应用SSR技术研究香蕉种质资源的遗传多样性
发布时间:2020-12-05 13:10
香蕉(Musa spp.)是世界上重要的热带粮食作物和水果之一,也是我国华南地区重要的经济作物。由于香蕉的种质资源的遗传背景不清,且其复杂的倍性水平、单性结实、高度不育和无性繁殖等特点,困扰着传统香蕉育种工作的开展,加上香芽蕉遗传背景极其相近,用形态学方法难以区分,不利于品种知识产权的保护,本研究基于简单重复序列具有共显性和重复性好等特点,所以利用SSR分子标记研究香蕉种质资源的遗传多样性。通过筛选获得多态性较好的14对SSR引物,利用这14对引物分析了104份基因型为AAA和ABB香蕉资源的亲缘关系,主要结果如下:1、212对引物的筛选结果:经过琼脂凝胶电泳得到206对具有扩增特异性的引物,其中具有多态性的引物有180对。97.1%的引物可以成功扩增出特异的SSR标记条带;84.9%的引物具有多态性。最后筛选出14对具有较好多态性的SSR引物用于研究供试材料遗传关系。2、14对引物的扩增结果:14对SSR引物在104份香蕉材料中共扩增得到201个等位基因,每对引物平均扩增得到14.35个等位基因。引物的多态性信息含量(PIC)为0.8009-0.9498,平均0.8903。共得到清晰...
【文章来源】:江西农业大学江西省
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
(3)引物152、148、98的特异性扩增结果
试验结果与分析图 3-2(3) 引物 152、148、98 的特异性扩增结果Fig. 3-2 (3) The specific amplification with primer 152, 148 and 98注:M 是 500bp DNA 分子量标记;每 1-8 泳道分别表明一个引物的 PCR 扩增产物Note: M is 500bp DNA marker; eeach lanes indicated PCR amplification of primer 152,148 and 98
24图 3-5(1) 基于 14 对 SSR 引物的 104 份样品的 UPGMA 聚类图Fig. 3-5 (1) UPGMA clustering figure of 104samples based on 14 SSR primers
【参考文献】:
期刊论文
[1]广西香蕉种质资源的SSR分析[J]. 孙嘉曼,尹玲,张进忠,韦绍龙,李朝生,刘金成,卢江. 西南农业学报. 2016(08)
[2]2013—2014年中国香蕉产销形势分析与预测[J]. 柯佑鹏,过建春,夏勇开,王芳. 广东农业科学. 2014(15)
[3]基于表型性状和SSR标记的20份香蕉材料遗传多样性研究[J]. 余智城,何雪娇,曹明华. 中国南方果树. 2014(03)
[4]我国香蕉产业面临的主要问题与对策[J]. 董涛,陈新建,凡超,金燕,易干军. 广东农业科学. 2013(11)
[5]SNP分子标记的研究及其应用进展[J]. 唐立群,肖层林,王伟平. 中国农学通报. 2012(12)
[6]香蕉种质资源亲缘关系的ISSR分析[J]. 姚锦爱,蔡鸿娇,石妞妞,甘林,杨秀娟,陈福如. 福建农业学报. 2012(01)
[7]香蕉野生种质资源系统分类研究进展[J]. 冯慧敏,陈友,邓长娟,李博,武耀廷. 热带农业科学. 2011(05)
[8]中国芭蕉属野生种表型性状和SSR多样性分析[J]. 冯慧敏,陈友,李博,邓长娟,武耀廷. 热带作物学报. 2011(04)
[9]Analysis of genetic diversity in banana cultivars(Musa cvs.) from the South of Oman using AFLP markers and classification by phylogenetic,hierarchical clustering and principal component analyses[J]. Umezuruike Linus OPARA,Dan JACOBSON,Nadiya Abubakar AL-SAADY. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2010(05)
[10]部分香蕉品种SSR指纹图谱的构建[J]. 王静毅,陈业渊,黄秉智,于飞,武耀廷. 果树学报. 2009(05)
