湖南省小西葫芦黄花叶病毒进化分析
发布时间：2021-02-25 15:38
植物病毒病害是湖南省瓜类作物生产的主要制约因素之一。2013-2015年期间在湖南省瓜类作物主要生产地区采集了9种瓜类作物共662份表现出病毒症状的叶片样品,并利用RT-PCR技术进行小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV）检测及鉴定。在对湖南瓜类作物病毒病调查中发现ZYMV发病率占据所有样品的54.5%,确定其为主要危害湖南瓜类作物的病毒。病毒多样性导致新株系的出现,常被认为是病毒流行的一个重要因素。在本研究中当分离获得的ZYMV完整的外壳蛋白（CP）的核苷酸序列进行系统发育分析,湖南序列位于分组,A-Ⅱ,A-Ⅲ和C-Ⅱ。分离得到的ZYMV完整的辅助蛋白（HC-Pro）的核苷酸的序列进行系统发育化分析。湖南株系位于分组A-Ⅰ和C。根据系统发育和计算分析,检测到在CP亚组AⅢ和CⅡ分离物之间存在重组事件。这是国内首次发现小西葫芦黄花叶病毒重组。中性测试中在CP编码蛋白区检测出1个正选择的位点,同时检测出CP与HC-Pro的20个负选择位点,故负选择是对ZYMV的CP和HC-Pro的基因操作的主要动力。总之,所有数据表明,ZYMV基因组的...
【文章来源】：湖南农业大学湖南省
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 瓜类作物病毒研究进展
1.1 瓜类作物以及为害瓜类作物的病毒
1.1.1 瓜类作物
1.1.2 国内外已报道的侵染瓜类作物的病毒
1.2 小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV）
1.2.1 马铃薯Y病毒科（Potyviridae）基因结构
1.2.2 ZYMV的传播方式
1.2.3 ZYMV的株系
1.2.4 ZYMV检测方法
1.2.5 ZYMV防治方法
1.2.6 研究目的及意义
第二章 湖南瓜类作物ZYMV检测
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 瓜类作物疑似病毒病叶片
2.2.2 实验试剂
2.2.3 实验仪器
2.2.4 溶剂与培养基配方见附录
2.2.5 实验方法
2.3 结果与分析
2.3.1 ZYMV生物学检测结果
2.3.2 湖南省瓜类作物对瓜类病毒ZYMV采用RT-PCR快速检测电泳图验证
2.4 小结与讨论
第三章 湖南省小西葫芦黄花叶病毒进化分析
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 植物材料
3.2.2 实验所需试剂
3.2.3 其他培养基以及化学试剂见附录
3.2.4 实验主要仪器设备
3.2.5 小西葫芦黄花叶病毒的CP基因全长序列与HC-Pro基因全长序列的获得
3.2.6 小西葫芦黄花叶病毒CP基因与HC-Pro基因进化分析
3.3 结果与分析
3.4 小结与讨论
第四章 总结
参考文献
附录
致谢
作者简介
发表论文附录
【参考文献】：
期刊论文
[1]葫芦科经济植物的分类及种质资源[J]. 林德佩. 中国瓜菜. 2010(05)
[2]侵染西瓜的5种病毒ZYMV、WMV、TMV、SqMV和CMV的多重RT-PCR检测体系的建立与检测应用[J]. 王威麟,张昊,于祥泉,吴云锋,张文波,张春平. 植物病理学报. 2010(01)
[3]小西葫芦黄花叶病毒在广西瓜类作物上的发生情况初报[J]. 秦碧霞,蔡健和,刘志明,黄福新,朱桂宁. 广西农业科学. 2004(04)
[4]小西葫芦黄花叶病毒外壳蛋白基因的克隆及序列分析[J]. 古勤生,范在丰,Piero Roggero,陈红运,俞正旺,李怀方. 植物病理学报. 2003(06)
[5]桃蚜可高效率地传播小西葫芦黄化花叶病毒新疆株[J]. 赵荣乐,郑光宇. 北京师范大学学报(自然科学版). 2003(03)
[6]甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较[J]. 李利君,周仲驹,谢联辉. 中国病毒学. 2001(01)
