番茄果实主要糖酸成分全基因组关联分析
发布时间：2021-06-25 01:30
糖酸含量是影响番茄果实品质特性的关键指标之一。在长期的育种研究中,一般用可溶性固形物来间接反映番茄果实中的总糖分,利用可滴定酸来反映有机酸的含量。番茄果实糖酸性状是一个典型的由多基因控制的数量性状,国内外针对番茄果实具体糖酸组分的QTL研究十分有限。本研究以174份具有广泛代表性的番茄种质为研究材料,对2014年的番茄红熟期果实中的主要糖酸组分利用气质联用仪进行了测定;利用182对覆盖番茄全基因组的SSR标记对本试验群体进行了分子标记,并对该群体的遗传多样性、群体结构、连锁不平衡进行了分析;最后利用182对SSR标记对番茄主要糖酸物质进行了全基因组关联分析。主要结果如下:1.利用气质联用仪（GC-MS）对174份具有广泛表型变异的番茄材料红熟期果实中的主要糖酸组分进行了测定和分析。共检测到17种主要糖酸组分物质,包括8类糖类物质和9种有机酸类物质。其中主要的糖类物质包括葡萄糖、果糖、蔗糖、半乳糖等,主要的有机酸类包括苹果酸、柠檬酸、琥珀酸、丁酸、脯氨酸等。主要糖酸组分之间一般存在着较高的相关性,其中葡萄糖和半乳糖之间的相关系数达到0.958;果糖、葡萄糖和苹果酸、谷氨酸、琥珀酸之间均为...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 常用分子标记种类
1.1.1 RFLP标记
1.1.2 RAPD标记
1.1.3 AFLP标记
1.1.4 SSR标记
1.1.5 ISSR标记
1.1.6 SRAP标记
1.1.7 SSCP标记
1.1.8 SNP标记
1.1.9 EST标记
1.2 数量性状研究进展
1.2.1 数量性状研究的基本方法
1.2.2 番茄主要品质相关性状QTL研究进展
1.3 关联分析研究进展
1.3.1 关联分析的方法
1.3.2 关联分析在植物学中研究进展
1.3.3 关联分析在番茄中研究进展
1.3.4 关联分析理论基础及优缺点
1.4 研究目的意义及技术路线
1.4.1 研究目的及意义
1.4.2 研究内容
1.4.3 技术路线
第二章 番茄遗传多样性分析和群体结构
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 基因组DNA的提取
2.1.3 SSR-PCR反应体系
2.1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳主要步骤
2.1.5 引物多态性筛选及群体标记
2.1.6 数据分析方法
2.2 结果与分析
2.2.1 SSR最小等位基因频率分析
2.2.2 群体结构分析
2.2.3 遗传连锁不平衡分析
2.3 讨论
2.3.1 番茄连锁不平衡
2.3.2 番茄种质资源群体结构
2.4 小结
第三章 番茄果实主要糖酸成分分析
3.1 材料与方法
3.1.1 材料
3.1.2 番茄果实主要糖酸指标测定方法
3.2 番茄主要糖酸性状分析
3.2.1 番茄果实中主要的糖酸物质
3.2.2 番茄果实中主要的糖酸聚类分析
3.2.3 番茄果实中主要的糖酸相关性分析
3.2.4 番茄果实中主要糖酸与其他果实品质相关性状相关性分析
3.3 讨论
3.4 小结
第四章 番茄主要糖酸全基因组关联分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 番茄果实主要糖酸成分测定
4.1.3 SSR分子标记及基因组扫描
4.1.4 数据分析方法
4.2 结果与分析
4.2.1 与番茄果实主要糖显著关联的SSR位点
4.2.2 与番茄果实主要有机酸显著关联的SSR位点
4.3 讨论
4.4 小结
第五章 结论
5.1 结论
5.1.1 番茄果实主要糖酸组分分析
5.1.2 番茄果实遗传多样性分析
5.1.3 番茄果实主要糖酸全基因组关联分析
5.2 展望
参考文献
附录
