甘蓝显性蜡质缺失基因BoGL-3的精细定位与候选基因分析
发布时间：2021-05-24 13:58
结球甘蓝（Brassica oleracea L.var.capitata L.）简称甘蓝,属于十字花科芸薹属植物,其营养丰富、适应性强,是一种重要的栽培蔬菜。叶球颜色是甘蓝重要的品质性状,甘蓝蜡质缺失突变体由于表皮蜡质的缺失,球叶表现为亮绿色,具有较好的商品性。蜡质缺失突变体研究对于深入理解植物蜡质合成调控途径和亮绿甘蓝种质创新具有重要的意义。本研究以甘蓝显性蜡质缺失突变体cgl-3为材料,对显性蜡质缺失基因BoGL-3进行了精细定位,并对定位区段内的基因进行了分析,为BoGL-3的克隆和功能验证奠定了基础。研究结果如下:1.以蜡质缺失甘蓝cgl-3和普通芥蓝DH系939为双亲构建六世代群体,F1和BC1P1植株全部表现为蜡质缺失;F2群体和BC1P2群体中的蜡质缺失植株与正常植株分别符合3:1和1:1的分离比,进一步证明突变体cgl-3的蜡质缺失性状为单基因显性遗传。2.根据BSA法筛选多态性标记并利用F2群体的隐性单株对蜡质缺失...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
英文缩略表
第一章 引言
1.1 植物表皮蜡质研究进展
1.1.1 表皮蜡质功能
1.1.2 植物蜡质结构
1.1.3 植物蜡质的化学组成与含量
1.1.4 植物蜡质的生物合成
1.1.5 植物蜡质的调控
1.2 芸薹属植物蜡质缺失突变体研究进展
1.3 RNA-seq在芸薹属植物研究中的应用
1.3.1 分子标记的开发及辅助育种
1.3.2 探索植物发育的分子调控机理
1.3.3 基因发掘
1.4 本研究目的意义
第二章 蜡质缺失基因的定位
2.1 试验材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 DNA提取
2.1.3 基因定位
2.2 结果与分析
2.2.1 引物筛选
2.2.2 基因定位
2.3 讨论
第三章 蜡质缺失突变体的转录组分析
3.1 试验方法
3.1.1 参考基因组分析
3.1.2 RNA-seq分析
3.2 试验结果与分析
3.2.1 参考基因组注释结果
3.2.2 RNA提取和检测结果
3.2.3 转录组测序结果
3.3 讨论
第四章 显性蜡质缺失体候选基因分析
4.1 实验材料
4.2 实验方法
4.2.1 候选基因亚细胞定位分析
4.2.2 候选基因编码蛋白的性质分析
4.2.3 候选基因荧光定量PCR以及PCR检测
4.3 实验结果
4.3.1 候选基因编码蛋白的亚细胞定位结果
4.3.2 候选基因编码蛋白的分析
4.3.3 荧光定量PCR以及PCR检测
4.4 讨论
第五章 全文结论
参考文献
附录
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]转录组分析挖掘油菜耐旱基因[J]. 王冰,王勤方,唐天向,唐伟杰,李丽萍,隋丽波,孙超,张慧,夏张婷,林良斌. 基因组学与应用生物学. 2018(11)
[2]植物蜡质研究进展[J]. 王春语,张丽霞,高国珍. 辽宁农业科学. 2018(05)
[3]花椰菜转录组SSR位点分析及其分子标记开发[J]. 林珲,李永平,薛珠政,陈敏氡,朱海生,温庆放. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2019(03)
[4]小麦不同器官表皮蜡质的组分及晶体结构分析[J]. 赵帅,罗文巧,王聪,吴洪启,汪勇,王中华,权力. 麦类作物学报. 2018(08)
[5]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释[J]. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 核农学报. 2018(05)
[6]甘蓝型油菜种子发育灌浆后期的转录组分析[J]. 熊辉岩,段瑞君,王瑞生,孟庆志. 分子植物育种. 2018(15)
[7]草地早熟禾叶表皮蜡质及其对海拔变化的响应[J]. 姚露花,倪郁,郭娜,和玉吉,高建花,郭彦军. 草业学报. 2018(01)
[8]新型紫色大白菜15NG28后代的鉴别及其转录组分析[J]. 张德双,赵泓,张凤兰,余阳俊,赵岫云,于拴仓,汪维红,苏同兵,卢桂香. 华北农学报. 2017(06)
[9]大白菜花发育不同时期的转录组研究[J]. 李改珍,齐仙惠,李梅兰,赵军良,王秀英,巫东堂. 山西农业大学学报(自然科学版). 2017(10)
[10]OsWR2-RNAi对水稻角质层生物合成和耐旱性的影响[J]. 王莎,贺勇,罗光宇,姚敏,张旭,陈信波,周小云. 作物学报. 2017(03)