[7]不同CMV分离物侵染寄主的超微结构变化[J]. 洪健,陈集双,李德葆. 中国病毒学. 2000(01)
[8]马铃薯Y病毒属病毒的分子生物学研究进展[J]. 李向东,李怀方,范在丰. 微生物学通报. 1999(04)
[9]植物病毒的电镜诊断[J]. 洪健,陈集双,周雪平,李德葆. 电子显微学报. 1999(03)
[10]主要瓜类作物的抗病毒病育种(上)[J]. 王鸣,文生仓,阎友晖. 长江蔬菜. 1997(01)
本文编号：3051184
【文章来源】：湖南农业大学湖南省
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 瓜类作物病毒研究进展
1.1 瓜类作物以及为害瓜类作物的病毒
1.1.1 瓜类作物
1.1.2 国内外已报道的侵染瓜类作物的病毒
1.2 小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV）
1.2.1 马铃薯Y病毒科（Potyviridae）基因结构
1.2.2 ZYMV的传播方式
1.2.3 ZYMV的株系
1.2.4 ZYMV检测方法
1.2.5 ZYMV防治方法
1.2.6 研究目的及意义
第二章 湖南瓜类作物ZYMV检测
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 瓜类作物疑似病毒病叶片
2.2.2 实验试剂
2.2.3 实验仪器
2.2.4 溶剂与培养基配方见附录
2.2.5 实验方法
2.3 结果与分析
2.3.1 ZYMV生物学检测结果
2.3.2 湖南省瓜类作物对瓜类病毒ZYMV采用RT-PCR快速检测电泳图验证
2.4 小结与讨论
第三章 湖南省小西葫芦黄花叶病毒进化分析
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 植物材料
3.2.2 实验所需试剂
3.2.3 其他培养基以及化学试剂见附录
3.2.4 实验主要仪器设备
3.2.5 小西葫芦黄花叶病毒的CP基因全长序列与HC-Pro基因全长序列的获得
3.2.6 小西葫芦黄花叶病毒CP基因与HC-Pro基因进化分析
3.3 结果与分析
3.4 小结与讨论
第四章 总结
参考文献
附录
致谢
作者简介
发表论文附录
【参考文献】：
期刊论文
[1]葫芦科经济植物的分类及种质资源[J]. 林德佩. 中国瓜菜. 2010(05)
[2]侵染西瓜的5种病毒ZYMV、WMV、TMV、SqMV和CMV的多重RT-PCR检测体系的建立与检测应用[J]. 王威麟,张昊,于祥泉,吴云锋,张文波,张春平. 植物病理学报. 2010(01)
[3]小西葫芦黄花叶病毒在广西瓜类作物上的发生情况初报[J]. 秦碧霞,蔡健和,刘志明,黄福新,朱桂宁. 广西农业科学. 2004(04)
[4]小西葫芦黄花叶病毒外壳蛋白基因的克隆及序列分析[J]. 古勤生,范在丰,Piero Roggero,陈红运,俞正旺,李怀方. 植物病理学报. 2003(06)
[5]桃蚜可高效率地传播小西葫芦黄化花叶病毒新疆株[J]. 赵荣乐,郑光宇. 北京师范大学学报(自然科学版). 2003(03)
[6]甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较[J]. 李利君,周仲驹,谢联辉. 中国病毒学. 2001(01)
[7]不同CMV分离物侵染寄主的超微结构变化[J]. 洪健,陈集双,李德葆. 中国病毒学. 2000(01)
[8]马铃薯Y病毒属病毒的分子生物学研究进展[J]. 李向东,李怀方,范在丰. 微生物学通报. 1999(04)
[9]植物病毒的电镜诊断[J]. 洪健,陈集双,周雪平,李德葆. 电子显微学报. 1999(03)
[10]主要瓜类作物的抗病毒病育种(上)[J]. 王鸣,文生仓,阎友晖. 长江蔬菜. 1997(01)
本文编号：3051184
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