森林草莓基因组中DNA甲基化修饰酶基因的鉴定及初步研究
发布时间：2021-04-05 23:52
DNA甲基化是植物重要的表观遗传修饰之一。目前,已发现DNA甲基化与植物的生长发育、形态建成等方面有着密切的联系,但是关于DNA甲基化对植物果实发育的影响,尤其是对非呼吸跃变型果实发育影响的研究很少。在本研究中,我们首先对森林草毒（Fragaria vesca）等作物中的DNA甲基化修饰基因进行了鉴定,发现森林草莓中有9个含DNA甲基转移酶结构域的基因（包括8个DNA甲基化酶基因,1个tRNA甲基化酶基因）,以及4个DNA去甲基化酶基因。对鉴定出的这些基因进行进化分析、结构域分析、motif结构、外显子结构等分析,发现也可分为与之前研究相一致的几类。森林草莓的甲基化酶分为四类,其中CMT3家族有3个,MET1家族有1个,DRM1/2家族有4个,甲基化tRNA的DNMT2家族有1个;DNA去甲基化酶有两类,其中DME家族有1个,DML（ROS1、DML2、DML3）家族有3个。前人研究表明,森林草莓从蔷薇科分化出来后,近期并未发生明显的基因复制事件,我们的Mcscan结果也发现:森林草莓中已鉴定出的这些基因,近期并未涉及全基因组扩张事件（Whole-genome duplications...
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
DNA甲基化酶和去甲基化酶基因在15个物种中的分布数目Figure2-1NumbersofinvestigatedgenesencodingDNAmethyltransferaseanddemethylaseinthe15species
２．２?ＤＮＡ甲基化修饰酶基因在森林草莓果实发育后期的表达情况分析??我们选取了草莓果实发育及成熟过程中的五个关键时期：大绿果期、白果期、转??色前期、粉果期、红果期（图３－２），并用ｑＲＴ－ＲＣＲ检测了草莓果实发育及成熟过程??中几个关键时期，ＤＮＡ甲基化酶基因和ＤＮＡ去甲基化酶基因的表达情况（图３－３）。??观察果实发育后期的表达情况（图３－３），发现八个ＤＮＡ甲基化酶中有三种??（抑－舰／办／〇從２，?Ｆｖ－ｗｅ／Ｚ＾／ｏｓ＃，Ｆｖ－ｗｃＹ／ｙ／ｔｅｅＰ）在转色前期表达量最高，三种??（Ｆｖ－嫌／％／ｏｓ’ｅ７，ｊＰｖ－ｗｅ／Ｚ＾／ａｓ＾，／＾－舰￣／似６５）在粉果期表达量最高。四个ＤＮＡ??去甲基化酶基因中有两个（Ｆｖ－Ｊｅｍｅ／Ｚ＾／ａｖｅ／，?Ｆｖ－ｔｆｅｗｅ／／２＿ｙ／ｏｓｘ，Ｊ）是在转色前期表达量??最高。从ＲＴ－ｑＲＣＲ结果整体来看，有很多ＤＮＡ甲基化酶和ＤＮＡ去甲基化酶基因都??是在转色前期或粉果期表达量最高
Ｆｖ－ｄｅｍｅｔｈｙｌａｓｅ１??Ｆｖ：ｄＩｍｌ！Ｓ！ａＩｅ４?ＤＭＥ－丨?ｉｋｅ（ＤＭＬ）??图３－３?ＤＮＡ甲基化酶基因和ＤＮＡ去甲基化酶基因在果实不同发育时期的表达情况??Ｆｉｇｕｒｅ３－３?Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｐｒｏｉｌｅｓ?ｏｆ?ＤＮＡ?ｍｅｔｈｙｌａｓｅ?ｇｅｎｅｓ?ａｎｄ?ＤＮＡ?ｄｅｍｅｔｈｙｌａｓｅ?ｇｅｎｅｓ??ｄｕｒｉｎｇ?ｆｒ
【参考文献】：
期刊论文
[1]盐胁迫对植物影响的研究进展[J]. 孙曰波,杨志莹,赵从凯. 潍坊高等职业教育. 2014(03)
[2]干旱胁迫对黄瓜幼苗叶绿素含量和光合特性的影响[J]. 吴顺,张雪芹,蔡燕. 中国农学通报. 2014(01)
[3]DNA甲基化在植物抗逆反应中的研究进展及其育种应用[J]. 黄菲,李雪梅,王文生,傅彬英. 中国农业科技导报. 2013(06)
[4]干旱胁迫下马铃薯幼苗DNA甲基化研究[J]. 李媛媛,程鹏,熊兴耀,洪亚辉. 中国马铃薯. 2012(01)
[5]5-氮杂胞苷对小麦生长发育及DNA甲基化的影响[J]. 陈芳,王子成. 河南大学学报(自然科学版). 2011(01)
[6]近30a黄淮海农作区冬小麦单产潜力的影响因素分析[J]. 王宏,陈阜,石全红,范士超,褚庆全. 农业工程学报. 2010(S1)
[7]DNA甲基化及其对植物发育的调控[J]. 关录飞,吴笑女,徐启江. 生物技术通讯. 2008(04)
[8]植物表观遗传与DNA甲基化[J]. 屠发志,彭世清. 生物技术通讯. 2007(01)
[9]盐胁迫对植物影响的研究进展[J]. 杨少辉,季静,王罡,宋英今. 分子植物育种. 2006(S1)
[10]水稻冷胁迫诱导的甲基化差异片段CIDM7的分离和分析[J]. 华扬,陈学峰,熊建华,张义平,朱英国. 遗传. 2005(04)