硕士论文
[1]高浓度CO2调控表皮蜡质合成的研究[D]. 刘秀林.中国科学院武汉植物园 2017
[2]结球甘蓝亮绿性状遗传与基因的精细定位[D]. 唐俊.中国农业科学院 2015
[3]红菜薹蜡粉性状遗传分析与基因初步定位[D]. 李红莲.华中农业大学 2014
[4]结球甘蓝无蜡粉亮绿性状遗传分析及分子标记研究[D]. 李景涛.中国农业科学院 2012
本文编号：3204306
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
英文缩略表
第一章 引言
1.1 植物表皮蜡质研究进展
1.1.1 表皮蜡质功能
1.1.2 植物蜡质结构
1.1.3 植物蜡质的化学组成与含量
1.1.4 植物蜡质的生物合成
1.1.5 植物蜡质的调控
1.2 芸薹属植物蜡质缺失突变体研究进展
1.3 RNA-seq在芸薹属植物研究中的应用
1.3.1 分子标记的开发及辅助育种
1.3.2 探索植物发育的分子调控机理
1.3.3 基因发掘
1.4 本研究目的意义
第二章 蜡质缺失基因的定位
2.1 试验材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 DNA提取
2.1.3 基因定位
2.2 结果与分析
2.2.1 引物筛选
2.2.2 基因定位
2.3 讨论
第三章 蜡质缺失突变体的转录组分析
3.1 试验方法
3.1.1 参考基因组分析
3.1.2 RNA-seq分析
3.2 试验结果与分析
3.2.1 参考基因组注释结果
3.2.2 RNA提取和检测结果
3.2.3 转录组测序结果
3.3 讨论
第四章 显性蜡质缺失体候选基因分析
4.1 实验材料
4.2 实验方法
4.2.1 候选基因亚细胞定位分析
4.2.2 候选基因编码蛋白的性质分析
4.2.3 候选基因荧光定量PCR以及PCR检测
4.3 实验结果
4.3.1 候选基因编码蛋白的亚细胞定位结果
4.3.2 候选基因编码蛋白的分析
4.3.3 荧光定量PCR以及PCR检测
4.4 讨论
第五章 全文结论
参考文献
附录
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]转录组分析挖掘油菜耐旱基因[J]. 王冰,王勤方,唐天向,唐伟杰,李丽萍,隋丽波,孙超,张慧,夏张婷,林良斌. 基因组学与应用生物学. 2018(11)
[2]植物蜡质研究进展[J]. 王春语,张丽霞,高国珍. 辽宁农业科学. 2018(05)
[3]花椰菜转录组SSR位点分析及其分子标记开发[J]. 林珲,李永平,薛珠政,陈敏氡,朱海生,温庆放. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2019(03)
[4]小麦不同器官表皮蜡质的组分及晶体结构分析[J]. 赵帅,罗文巧,王聪,吴洪启,汪勇,王中华,权力. 麦类作物学报. 2018(08)
[5]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释[J]. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 核农学报. 2018(05)
[6]甘蓝型油菜种子发育灌浆后期的转录组分析[J]. 熊辉岩,段瑞君,王瑞生,孟庆志. 分子植物育种. 2018(15)
[7]草地早熟禾叶表皮蜡质及其对海拔变化的响应[J]. 姚露花,倪郁,郭娜,和玉吉,高建花,郭彦军. 草业学报. 2018(01)
[8]新型紫色大白菜15NG28后代的鉴别及其转录组分析[J]. 张德双,赵泓,张凤兰,余阳俊,赵岫云,于拴仓,汪维红,苏同兵,卢桂香. 华北农学报. 2017(06)
[9]大白菜花发育不同时期的转录组研究[J]. 李改珍,齐仙惠,李梅兰,赵军良,王秀英,巫东堂. 山西农业大学学报(自然科学版). 2017(10)
[10]OsWR2-RNAi对水稻角质层生物合成和耐旱性的影响[J]. 王莎,贺勇,罗光宇,姚敏,张旭,陈信波,周小云. 作物学报. 2017(03)
硕士论文
[1]高浓度CO2调控表皮蜡质合成的研究[D]. 刘秀林.中国科学院武汉植物园 2017
[2]结球甘蓝亮绿性状遗传与基因的精细定位[D]. 唐俊.中国农业科学院 2015
[3]红菜薹蜡粉性状遗传分析与基因初步定位[D]. 李红莲.华中农业大学 2014
[4]结球甘蓝无蜡粉亮绿性状遗传分析及分子标记研究[D]. 李景涛.中国农业科学院 2012
本文编号：3204306
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