miR156-SPL模式调控苹果耐盐性的研究
发布时间：2021-06-02 17:09
苹果（Malus domestica）是蔷薇科苹果属的一种多年生落叶乔木,在我国种植范围较广。近年来全球土地的盐渍化和次生盐渍化现象也越来越严重,盐胁迫严重影响着苹果的质量和产量。本实验室前期对耐盐的‘寒富’苹果同源四倍体及‘寒富’苹果进行数字表达谱和小RNA组测序分析发现miR156-SPL模式表达水平呈现显著差异。已有报道miR156-SPL模式参与调控植株形态建成、阶段转变、花和果实的发育等多个生理生化过程。本研究以苹果miR156a和MdSPL3基因作为研究对象,探究两者在盐胁迫作用下调控苹果耐盐性的机制。主要研究结果如下:1.‘寒富’苹果同源四倍体植株叶片宽厚、颜色深绿,其叶片的光合特性和叶绿素荧光参数明显优于二倍体;盐胁迫处理下,‘寒富’苹果同源四倍体的耐盐性要明显强于二倍体。miR156a和MdSPL3基因在‘寒富’苹果及其同源四倍体叶片中差异表达,且miR156a和MdSPL3基因的表达均受盐胁迫的影响。RLM-5’RACE结果表明MdSPL3基因转录本3’UTR区域有miR156a靶位点,且该切割位点在miR156a的5’端的第10和11位的C和U碱基之间。证明苹果m...
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：106 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
RNA-seq实验流程（祁云霞等，2011）
Fig.2 Process of RNA-seq2.2.14.3 生物信息学分析生物信息学分析流程如图3所示：获得高质量的测序数据之后，利用各种软件的分析获得Unigene的注释信息；之后运用WEGO软件（http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl）进行GO基因功能分类；采用DE-Seq进行样品组间的差异表达分析，获得样品之间的差异表达基因（Differentially Expressed Gene，DEG）集；采用Benjamini-Hochberg方法进行校正。
图 4 ‘寒富’苹果及其同源四倍体植株形态差异A：一年生‘寒富’苹果及其同源四倍体幼苗；B：二年生‘寒富’苹果及其同源四倍体幼苗Fig.4 The morphological differences of plants in diploid and autotetraploid ‘Hanfu’ apple One-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’apple seedlings; B:Two-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’aplants1.2 ‘寒富’苹果及其同源四倍体叶片的形态差异‘寒富’苹果及其同源四倍体幼苗在叶片形态上表现出明显的不同。如图1所示，与体相比，‘寒富’苹果同源四倍体植株的叶片宽厚，叶色深绿。如表9所示，与二倍体
【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米转录因子ZmSPL16的克隆与功能鉴定[J]. 崔扬,冯彦辉,陈众峰,王晓敏,王云鹏,杜贤章. 分子植物育种. 2019(20)
[2]NaCl对旱柳生长发育及部分生理特性的影响[J]. 李斌彬,欧阳洁,王嘉玥,吴航枫,刘祥君,邹金华. 天津师范大学学报(自然科学版). 2017(06)
[3]苹果‘长富2号’开花调控转录因子基因MdSPL6的克隆及表达分析[J]. 樊胜,张岚清,刘柯,雷超,陈欣,姚殿城,张东,韩明玉. 园艺学报. 2016(11)
[4]苹果MdSBP20基因抗非生物胁迫的研究[J]. 沙婷,侯鸿敏,孟祥娜,柏素花,周爱琴,沙广利,戴洪义,祝军. 华北农学报. 2016(03)
[5]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析[J]. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 中国农业科学. 2015(16)
[6]植物转录因子家族在耐盐抗旱调控网络中的作用[J]. 李田,孙景宽,刘京涛. 生命科学. 2015(02)
[7]盐胁迫下氮素形态对油菜和水稻幼苗离子运输和分布的影响[J]. 刘梅,郑青松,刘兆普,郭世伟. 植物营养与肥料学报. 2015(01)
[8]水稻OsWRKY转录因子对非生物胁迫响应的重叠表达特性分析[J]. 孙利军,黄磊,李大勇,张慧娟,宋凤鸣. 植物生理学报. 2014(11)
[9]果树耐盐性研究进展[J]. 靳娟,鲁晓燕,王依. 园艺学报. 2014(09)
[10]苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆[J]. 张晓辉,魏小春,李锡香,孙玉燕,王冠,常兆晶,刘冠群,邱杨,宋江萍,王海平,沈镝,王大江,韩月澎. 园艺学报. 2014(02)
博士论文
[1]苹果红肉位点基因MdMYB10调控硝酸盐吸收和分配的机理研究[D]. 刘鑫.山东农业大学 2017
[2]棉花衰老相关WRKY基因的克隆与功能分析[D]. 窦玲玲.西北农林科技大学 2016
[3]旱地棉（Gossypium aridum）耐盐相关WRKY转录因子的全基因组鉴定、克隆及功能分析[D]. 范昕琦.南京农业大学 2015
[4]黄瓜低温胁迫应答转录因子CsWRKY46和CsWRKY21的表达特征与功能分析[D]. 张颖.中国农业科学院 2012
[5]草莓和苹果DNA甲基转移酶基因分离及表达分析[D]. 常琳琳.沈阳农业大学 2009
