干旱胁迫下苹果miRNAs的表达分析及功能研究
发布时间：2020-12-15 11:12
MiRNAs是一类内源性的小分子RNA,长度大约21-24 nt。MiRNAs通过与靶标互作参与调控植物的生长发育、形态建成、果实发育、对生物和非生物胁迫的响应等。近年来随着高通量测序和生物信息学的发展,越来越多的miRNAs已经被鉴定。苹果是一种重要的经济作物。干旱胁迫会影响苹果的产量和品质,因此对其抗旱性的研究具有重要的价值。miRBase-2.1中记录有206个苹果特异的pre-miRNA,207个成熟miRNAs,但是与抗旱相关的miRNAs却鲜有报道。本研究利用高通量测序分析平邑甜茶和富平楸子两种苹果砧木中与抗旱相关的miRNAs,筛选差异表达的miRNAs进行qRT-PCR鉴定。选择与抗旱相关的miRNAs进行过表达和转基因研究,结果如下:（1）对测序结果中筛选的14个已知miRNAs和12个新型miRNAs进行qRT-PCR验证,结果显示10个已知miRNAs和10个新型miRNAs的表达量变化趋势与测序结果一致。而mdm-MIR7121d-p3和PC-5p-101486130的溶解曲线没有峰值;mdm-miR477b、mdm-miR7122a、md...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
植物miRNAs的合成途径(OlivierVoinnet2009)
图 2-1 总 RNA 提取结果Fig. 2-1 Total RNA extraction resul表 2-5 新型 miRNAsTable 2-5 Novel miRNAsseq lenup/downPv(t_CTTGGACC22 up5.505AACCCTC21 up2.704CCTGCTT21 up1.905CAACAACT24 up5.905CTTGTCC20 up5.204AGGACA21 up7.704
第二章 苹果 miRNA 的差异表达 型 miRNAs 符合测序结果，其中 mdm-MIR7121d-p3 和 PC-5p-101486_130 的溶解曲线没有峰值；mdm-miR477b 、mdm-miR7122a、mdm-miR393a 和 mdm-miR156t 的溶解曲线虽然是单峰，但是定量结果与测序不符合。2.3.3.1 内参的表达分析根据上述选择的三个内参，设计引物进过实时定量 PCR，根据三个内参的扩增曲线和溶解曲线（图 2-2）确定最终的内参选择。
【参考文献】：
期刊论文
[1]过表达番茄Sly-miR397基因增强拟南芥的耐旱性[J]. 向娟,林鹏,李兴盛,李双桃,刘梦云,张磊,郭仰东. 中国农业大学学报. 2016(10)
[2]microRNA表达检测技术进展[J]. 张宇,张勇,杨长成,王振宁. 新乡医学院学报. 2008(06)
[3]Identification and characterization of new plant microRNAs using EST analysis[J]. George P.COBB1,Todd A.ANDERSON. Cell Research. 2005(05)
[4]水分胁迫对冬小麦CO2同化作用的影响[J]. 薛崧,汪沛洪,许大全,李立人. 植物生理学报. 1992(01)
硕士论文
[1]玉米纹枯病胁迫响应相关miRNA的功能研究[D]. 韩素芬.四川农业大学 2012
本文编号：2918171
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
植物miRNAs的合成途径(OlivierVoinnet2009)
图 2-1 总 RNA 提取结果Fig. 2-1 Total RNA extraction resul表 2-5 新型 miRNAsTable 2-5 Novel miRNAsseq lenup/downPv(t_CTTGGACC22 up5.505AACCCTC21 up2.704CCTGCTT21 up1.905CAACAACT24 up5.905CTTGTCC20 up5.204AGGACA21 up7.704
第二章 苹果 miRNA 的差异表达 型 miRNAs 符合测序结果，其中 mdm-MIR7121d-p3 和 PC-5p-101486_130 的溶解曲线没有峰值；mdm-miR477b 、mdm-miR7122a、mdm-miR393a 和 mdm-miR156t 的溶解曲线虽然是单峰，但是定量结果与测序不符合。2.3.3.1 内参的表达分析根据上述选择的三个内参，设计引物进过实时定量 PCR，根据三个内参的扩增曲线和溶解曲线（图 2-2）确定最终的内参选择。
【参考文献】：
期刊论文
[1]过表达番茄Sly-miR397基因增强拟南芥的耐旱性[J]. 向娟,林鹏,李兴盛,李双桃,刘梦云,张磊,郭仰东. 中国农业大学学报. 2016(10)
[2]microRNA表达检测技术进展[J]. 张宇,张勇,杨长成,王振宁. 新乡医学院学报. 2008(06)
[3]Identification and characterization of new plant microRNAs using EST analysis[J]. George P.COBB1,Todd A.ANDERSON. Cell Research. 2005(05)
[4]水分胁迫对冬小麦CO2同化作用的影响[J]. 薛崧,汪沛洪,许大全,李立人. 植物生理学报. 1992(01)
硕士论文
[1]玉米纹枯病胁迫响应相关miRNA的功能研究[D]. 韩素芬.四川农业大学 2012
本文编号：2918171
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