番茄锌指蛋白家族基因分析与功能研究

发布时间：2021-07-01 11:10

　　番茄（Solanum lycopersicum）是全球最重要的蔬菜作物之一,在我国蔬菜产业中同样占据重要地位。番茄同时也是基础研究的重要模式植物之一。利用番茄来揭示植物的发育和抗逆等机制,对于基础研究和遗传改良均有重要意义。本课题组前期研究中,通过对潘那利野生番茄（Spennellii,LA0716）为供体、栽培番茄（S.lycopersicum,M82）为受体的两个耐早渐渗系开展干旱胁迫相关的芯片研究,发现几个差异表达基因编码DBB（Double B-BOX）类锌指蛋白,这些DBB属于锌指蛋白转录因子B-BOX（BBX）家族。BBX基因在拟南芥和水稻上均有相关研究,而在番茄中尚无报道。本研究中的另一个锌指蛋白基因为SlZF3,前期的盐胁迫芯片研究表明该基因受盐胁迫诱导。超量表达SlZF3导致番茄植株出现矮化等发育方面的改变,抗逆性提高。本研究旨在对番茄BBX锌指蛋白基因进行系统分析,并对SlZF3在发育和抗逆方面的功能及相关机理进行解析。主要的研究结果如下:1番茄B-BOX基因家族全基因组分析B-BOX蛋白编码一类拥有1个或2个B-BOX结构域、有的还包含1个CCT（CO,CO-li... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：116 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图２－１番茄ＢＢＸ蛋白的保守结构域??数值代表相应保守域中的氨基酸位置，红色及蓝色矩形代表Ｂ－ＢＯＸ?１和Ｂ－ＢＯＸ２结构域的?

图２－２番茄ＢＢＸ蛋白Ｂ－ＢＯＸ和ＣＣＴ结构域的保守性分析??Ａ－Ｃ分别表示Ｂ－Ｂｏｘｌ、Ｂ－Ｂｏｘ２及ＣＣＴ保守域的氨基酸序列保守性比较

??Ａ?ＳＩＢＢＸ１２??图２－４番茄ＢＢＸ家族进化分析??Ａ，以全长蛋白质序列比对构建的进化树；??Ｂ－Ｄ，分别以Ｂ－Ｂ０Ｘ１、Ｂ－Ｂ０Ｘ２、ＣＣＴ结构域序列比对获得的进化树；??Ｅ，两个Ｂ－ＢＯＸ连同ＣＣＴ保守域所构建的进化树。自展值标于每个节点处。??进化树通过ＭＥＧＡ５邻接法（Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ）构建，并采用１０００次重复的自举检验分析。比??例尺长度表示０．１氨基酸。黑色三角形表示含有２个串联Ｂ－ＢＯＸ和丨个ＣＣＴ保守域的蛋白。??Ｆｉｇｕｒｅ?２－４?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｔｏｍａｔｏ?ＢＢＸ?ｆａｍｉｌｙ??Ｔｈｅ?ｔｒｅｅｓ?ｓｈｏｗｎ?ａｒｅ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｔｈｅ?ａｌｉｇｎｍｅｎｔｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｐｒｏｔｅｉｎ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｆｕｌｌ?ｌｅｎｇｔｈ?（Ａ），?ｔｈｅ??Ｂ－ＢＯＸ?１?ｄｏｍａｉｎ?（Ｂ），?Ｂ－ＢＯＸ２?ｄｏｍａｉｎ?（Ｃ），?ＣＣＴ?ｄｏｍａｉｎ?（Ｄ）?ａｎｄ?ｔｗｏ?Ｂ－ＢＯＸ?ｐｌｕｓ?ｔｈｅ?ＣＣＴ??ｄｏｍａｉｎｓ?（Ｅ）．?Ｔｈｅ?ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅｓ?ｗｅｒｅ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ?ｗｉｔｈ?ｔｈｅ?ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ?ａｌｇｏｒｉｔｈｍ?ｉｎ??ＭＥＧＡ?（ｖｅｒｓｉｏｎ?５．１）

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3259027