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄红素的生物学作用及应用研究进展[J]. 陈锦瑶,张立实. 卫生研究. 2013(02)
[2]拟南芥HMGs家族成员全基因组分析[J]. 王凤华,刘文锋. 安徽农业科学. 2012(36)
[3]植物性状-标记关联分析研究进展[J]. 金亮,包劲松. 分子植物育种. 2009(06)
[4]文心兰种质遗传多样性的SRAP分析[J]. 周艳霞,尹俊梅,任羽,杨光穗. 热带农业科学. 2009(07)
[5]番茄红素功能及研究进展[J]. 李铁军. 学理论. 2009(14)
[6]利用永久F2群体定位小麦株高的QTL[J]. 王岩,李卓坤,田纪春. 作物学报. 2009(06)
[7]DNA分子标记的研究进展及几种新型分子标记技术[J]. 关强,张月学,徐香玲,孙德全,李绥艳,林红,潘丽艳,马延华. 黑龙江农业科学. 2008(01)
[8]DNA分子标记技术及其应用[J]. 白玉. 安徽农业科学. 2007(24)
[9]遗传多样性与植物的遗传标记[J]. 张传军,刘亦肖,肖娅萍. 陕西师范大学学报(自然科学版). 2006(S1)
[10]作物QTL定位方法研究进展[J]. 章元明. 科学通报. 2006(19)
博士论文
[1]玉米12个农艺性状的全基因组关联分析及玉米氮响应相关基因的鉴定[D]. 刘志鹏.中国农业大学 2015
[2]番茄重要农艺性状的全基因组关联分析及野生种质在栽培种的渐渗分析[D]. 祝光涛.中国农业科学院 2015
[3]中国冬小麦抗旱指标评价、种质筛选及重要性状与SSR标记的关联分析[D]. 陈晓杰.西北农林科技大学 2013
[4]小麦主要农艺性状的条件和非条件QTL定位[D]. 刘宾.山东农业大学 2011
[5]不结球白菜遗传图谱构建及重要农艺性状的QTL定位[D]. 王倩.南京农业大学 2011
[6]不同苹果糖酸组成及苹果酸转运体功能研究[D]. 张燕子.西北农林科技大学 2010
硕士论文
[1]大豆农艺性状、遗传多样性及其育种性状的关联分析[D]. 杨凯敏.山西农业大学 2015
[2]小麦3个重要农艺性状的SSR标记全基因组关联分析[D]. 李桂冬.西北农林科技大学 2015
[3]氮素形态对番茄果实生长和有机酸代谢动态变化的影响[D]. 徐新娟.南京农业大学 2009
[4]F2：3设计多QTL定位新方法研究[D]. 万素琴.南京农业大学 2008
本文编号：3248218
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 常用分子标记种类
1.1.1 RFLP标记
1.1.2 RAPD标记
1.1.3 AFLP标记
1.1.4 SSR标记
1.1.5 ISSR标记
1.1.6 SRAP标记
1.1.7 SSCP标记
1.1.8 SNP标记
1.1.9 EST标记
1.2 数量性状研究进展
1.2.1 数量性状研究的基本方法
1.2.2 番茄主要品质相关性状QTL研究进展
1.3 关联分析研究进展
1.3.1 关联分析的方法
1.3.2 关联分析在植物学中研究进展
1.3.3 关联分析在番茄中研究进展
1.3.4 关联分析理论基础及优缺点
1.4 研究目的意义及技术路线
1.4.1 研究目的及意义
1.4.2 研究内容
1.4.3 技术路线
第二章 番茄遗传多样性分析和群体结构
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 基因组DNA的提取
2.1.3 SSR-PCR反应体系
2.1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳主要步骤
2.1.5 引物多态性筛选及群体标记
2.1.6 数据分析方法
2.2 结果与分析
2.2.1 SSR最小等位基因频率分析
