蜡梅花芽分化及发育过程中的转录组特征分析
发布时间：2020-12-05 17:27
蜡梅（Chimonanthus praecox（L.）Link）,属于蜡梅科蜡梅属植物,原产中国,是我国传统的名贵观赏花木,在中国有近1000年的栽培历史。与大多数木本植物在春夏开花不同,蜡梅盛开于寒冷的冬季,花色淡黄,花香四溢,因此具有极高的观赏价值和经济价值。但其盛开在冬季的具体的原因暂未有人报导。目前,对蜡梅花期的相关研究仅仅停留在对其花芽发育不同阶段的石蜡切片观察上,缺少这种变化相关分子机理的研究。本文在前人对蜡梅花芽发育过程中花芽石蜡切片形态学研究的基础上,对蜡梅的花芽连续采样并进行转录组测序,得到了蜡梅花芽从开始分化直至开花全阶段的转录组数据,并结合切片观察数据对发育重点阶段的转录组进行差异表达基因分析。获得的主要结果如下:1、通过对蜡梅花芽样品的连续采样,提取RNA并测序,得到了未分化期,分化过渡期,花被片原基形成期,雄蕊原基形成期,雌蕊原基形成期,花芽发育期,花芽缓慢发育期,子房及胚珠发育期,花粉粒发育期,初花期等10个时期的转录组数据库。结合切片观察结果,以及测序数据的相关性及PCA分析,将这10个阶段划分为3个关键过程:花芽分化期（未分化期-雌蕊原基分化期）;花器官...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
蜡梅花芽分化各时期样品形态
各时期测序原始数据占比Fig.2Class近口tionofraw沈adsineach‘ta誉图中字母代表时期:几uD.b.皿卫已TPD，
25图 3 10 个时期共 30 个样品测序数据之间的相关性比较Fig.3 Correlation between sequence data of 30 samples in all ten stages本次采样共 10 个时期，每个时期设有 3 个生物学重复，生物学重复间样品的差异过大会影响到后续的所有分析。为了奠定可靠的分析基础，进行生物学重复间的相关性比较十分的有必要。本实验通过皮尔逊相关系数来统计各生物学样品间的差异以及不同时期之间的差异。原则上，相同时期的生物学重复间的相关性应大于80%。通过图 3 可以发现，所有时期的生物学重复间的相关系数均大于 90，说明这些生物学重复是可靠的，可以进行后续分析。通过该图还能发现, EFP 阶段的 3 个生物学重复整体上与其他 9 个时期有较大差异，相关性较低，平均为 60%，这说明该阶段相比与开花前的几个阶段，基因表达出现了较大差异。在相关性分析的基础上，本实验还对总共 30 个样品进行了 PCA 主成分分析分
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物WRKY转录因子的研究进展[J]. 梁滨,董冬. 生物学通报. 2018(06)
[2]3种木兰属植物花芽分化时期及形态变化[J]. 范李节,陈梦倩,王宁杭,申亚梅,张寿洲. 东北林业大学学报. 2018(01)
[3]高等植物成花诱导的分子机理研究进展[J]. 周琴,张思思,包满珠,刘国锋. 分子植物育种. 2018(11)
[4]桂花花芽分化和花开放研究进展[J]. 王英,张超,付建新,赵宏波. 浙江农林大学学报. 2016(02)
[5]植物芽休眠调控分子机制研究进展[J]. 丁安琪,冯莹,潘腾飞,郭志雄,潘东明. 分子植物育种. 2015(09)
[6]玉米小分子热激蛋白ZmHSP17.7基因的克隆与功能分析[J]. 孙爱清,葛淑娟,董伟,单晓笛,董树亭,张杰道. 作物学报. 2015(03)
[7]梅花成花及其调控研究进展[J]. 江波,方仲相,方佳,何勇清,郑炳松. 科技通报. 2014(03)
[8]蜡梅花被片表层形态观察及其意义[J]. 方子义,赵凯歌,陈龙清. 广西植物. 2013(04)
[9]花器官发育的分子机制研究进展[J]. 唐璐璐,宋云澎,李交昆. 西北植物学报. 2013(05)
[10]植物热激蛋白70的分子作用机理及其利用研究进展[J]. 齐妍,徐兆师,李盼松,陈明,李连城,马有志. 植物遗传资源学报. 2013(03)