博士论文
[1]干旱胁迫诱导水稻产生可遗传表观遗传变异及其相关生理代谢变化的研究[D]. 张春玉.东北师范大学 2013
[2]玉米冷胁迫反应的表观调控机制[D]. 胡勇.武汉大学 2012
[3]萝卜春化作用及其与DNA甲基化水平的关系[D]. 汪炳良.浙江大学 2004
硕士论文
[1]全基因组DNA甲基化对甘蓝型油菜春化作用的影响[D]. 高金燕.郑州大学 2012
[2]干旱胁迫及海水栽培对茄子生长和生理特性的影响[D]. 王建国.南京农业大学 2008
本文编号：3120338
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
DNA甲基化酶和去甲基化酶基因在15个物种中的分布数目Figure2-1NumbersofinvestigatedgenesencodingDNAmethyltransferaseanddemethylaseinthe15species
２．２?ＤＮＡ甲基化修饰酶基因在森林草莓果实发育后期的表达情况分析??我们选取了草莓果实发育及成熟过程中的五个关键时期：大绿果期、白果期、转??色前期、粉果期、红果期（图３－２），并用ｑＲＴ－ＲＣＲ检测了草莓果实发育及成熟过程??中几个关键时期，ＤＮＡ甲基化酶基因和ＤＮＡ去甲基化酶基因的表达情况（图３－３）。??观察果实发育后期的表达情况（图３－３），发现八个ＤＮＡ甲基化酶中有三种??（抑－舰／办／〇從２，?Ｆｖ－ｗｅ／Ｚ＾／ｏｓ＃，Ｆｖ－ｗｃＹ／ｙ／ｔｅｅＰ）在转色前期表达量最高，三种??（Ｆｖ－嫌／％／ｏｓ’ｅ７，ｊＰｖ－ｗｅ／Ｚ＾／ａｓ＾，／＾－舰￣／似６５）在粉果期表达量最高。四个ＤＮＡ??去甲基化酶基因中有两个（Ｆｖ－Ｊｅｍｅ／Ｚ＾／ａｖｅ／，?Ｆｖ－ｔｆｅｗｅ／／２＿ｙ／ｏｓｘ，Ｊ）是在转色前期表达量??最高。从ＲＴ－ｑＲＣＲ结果整体来看，有很多ＤＮＡ甲基化酶和ＤＮＡ去甲基化酶基因都??是在转色前期或粉果期表达量最高
Ｆｖ－ｄｅｍｅｔｈｙｌａｓｅ１??Ｆｖ：ｄＩｍｌ！Ｓ！ａＩｅ４?ＤＭＥ－丨?ｉｋｅ（ＤＭＬ）??图３－３?ＤＮＡ甲基化酶基因和ＤＮＡ去甲基化酶基因在果实不同发育时期的表达情况??Ｆｉｇｕｒｅ３－３?Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｐｒｏｉｌｅｓ?ｏｆ?ＤＮＡ?ｍｅｔｈｙｌａｓｅ?ｇｅｎｅｓ?ａｎｄ?ＤＮＡ?ｄｅｍｅｔｈｙｌａｓｅ?ｇｅｎｅｓ??ｄｕｒｉｎｇ?ｆｒ
【参考文献】：
期刊论文
[1]盐胁迫对植物影响的研究进展[J]. 孙曰波,杨志莹,赵从凯. 潍坊高等职业教育. 2014(03)
[2]干旱胁迫对黄瓜幼苗叶绿素含量和光合特性的影响[J]. 吴顺,张雪芹,蔡燕. 中国农学通报. 2014(01)
[3]DNA甲基化在植物抗逆反应中的研究进展及其育种应用[J]. 黄菲,李雪梅,王文生,傅彬英. 中国农业科技导报. 2013(06)
[4]干旱胁迫下马铃薯幼苗DNA甲基化研究[J]. 李媛媛,程鹏,熊兴耀,洪亚辉. 中国马铃薯. 2012(01)
[5]5-氮杂胞苷对小麦生长发育及DNA甲基化的影响[J]. 陈芳,王子成. 河南大学学报(自然科学版). 2011(01)
[6]近30a黄淮海农作区冬小麦单产潜力的影响因素分析[J]. 王宏,陈阜,石全红,范士超,褚庆全. 农业工程学报. 2010(S1)
[7]DNA甲基化及其对植物发育的调控[J]. 关录飞,吴笑女,徐启江. 生物技术通讯. 2008(04)
[8]植物表观遗传与DNA甲基化[J]. 屠发志,彭世清. 生物技术通讯. 2007(01)
[9]盐胁迫对植物影响的研究进展[J]. 杨少辉,季静,王罡,宋英今. 分子植物育种. 2006(S1)
[10]水稻冷胁迫诱导的甲基化差异片段CIDM7的分离和分析[J]. 华扬,陈学峰,熊建华,张义平,朱英国. 遗传. 2005(04)
博士论文
[1]干旱胁迫诱导水稻产生可遗传表观遗传变异及其相关生理代谢变化的研究[D]. 张春玉.东北师范大学 2013
[2]玉米冷胁迫反应的表观调控机制[D]. 胡勇.武汉大学 2012
[3]萝卜春化作用及其与DNA甲基化水平的关系[D]. 汪炳良.浙江大学 2004
硕士论文
[1]全基因组DNA甲基化对甘蓝型油菜春化作用的影响[D]. 高金燕.郑州大学 2012
[2]干旱胁迫及海水栽培对茄子生长和生理特性的影响[D]. 王建国.南京农业大学 2008
本文编号：3120338
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