基于转录组和共表达网络分析的玫瑰类黄酮和萜类生物合成相关基因研究

发布时间：2021-08-14 17:17

　　蔷薇属落叶灌木玫瑰（Rosa rugosa）因其花形优雅、色彩丰富和富含植物精油的特点成为具有重要研究价值的经济花卉。类黄酮是和玫瑰花色紧密相关的次生代谢产物,萜类物质则与玫瑰精油和花香形成有关,因此研究玫瑰类黄酮和萜类生物合成的相关基因及其代谢调控网络显得至关重要。目前玫瑰缺乏合适的参考基因组和对应的基因信息,本研究首先对实验室已有的’紫枝’玫瑰基因组组装版本进行全基因组基因注释,鉴定类黄酮、萜类合成通路结构基因,再在基因结构信息的辅助下分析不同器官不同时期的RNA-seq数据,最终通过WGCNA构建玫瑰基因共表达网络,筛选对类黄酮、萜类合成具有调控作用的潜在基因。主要的研究结果如下:1.从’紫枝’玫瑰鉴定出58462个编码蛋白的基因和1943个tRNA,并统一命名:同时鉴定出413个MYB、177个bHLH、447个WD40转录因子并完成MYB亚家族分类,和拟南芥、蔷薇科其他5个物种（草莓、苹果、梨、梅花、桃）比较发现3个转录因子家族扩增明显,3R-MYB和4R-MYB数目更多;同理,研究类黄酮、萜类合成相关结构基因的拷贝数发现类黄酮结构基因数目保守,均不存在F3’5’H基因,而玫... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

植物类黄酮生物合月CSaitoetal2013)

２．２．１甲羟戊酸（ＭＶＡ）途径??ＭＶＡ途径中ＩＰＰ的生物合成从３种分子之间的转化开始，乙酰辅酶Ａ依次??被乙酰乙酰辅酶Ａ硫解酶（ａｃｅｔｏａｃｅｔｙｌ－ＣｏＡｔｈｉｏｌａｓｅ，ｄ／６）５／＾Ｌ４Ｃｒ）、轻甲基戊二??酸辅酶?Ａ?合酶（ｈｙｄｒｏｘｙｍｅｔｈｙｌｇｌｕｔａｒｙｌ－ＣｏＡ?ｓｙｎｔｈａｓｅ，／／ＭＧＳＯ、轻甲基戊二酸辅??７??

Ｆｉｇ．?３?Ｃｏｐｉｅｓ?ｏｆ?ｇｅｎｅｓ?ｒｅｌａｔｅｄ?ｔｏ?ｆｌｏｗｅｒ?ｃｏｌｏｒ??ｉｎ?ｐｈｅｎｙｌｐｒｏｐａｎｏｉｄ?ａｎｄ?ｆｌａｖｏｎｏｉｄ?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ??根据文献和ＫＥＧＧ代谢通路数据库信息，图４展示萜类化合物骨架合成通??路中脱氧隣酸木酮糖途径７个基因（ＺＸ￥ｉ＼?／．ｖｐＤ、／ＡｐＡ’、冲／＂＇、／ＳｐＧ、冲／／），??甲羟戊酸途径?６?个基因（／４／〇凡Ａ＾、ＡＷ／Ｃ／Ｍ／ＶＪ）和／Ｌ＞／、??ＧＧ八Ｓ＇的拷贝数，发现苹果中没有／少Ｃ拷贝，梨不存在／以基因，同时玫瑰中??ＨＭＣ况拷贝数达到１９个

【参考文献】：
期刊论文
[1]国产玫瑰精油的化学成分及香气特征[J]. 程劼,谢建春,孙宝国.  中国食品添加剂. 2007(05)
[2]玫瑰精油提取工艺研究[J]. 马希汉,王永红,尉芹,张广军.  林产化学与工业. 2004(S1)
[3]中国苦水玫瑰油香气成分的研究[J]. 周围,周小平,赵国宏,刘红卫,丁兰,陈立仁.  色谱. 2002(06)
[4]植物精油及萜类成分的生物活性[J]. 孙凌峰.  江西师范大学学报(自然科学版). 2000(02)



本文编号：3342866