[6]苹果叶片离体再生不定芽及遗传转化的研究[D]. 张志宏.沈阳农业大学 1996
硕士论文
[1]苹果MdWRKY33基因的克隆与功能分析[D]. 张远嬿.沈阳农业大学 2018
[2]百合体胚发生过程中miR171及其靶基因SCL6的鉴定与表达分析[D]. 贾娜娜.沈阳农业大学 2016
[3]番茄果实后熟与叶片衰老相关的S1WRKY转录因子功能分析[D]. 王璐.华南农业大学 2016
[4]苹果高效遗传转化体系建立及转miR156和rSPL9基因的研究[D]. 李文然.沈阳农业大学 2013
[5]玉米ZmWRKY4参与ZmMPK5调节的抗氧化防护[D]. 洪长勇.南京农业大学 2012
本文编号：3210423
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：106 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
RNA-seq实验流程（祁云霞等，2011）
Fig.2 Process of RNA-seq2.2.14.3 生物信息学分析生物信息学分析流程如图3所示：获得高质量的测序数据之后，利用各种软件的分析获得Unigene的注释信息；之后运用WEGO软件（http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl）进行GO基因功能分类；采用DE-Seq进行样品组间的差异表达分析，获得样品之间的差异表达基因（Differentially Expressed Gene，DEG）集；采用Benjamini-Hochberg方法进行校正。
图 4 ‘寒富’苹果及其同源四倍体植株形态差异A：一年生‘寒富’苹果及其同源四倍体幼苗；B：二年生‘寒富’苹果及其同源四倍体幼苗Fig.4 The morphological differences of plants in diploid and autotetraploid ‘Hanfu’ apple One-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’apple seedlings; B:Two-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’aplants1.2 ‘寒富’苹果及其同源四倍体叶片的形态差异‘寒富’苹果及其同源四倍体幼苗在叶片形态上表现出明显的不同。如图1所示，与体相比，‘寒富’苹果同源四倍体植株的叶片宽厚，叶色深绿。如表9所示，与二倍体
【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米转录因子ZmSPL16的克隆与功能鉴定[J]. 崔扬,冯彦辉,陈众峰,王晓敏,王云鹏,杜贤章. 分子植物育种. 2019(20)
[2]NaCl对旱柳生长发育及部分生理特性的影响[J]. 李斌彬,欧阳洁,王嘉玥,吴航枫,刘祥君,邹金华. 天津师范大学学报(自然科学版). 2017(06)
[3]苹果‘长富2号’开花调控转录因子基因MdSPL6的克隆及表达分析[J]. 樊胜,张岚清,刘柯,雷超,陈欣,姚殿城,张东,韩明玉. 园艺学报. 2016(11)
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[6]植物转录因子家族在耐盐抗旱调控网络中的作用[J]. 李田,孙景宽,刘京涛. 生命科学. 2015(02)
[7]盐胁迫下氮素形态对油菜和水稻幼苗离子运输和分布的影响[J]. 刘梅,郑青松,刘兆普,郭世伟. 植物营养与肥料学报. 2015(01)
[8]水稻OsWRKY转录因子对非生物胁迫响应的重叠表达特性分析[J]. 孙利军,黄磊,李大勇,张慧娟,宋凤鸣. 植物生理学报. 2014(11)
[9]果树耐盐性研究进展[J]. 靳娟,鲁晓燕,王依. 园艺学报. 2014(09)
[10]苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆[J]. 张晓辉,魏小春,李锡香,孙玉燕,王冠,常兆晶,刘冠群,邱杨,宋江萍,王海平,沈镝,王大江,韩月澎. 园艺学报. 2014(02)
博士论文
[1]苹果红肉位点基因MdMYB10调控硝酸盐吸收和分配的机理研究[D]. 刘鑫.山东农业大学 2017
[2]棉花衰老相关WRKY基因的克隆与功能分析[D]. 窦玲玲.西北农林科技大学 2016
[3]旱地棉（Gossypium aridum）耐盐相关WRKY转录因子的全基因组鉴定、克隆及功能分析[D]. 范昕琦.南京农业大学 2015
[4]黄瓜低温胁迫应答转录因子CsWRKY46和CsWRKY21的表达特征与功能分析[D]. 张颖.中国农业科学院 2012
[5]草莓和苹果DNA甲基转移酶基因分离及表达分析[D]. 常琳琳.沈阳农业大学 2009
[6]苹果叶片离体再生不定芽及遗传转化的研究[D]. 张志宏.沈阳农业大学 1996
硕士论文
[1]苹果MdWRKY33基因的克隆与功能分析[D]. 张远嬿.沈阳农业大学 2018
[2]百合体胚发生过程中miR171及其靶基因SCL6的鉴定与表达分析[D]. 贾娜娜.沈阳农业大学 2016
[3]番茄果实后熟与叶片衰老相关的S1WRKY转录因子功能分析[D]. 王璐.华南农业大学 2016
[4]苹果高效遗传转化体系建立及转miR156和rSPL9基因的研究[D]. 李文然.沈阳农业大学 2013
[5]玉米ZmWRKY4参与ZmMPK5调节的抗氧化防护[D]. 洪长勇.南京农业大学 2012
本文编号：3210423
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