草地早熟禾PpCHL1基因的克隆及功能的初步鉴定
发布时间：2021-02-10 21:00
草地早熟禾（Poa pratensis L.）是一种冷季型的多年生草坪草,属于禾本科早熟禾属。因其色泽喜人和具有强抗寒性、耐修剪、耐践踏等优点应用广泛。叶绿素酶是参与叶绿降解过程中的关键酶,但有关草地早熟禾叶绿素酶1基因特性及其在叶绿素降解过程中发挥的作用鲜有报道。本研究利用RACE技术获得PpCHL1基因的全长cDNA,编码具有316个氨基酸,且含有以丝氨酸为活性中心的酯酶结构域。氨基酸序列Blast 比对结果显示与乌拉尔图小麦CHL1蛋白同源性高达74%,故而命名为PpCHL1,并在Genbank中提交登记（KU145126）。通过染色体步移技术获得PpCHL1基因的启动子序列1247bp,顺式作用元件预测发现该基因具有TATA-box（核心转录起始元件）、Box4（光响应作用元件）、AuxRR-core（响应IAA作用元件）、CCGTCC-box（植物分生组织激活位点）、CGTCA-motif、TGACG-motif（响应MeJA作用元件）、circadian（参与生理调控元件）。说明该基因响应激素信号的调节,并参与生理代谢反应。为了探讨适合草地早熟禾的内参基因,为后续进行基因表...
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１草地早熟禾ＰｐＣＴ／Ｌ／基因的扩增结果??Ｆｉｇ．２－１?ｃＤＮＡ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＰｐＣＨＬｌ??
ＨＨＩＨＩ?ＢＨＨＨＨＩ??图２－１草地早熟禾ＰｐＣＴ／Ｌ／基因的扩增结果??Ｆｉｇ．２－１?ｃＤＮＡ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＰｐＣＨＬｌ??Ａ：?ＰｐＣＨＬｌ＾ｙｉｍ；?Ｂ：?ＰｐＣＨＬ１＾５＾ｍ；?Ｃ：?ＰｐＣＨｌｌ??Ａ：?Ｔｈｅ３＇ｒｅｇｉｏｎ?ｏｆ?ＰｐＣＨＬｌ?；?Ｂ：?Ｔｈｅ?５＊?ｒｅｇｉｏｎ?ｏｆ?Ｐ／７Ｃ／／Ｚ７；?Ｃ：?Ｔｈｅ?ｆｕｌｌ?ｌｅｎｇｔｈ?ｏｆ／＾Ｃ／ＺＺ．／??该基因通过ＢＬＡＳＴ比对发现与乌拉尔图小麦（７＞ｖＹ／ａ／ｗ＾＇／／ｖｗｍ）?Ｃ７／Ｉ／基因源性相似度达７４％，故而命名为基因。通过ＯＲＦ?Ｆｉｎｄｅｒ对该基因开放阅读??行预测分析，其ＯＲＦ全长９５１?ｂｐ，编码３１６个氨基酸。利用ＮＣＢＩ?Ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ?Ｄｏｍａｉｎ??ｈ对该蛋白的保守结构域进行预测分析，结果表明ＰｐＣｆｆｌｌ基因编码的蛋白属于??－脂肪酶家族，包含＜ｘ／ｐ水解酶的结构域，具有水解酶的特性（图２－２）。??１?Ｓｔ?ｌｉｔ?ＩＳ?參?２Ｍ?２ＳＩ?Ｏｉｌ?３１Ｓ??
Ｃ？ｎ＊ｅｒ．ｓｉｉ？?ｉ?ｄｐ?ｐ??图２－３草地早熟禾ＰｐＣＨＬｌ与其他植物ＣＨＬ的氨基酸序列多重比对??Ｆｉｇ．２－３?Ｍｕｌｔｉｐｌｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ａｌｉｇｎｍｅｎｔ?ｏｆ?ＰｐＣＨＬｌ?ｗｉｔｈ?ｏｔｈｅｒ?ｐｌａｎｔｓ?ＣＨＬ??尸．户ｍ妳访：草地早熟禾；。如／ｖｗｗ：乌拉尔图小麦；山羊草；Ｔｗｒａｒｒｗ：小麦；??蔡藜苜猜；乂从／／＜３７＾：拟南芥；Ａｔｏ＾ｃ／ｚｚＹ：节节麦．Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ：表示相同的序列，在序列下方用小写字??母表示。Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ?ｓｈｏｗｓ?ｔｈｅ?ｓａｍｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?ａｎｄ?ａｒｅ?ｌｉｓｔｅｄ?ｂｅｌｏｗ?ｉｎ?ｍｉｎｕｓｃｕｌｅ??为了深入了解草地早熟禾ＰｐＣＨＬｌ与其他植物ＣＨＬ之间的进化关系，将上述７??个ＣＨＬ的氨基酸序列，利用ＭＥＧＡ５．０软件对不同物种的蛋白进行了聚类分析，构??建了系统进化树（图２－４）。系统进化分析表明
【参考文献】：
期刊论文
[1]柑橘内参基因的稳定性评价[J]. 肖翠,严佳文,龙桂友,戴素明,李大志,邓子牛. 果树学报. 2012(06)
[2]植物蛋白质的亚细胞定位研究进展[J]. 邢浩然,刘丽娟,刘国振. 华北农学报. 2006(S2)
[3]茉莉酸类物质（JAs）的生理特性及其在逆境胁迫中的抗性作用[J]. 蔡昆争,董桃杏,徐涛. 生态环境. 2006(02)
博士论文
[1]拟南芥叶绿素降解相关基因NYE1、NYE2、CRN1的鉴定及其功能研究[D]. 任国栋.复旦大学 2009
硕士论文
[1]大叶落地生根KdSAHH基因功能鉴定[D]. 李珊珊.北京林业大学 2016
[2]紫花苜蓿锌指蛋白基因的克隆及初步鉴定[D]. 晁跃辉.重庆大学 2009
本文编号：3027979
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１草地早熟禾ＰｐＣＴ／Ｌ／基因的扩增结果??Ｆｉｇ．２－１?ｃＤＮＡ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＰｐＣＨＬｌ??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]柑橘内参基因的稳定性评价[J]. 肖翠,严佳文,龙桂友,戴素明,李大志,邓子牛. 果树学报. 2012(06)
[2]植物蛋白质的亚细胞定位研究进展[J]. 邢浩然,刘丽娟,刘国振. 华北农学报. 2006(S2)
[3]茉莉酸类物质（JAs）的生理特性及其在逆境胁迫中的抗性作用[J]. 蔡昆争,董桃杏,徐涛. 生态环境. 2006(02)
博士论文
[1]拟南芥叶绿素降解相关基因NYE1、NYE2、CRN1的鉴定及其功能研究[D]. 任国栋.复旦大学 2009
硕士论文
[1]大叶落地生根KdSAHH基因功能鉴定[D]. 李珊珊.北京林业大学 2016
[2]紫花苜蓿锌指蛋白基因的克隆及初步鉴定[D]. 晁跃辉.重庆大学 2009
本文编号：3027979
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