黄肉苹果类胡萝卜素合成相关基因的表达研究
发布时间：2021-05-10 19:46
苹果果实色泽是评价果实商品性的关键指标,也关系着果实的营养保健功能,果实最终色泽主要由类胡萝卜素、叶绿素、花青素、类黄酮等色素的相对含量决定。苹果中类胡萝卜素研究时间短,研究基础薄弱,但类胡萝卜素对于苹果品质具有重要地位,因此对苹果类胡萝卜素合成相关基因表达的研究,将为高品质育种提供重要的理论依据。本文采用色差计测定苹果生长发育过程中色泽值,采用比色法测量类胡萝卜素及其他果皮色素含量,分析果皮色素、色差的变化及其相关性;通过采用多种苹果试材、选用多种方法进行RNA提取并进行质量检测,筛选出了适用于转录组测序的苹果果实RNA提取方法;对‘东北黄海棠’转色期前后果实进行转录组测序,对转录组数据进行验证,并分析果实发育过程中果皮、果肉类胡萝卜素合成相关基因表达量,结合类胡萝卜素含量变化筛选与类胡萝卜素代谢显著相关基因。本文的主要结果和结论如下:黄色种质‘东北黄海棠’、红色种质‘冬红果’、白色种质‘早白海棠’苹果发育过程中果皮类胡萝卜素、叶绿素、总酚和类黄酮整体呈降低趋势,类胡萝卜素、叶绿素在‘东北黄海棠’近成熟期含量略有上升;类胡萝卜素与叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素、花青素、类黄酮、总酚以及...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 类胡萝卜素概述
1.1.1 类胡萝卜素的种类和结构
1.1.2 类胡萝卜素的性质和功能
1.1.3 类胡萝卜素的合成与代谢
1.1.4 影响类胡萝卜素合成及积累的因素
1.2 苹果中类胡萝卜素含量的研究现状
1.3 转录组测序在果树中的应用
1.4 研究目的和意义
第二章 试验材料与方法
2.1 试验材料
2.2 试验方法
2.2.1 果实发育期间果皮类胡萝卜素及其他色素含量的测定
2.2.2 果皮色泽测定
2.2.3 苹果果实RNA的提取
2.2.4 转录组测序及数据验证
2.2.5 类胡萝卜素合成相关基因表达量检测
2.2.6 MdCCD4基因克隆
2.2.7 数据处理方法
第三章 结果与分析
3.1 果实发育期间果皮类胡萝卜素的变化
3.1.1 果实发育期间果皮色素、色泽变化
3.1.2 果实发育期间果皮类胡萝卜素与其他色素、色泽之间的关系
3.2 苹果果实RNA提取的方法筛选
3.2.1 RNA电泳结果
3.2.2 RNA浓度纯度、测序质量评估
3.3 转录组分析
3.3.1 转录组测序质量控制
3.3.2 果实转色前后转录组显著差异分析、Gene Ontology功能注释
3.3.3 果实转色前后表达差异基因Pathway分析
3.3.4 两个发育时期差异转录因子分类与注释
3.3.5 两个发育时期七个差异表达基因qRT-PCR分析
3.4 ‘晚白海棠’‘东北黄海棠’类胡萝卜素测定以及合成相关基因表达分析
3.5 ‘晚白海棠’‘东北黄海棠’类胡萝卜素降解基因表达分析
3.6 PSY和CCD基因分析
3.6.1 八氢番茄红素合成酶基因（PSY）分析
3.6.2 类胡萝卜素双加氧酶基因（CCD4）分析
第四章 讨论
4.1 类胡萝卜素等色素在苹果中的含量与相关关系
4.2 适合转录组测序的苹果果实RNA提取的方法
4.3 类胡萝卜素代谢相关基因及转录因子的分析
第五章 全文结论
参考文献
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]两种不同肉色枇杷果实类胡萝卜素积累及合成相关基因的表达[J]. 张玲,郑婷婷,魏伟淋,朱云美,高用顺,杨向晖,林顺权. 园艺学报. 2015(11)
[2]黔中地区不同品种苹果果皮色素类物质的含量变化[J]. 袁启凤,卢星谕,仲伟敏,宋莎,马玉华. 贵州农业科学. 2015(08)
[3]新疆红肉苹果发育期间花青素代谢的研究[J]. 谢兵,周杰,朱树华. 山东农业科学. 2015(08)
[4]桃果实花色素苷积累与ABP1、ARF6表达分析[J]. 焦云,马瑞娟,沈志军,严娟,俞明亮. 中国南方果树. 2015(01)
[5]“鲁加”系列苹果果实发育期酚类和果皮色素含量变化研究[J]. 宋伊真,张玉刚,祝军,戴洪义. 北方园艺. 2014(24)
[6]胡萝卜中类胡萝卜素积累与主要合成基因转录水平相关性分析[J]. 王慧,欧承刚,庄飞云,赵志伟,马振国. 园艺学报. 2014(12)
[7]不同砧穗组合的苹果果实总酚、类黄酮和果皮色素含量变化的研究[J]. 宋伊真,王芝云,沙广利,张玉刚,祝军,戴洪义. 青岛农业大学学报(自然科学版). 2014(03)
