etal.,1998)。把这些遗传途径中共同作用的基因成为称为开花整合基因。春化途径和自主途径都是通过抑制关键基因 FLC 的表达来使花期延后；光周期途径是间接作用于 RGL3FT 等基因，促进顶端分生组织向花芽分化。GA 信号传导途径被激活后，相关重要基因调控下游 LFY 和 SOC1 的转录。由此可见，无论哪种遗传调控途径，最终都是将在各自途径中产生的效应作用于一些关键基因，如 SOC1、FT、LFY 等，由这些关键基因决定植物是否开花，何时开花的是各途径效应作用之和(Corbesier and Coupland,2006)。(图 1-2)

18图 2-2 CSSL 群体中 16AWD004 基因型图。来自于供体亲本‘08A061’基因组用红色片段代表，受体亲本‘RcBr’基因组用蓝色片段代表Fig2-2 The genotype graph of No.16AWD004 plants from the CSSL. Red pieces are the genome from the ‘08A061’; Blue pieces are ‘RcBr’Genome

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本文编号：2824543