2.2.2 群体结构分析
2.2.3 遗传连锁不平衡分析
2.3 讨论
2.3.1 番茄连锁不平衡
2.3.2 番茄种质资源群体结构
2.4 小结
第三章 番茄果实主要糖酸成分分析
3.1 材料与方法
3.1.1 材料
3.1.2 番茄果实主要糖酸指标测定方法
3.2 番茄主要糖酸性状分析
3.2.1 番茄果实中主要的糖酸物质
3.2.2 番茄果实中主要的糖酸聚类分析
3.2.3 番茄果实中主要的糖酸相关性分析
3.2.4 番茄果实中主要糖酸与其他果实品质相关性状相关性分析
3.3 讨论
3.4 小结
第四章 番茄主要糖酸全基因组关联分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 番茄果实主要糖酸成分测定
4.1.3 SSR分子标记及基因组扫描
4.1.4 数据分析方法
4.2 结果与分析
4.2.1 与番茄果实主要糖显著关联的SSR位点
4.2.2 与番茄果实主要有机酸显著关联的SSR位点
4.3 讨论
4.4 小结
第五章 结论
5.1 结论
5.1.1 番茄果实主要糖酸组分分析
5.1.2 番茄果实遗传多样性分析
5.1.3 番茄果实主要糖酸全基因组关联分析
5.2 展望
参考文献
附录
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄红素的生物学作用及应用研究进展[J]. 陈锦瑶,张立实. 卫生研究. 2013(02)
[2]拟南芥HMGs家族成员全基因组分析[J]. 王凤华,刘文锋. 安徽农业科学. 2012(36)
[3]植物性状-标记关联分析研究进展[J]. 金亮,包劲松. 分子植物育种. 2009(06)
[4]文心兰种质遗传多样性的SRAP分析[J]. 周艳霞,尹俊梅,任羽,杨光穗. 热带农业科学. 2009(07)
[5]番茄红素功能及研究进展[J]. 李铁军. 学理论. 2009(14)
[6]利用永久F2群体定位小麦株高的QTL[J]. 王岩,李卓坤,田纪春. 作物学报. 2009(06)
[7]DNA分子标记的研究进展及几种新型分子标记技术[J]. 关强,张月学,徐香玲,孙德全,李绥艳,林红,潘丽艳,马延华. 黑龙江农业科学. 2008(01)
[8]DNA分子标记技术及其应用[J]. 白玉. 安徽农业科学. 2007(24)
[9]遗传多样性与植物的遗传标记[J]. 张传军,刘亦肖,肖娅萍. 陕西师范大学学报(自然科学版). 2006(S1)
[10]作物QTL定位方法研究进展[J]. 章元明. 科学通报. 2006(19)
博士论文
[1]玉米12个农艺性状的全基因组关联分析及玉米氮响应相关基因的鉴定[D]. 刘志鹏.中国农业大学 2015
[2]番茄重要农艺性状的全基因组关联分析及野生种质在栽培种的渐渗分析[D]. 祝光涛.中国农业科学院 2015
[3]中国冬小麦抗旱指标评价、种质筛选及重要性状与SSR标记的关联分析[D]. 陈晓杰.西北农林科技大学 2013
[4]小麦主要农艺性状的条件和非条件QTL定位[D]. 刘宾.山东农业大学 2011
[5]不结球白菜遗传图谱构建及重要农艺性状的QTL定位[D]. 王倩.南京农业大学 2011
[6]不同苹果糖酸组成及苹果酸转运体功能研究[D]. 张燕子.西北农林科技大学 2010
硕士论文
[1]大豆农艺性状、遗传多样性及其育种性状的关联分析[D]. 杨凯敏.山西农业大学 2015
[2]小麦3个重要农艺性状的SSR标记全基因组关联分析[D]. 李桂冬.西北农林科技大学 2015
[3]氮素形态对番茄果实生长和有机酸代谢动态变化的影响[D]. 徐新娟.南京农业大学 2009
[4]F2：3设计多QTL定位新方法研究[D]. 万素琴.南京农业大学 2008
本文编号：3248218
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