[8]钾肥对富士苹果着色的影响及机理[J]. 姜学玲,徐维华,李延菊,张振英,唐美玲,刘美英. 中国农业科学. 2014(05)
[9]2012年全球主要水果生产变化简析（一）[J]. 张放. 中国果业信息. 2014(02)
[10]RNA-Seq在果树学研究中的应用[J]. 冯超,朱长青,徐昌杰,陈昆松. 果树学报. 2014(01)
博士论文
[1]柑橘类胡萝卜素的结构分析及构效关系研究[D]. 傅虹飞.华中农业大学 2010
硕士论文
[1]基于RNA-seq测序的梅花转录组分析[D]. 石文芳.北京林业大学 2012
本文编号：3179953
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 类胡萝卜素概述
1.1.1 类胡萝卜素的种类和结构
1.1.2 类胡萝卜素的性质和功能
1.1.3 类胡萝卜素的合成与代谢
1.1.4 影响类胡萝卜素合成及积累的因素
1.2 苹果中类胡萝卜素含量的研究现状
1.3 转录组测序在果树中的应用
1.4 研究目的和意义
第二章 试验材料与方法
2.1 试验材料
2.2 试验方法
2.2.1 果实发育期间果皮类胡萝卜素及其他色素含量的测定
2.2.2 果皮色泽测定
2.2.3 苹果果实RNA的提取
2.2.4 转录组测序及数据验证
2.2.5 类胡萝卜素合成相关基因表达量检测
2.2.6 MdCCD4基因克隆
2.2.7 数据处理方法
第三章 结果与分析
3.1 果实发育期间果皮类胡萝卜素的变化
3.1.1 果实发育期间果皮色素、色泽变化
3.1.2 果实发育期间果皮类胡萝卜素与其他色素、色泽之间的关系
3.2 苹果果实RNA提取的方法筛选
3.2.1 RNA电泳结果
3.2.2 RNA浓度纯度、测序质量评估
3.3 转录组分析
3.3.1 转录组测序质量控制
3.3.2 果实转色前后转录组显著差异分析、Gene Ontology功能注释
3.3.3 果实转色前后表达差异基因Pathway分析
3.3.4 两个发育时期差异转录因子分类与注释
3.3.5 两个发育时期七个差异表达基因qRT-PCR分析
3.4 ‘晚白海棠’‘东北黄海棠’类胡萝卜素测定以及合成相关基因表达分析
3.5 ‘晚白海棠’‘东北黄海棠’类胡萝卜素降解基因表达分析
3.6 PSY和CCD基因分析
3.6.1 八氢番茄红素合成酶基因（PSY）分析
3.6.2 类胡萝卜素双加氧酶基因（CCD4）分析
第四章 讨论
4.1 类胡萝卜素等色素在苹果中的含量与相关关系
4.2 适合转录组测序的苹果果实RNA提取的方法
4.3 类胡萝卜素代谢相关基因及转录因子的分析
第五章 全文结论
参考文献
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]两种不同肉色枇杷果实类胡萝卜素积累及合成相关基因的表达[J]. 张玲,郑婷婷,魏伟淋,朱云美,高用顺,杨向晖,林顺权. 园艺学报. 2015(11)
[2]黔中地区不同品种苹果果皮色素类物质的含量变化[J]. 袁启凤,卢星谕,仲伟敏,宋莎,马玉华. 贵州农业科学. 2015(08)
[3]新疆红肉苹果发育期间花青素代谢的研究[J]. 谢兵,周杰,朱树华. 山东农业科学. 2015(08)
[4]桃果实花色素苷积累与ABP1、ARF6表达分析[J]. 焦云,马瑞娟,沈志军,严娟,俞明亮. 中国南方果树. 2015(01)
[5]“鲁加”系列苹果果实发育期酚类和果皮色素含量变化研究[J]. 宋伊真,张玉刚,祝军,戴洪义. 北方园艺. 2014(24)
[6]胡萝卜中类胡萝卜素积累与主要合成基因转录水平相关性分析[J]. 王慧,欧承刚,庄飞云,赵志伟,马振国. 园艺学报. 2014(12)
[7]不同砧穗组合的苹果果实总酚、类黄酮和果皮色素含量变化的研究[J]. 宋伊真,王芝云,沙广利,张玉刚,祝军,戴洪义. 青岛农业大学学报(自然科学版). 2014(03)
[8]钾肥对富士苹果着色的影响及机理[J]. 姜学玲,徐维华,李延菊,张振英,唐美玲,刘美英. 中国农业科学. 2014(05)
[9]2012年全球主要水果生产变化简析（一）[J]. 张放. 中国果业信息. 2014(02)
[10]RNA-Seq在果树学研究中的应用[J]. 冯超,朱长青,徐昌杰,陈昆松. 果树学报. 2014(01)
博士论文
[1]柑橘类胡萝卜素的结构分析及构效关系研究[D]. 傅虹飞.华中农业大学 2010
硕士论文
[1]基于RNA-seq测序的梅花转录组分析[D]. 石文芳.北京林业大学 2012
本文编号：3179953
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