博士论文
[1]SSR分子标记开发和在香蕉种质资源遗传分析中的应用[D]. 王静毅.海南大学 2010
硕士论文
[1]香蕉种质资源基因组类型的分子标记及倍性鉴定[D]. 闫佼.江西农业大学 2016
[2]世界香蕉贸易格局变化对中国香蕉市场的影响研究[D]. 李佳琪.海南大学 2015
[3]中国主要蕉类形态学与分子系统学研究[D]. 姜燕.西南农业大学 2005
[4]几种芭蕉属植物的AFLP分析及分类研究[D]. 李典范.湖南农业大学 2002
本文编号:2899501
【文章来源】:江西农业大学江西省
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
(3)引物152、148、98的特异性扩增结果
试验结果与分析图 3-2(3) 引物 152、148、98 的特异性扩增结果Fig. 3-2 (3) The specific amplification with primer 152, 148 and 98注:M 是 500bp DNA 分子量标记;每 1-8 泳道分别表明一个引物的 PCR 扩增产物Note: M is 500bp DNA marker; eeach lanes indicated PCR amplification of primer 152,148 and 98
24图 3-5(1) 基于 14 对 SSR 引物的 104 份样品的 UPGMA 聚类图Fig. 3-5 (1) UPGMA clustering figure of 104samples based on 14 SSR primers
【参考文献】:
期刊论文
[1]广西香蕉种质资源的SSR分析[J]. 孙嘉曼,尹玲,张进忠,韦绍龙,李朝生,刘金成,卢江. 西南农业学报. 2016(08)
[2]2013—2014年中国香蕉产销形势分析与预测[J]. 柯佑鹏,过建春,夏勇开,王芳. 广东农业科学. 2014(15)
[3]基于表型性状和SSR标记的20份香蕉材料遗传多样性研究[J]. 余智城,何雪娇,曹明华. 中国南方果树. 2014(03)
[4]我国香蕉产业面临的主要问题与对策[J]. 董涛,陈新建,凡超,金燕,易干军. 广东农业科学. 2013(11)
[5]SNP分子标记的研究及其应用进展[J]. 唐立群,肖层林,王伟平. 中国农学通报. 2012(12)
[6]香蕉种质资源亲缘关系的ISSR分析[J]. 姚锦爱,蔡鸿娇,石妞妞,甘林,杨秀娟,陈福如. 福建农业学报. 2012(01)
[7]香蕉野生种质资源系统分类研究进展[J]. 冯慧敏,陈友,邓长娟,李博,武耀廷. 热带农业科学. 2011(05)
[8]中国芭蕉属野生种表型性状和SSR多样性分析[J]. 冯慧敏,陈友,李博,邓长娟,武耀廷. 热带作物学报. 2011(04)
[9]Analysis of genetic diversity in banana cultivars(Musa cvs.) from the South of Oman using AFLP markers and classification by phylogenetic,hierarchical clustering and principal component analyses[J]. Umezuruike Linus OPARA,Dan JACOBSON,Nadiya Abubakar AL-SAADY. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2010(05)
[10]部分香蕉品种SSR指纹图谱的构建[J]. 王静毅,陈业渊,黄秉智,于飞,武耀廷. 果树学报. 2009(05)
博士论文
[1]SSR分子标记开发和在香蕉种质资源遗传分析中的应用[D]. 王静毅.海南大学 2010
硕士论文
[1]香蕉种质资源基因组类型的分子标记及倍性鉴定[D]. 闫佼.江西农业大学 2016
[2]世界香蕉贸易格局变化对中国香蕉市场的影响研究[D]. 李佳琪.海南大学 2015
[3]中国主要蕉类形态学与分子系统学研究[D]. 姜燕.西南农业大学 2005
[4]几种芭蕉属植物的AFLP分析及分类研究[D]. 李典范.湖南农业大学 2002
本文编号:2899501
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/yylw/2899501.html