硕士论文
[1]蜡梅科四种植物花芽分化及花发育的形态学比较研究[D]. 李来.华中农业大学 2018
[2]蜡梅抗寒相关转录因子CpICE1a、CpICE1b和CpDREB1的克隆及功能初探[D]. 张倩.华中农业大学 2017
[3]蜡梅类黄酮3’-羟化酶基因（CpF3’H）及其启动子功能初探[D]. 俞美丽.华中农业大学 2017
[4]蜡梅科植物基因组大小预测与核型分析[D]. 董雷.华中农业大学 2017
本文编号：2899819
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
蜡梅花芽分化各时期样品形态
各时期测序原始数据占比Fig.2Class近口tionofraw沈adsineach‘ta誉图中字母代表时期:几uD.b.皿卫已TPD，
25图 3 10 个时期共 30 个样品测序数据之间的相关性比较Fig.3 Correlation between sequence data of 30 samples in all ten stages本次采样共 10 个时期，每个时期设有 3 个生物学重复，生物学重复间样品的差异过大会影响到后续的所有分析。为了奠定可靠的分析基础，进行生物学重复间的相关性比较十分的有必要。本实验通过皮尔逊相关系数来统计各生物学样品间的差异以及不同时期之间的差异。原则上，相同时期的生物学重复间的相关性应大于80%。通过图 3 可以发现，所有时期的生物学重复间的相关系数均大于 90，说明这些生物学重复是可靠的，可以进行后续分析。通过该图还能发现, EFP 阶段的 3 个生物学重复整体上与其他 9 个时期有较大差异，相关性较低，平均为 60%，这说明该阶段相比与开花前的几个阶段，基因表达出现了较大差异。在相关性分析的基础上，本实验还对总共 30 个样品进行了 PCA 主成分分析分
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物WRKY转录因子的研究进展[J]. 梁滨,董冬. 生物学通报. 2018(06)
[2]3种木兰属植物花芽分化时期及形态变化[J]. 范李节,陈梦倩,王宁杭,申亚梅,张寿洲. 东北林业大学学报. 2018(01)
[3]高等植物成花诱导的分子机理研究进展[J]. 周琴,张思思,包满珠,刘国锋. 分子植物育种. 2018(11)
[4]桂花花芽分化和花开放研究进展[J]. 王英,张超,付建新,赵宏波. 浙江农林大学学报. 2016(02)
[5]植物芽休眠调控分子机制研究进展[J]. 丁安琪,冯莹,潘腾飞,郭志雄,潘东明. 分子植物育种. 2015(09)
[6]玉米小分子热激蛋白ZmHSP17.7基因的克隆与功能分析[J]. 孙爱清,葛淑娟,董伟,单晓笛,董树亭,张杰道. 作物学报. 2015(03)
[7]梅花成花及其调控研究进展[J]. 江波,方仲相,方佳,何勇清,郑炳松. 科技通报. 2014(03)
[8]蜡梅花被片表层形态观察及其意义[J]. 方子义,赵凯歌,陈龙清. 广西植物. 2013(04)
[9]花器官发育的分子机制研究进展[J]. 唐璐璐,宋云澎,李交昆. 西北植物学报. 2013(05)
[10]植物热激蛋白70的分子作用机理及其利用研究进展[J]. 齐妍,徐兆师,李盼松,陈明,李连城,马有志. 植物遗传资源学报. 2013(03)
硕士论文
[1]蜡梅科四种植物花芽分化及花发育的形态学比较研究[D]. 李来.华中农业大学 2018
[2]蜡梅抗寒相关转录因子CpICE1a、CpICE1b和CpDREB1的克隆及功能初探[D]. 张倩.华中农业大学 2017
[3]蜡梅类黄酮3’-羟化酶基因（CpF3’H）及其启动子功能初探[D]. 俞美丽.华中农业大学 2017
[4]蜡梅科植物基因组大小预测与核型分析[D]. 董雷.华中农业大学 2017
本文编号：2899819
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