基于基因组数据解析大球盖菇交配型系统

发布时间：2021-03-24 01:01

　　大球盖菇Stropharia rugosoannulata是一种具有较强木质纤维素降解能力以及高营养的重要食用菌。此菌属于四极性异宗结合担子菌,但是交配型位点结构仍未被解析。本研究利用基因组数据通过生物信息学方法进行大球盖菇的A和B交配型位点解析,并与其他大型真菌进行比较。结果显示大球盖菇的A交配型位点包含了一对保守的HD1和HD2基因,位点上下游基因的共线性较高,与Galerina patagonica和砖红韧黑伞Hypholoma sublateritium相似度最高,A位点结构上也较为保守,在上下游具有保守的MIP、Sec61蛋白、甘氨酸脱氢酶和β侧翼蛋白。B位点包含5个信息素受体和3个信息素前体基因,与其他真菌相比较发现,B位点及上下游基因的共线性较差,表明在不同的真菌中B位点变异性较大。本研究所获得的结果将有助于诠释大球盖菇交配型位点结构,为今后的遗传育种提供了理论依据。 

【文章来源】：菌物学报. 2020,39(06)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

大球盖菇A交配型位点的结构

通过共线性分析发现，不同真菌B交配型上下游基因的共线性较差，信息素前体和信息素受体横跨的区域在大球盖菇、砖红韧黑伞、Galerina patagonica和灰盖鬼伞分别为9 476bp、5 867bp、7 770bp和48 995bp，在草菇基因组中跨度最大，仅仅在同一个scaffold上的PP1-STE3之间就达到了76 748bp。虽然它们之间的共线性相对较差，但是大球盖菇与砖红韧黑伞相似度更近，与灰盖鬼伞相比，结构组成完全不同，可见亲缘关系越近，共线性越好。图3 大球盖菇信息素前体的多序列比对

大球盖菇信息素前体的多序列比对


本文编号：3096746