柑橘TCP家族生物信息学分析及CsTCP1转录因子参与果实成熟的功能验证
发布时间：2021-08-19 10:25
果实成熟是一个复杂的过程,受多个代谢途径共同调控。目前,针对非跃变型果实成熟机制方面的研究较少。因此研究柑橘果实成熟相关的基因,并探究它们与果实成熟调控之间的关系,进而选育出不同成熟期的优良品种,对柑橘产业发展有重要意义。TCP（TEOSINTEBRANCHEDI/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR）蛋白是植物所特有的一类转录因子,参与植物叶的发育、花的对称性、茎的分支等进程,但在果实成熟上的研究较少。前人通过转录组测序及SSR分析发现柑橘CsTCP1基因可能参与果实的成熟。本实验通过生物信息学和基因表达两种方法对柑橘TCP家族成员进行研究。同时克隆CsTCP1基因,通过对该基因在番茄中的超量表达研究分析其功能。主要研究结果如下:1、柑橘全基因组共编码20个TCP家族成员基因,编号分别为CsTCP1CsTCP20,系统进化关系结果将CsTCPs分为两个亚家族:Class I和Class II。序列比对发现它们都含有典型的BHLH结构域。除1号和4号染色体外,其它7条染色体均有TCP基因的分布。多数基因结构简单,无内含子。2、根据...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
1 前言
1.1 课题提出
1.2 果实成熟相关研究进展
1.2.1 果实品质研究进展
1.2.2 果实成熟相关激素研究进展
1.2.3 TCP转录因子研究进展
1.3 生物信息学研究进展
1.4 本研究的目的和意义
1.5 实验思路及技术路线
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌株与质粒
2.1.3 主要酶与生化试剂及实验仪器
2.2 实验方法
2.2.1 柑橘CsTCPs家族生物信息学分析
2.2.2 植物基因组DNA的提取（CTAB法）
2.2.3 植物RNA提取（试剂盒法）
2.2.4 实时定量PCR
2.2.5 柑橘CsTCP1的克隆
2.2.6 植物表达载体的构建
2.2.7 农杆菌感受态的制备及转化方法
2.2.8 农杆菌介导番茄的转化
2.2.9 转基因植株的检测
3 结果与分析
3.1 柑橘TCP家族生物信息学分析
3.1.1 柑橘TCP家族基因的序列特征鉴定
3.1.2 柑橘TCP家族系统进化关系及其基因结构分析
3.1.3 柑橘TCP家族基因保守结构域及系统发育关系分析
3.2 柑橘CsTCPs基因表达量分析
3.2.1 柑橘CsTCPs基因在不同组织中的表达量分析
3.2.2 柑橘TCP基因在‘兴锦 101’及晚熟芽变中的表达分析
3.3 柑橘CsTCP1基因的克隆
3.4 CsTCP1基因的功能验证
3.4.1 亚细胞定位表达载体的构建
3.4.2 CsTCP1基因超表达载体的构建
3.4.3 转基因番茄植株的鉴定
3.4.4 转基因番茄植株的表型观察
3.4.5 CsTCP1基因介导果实成熟相关基因的调控
4 讨论
4.1 柑橘TCP家族成员基于生物信息学的探讨
4.2 CsTCPs家族基因的时空表达
4.3 CsTCP1基因的功能探讨
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]苹果TCP转录因子家族生物信息学分析[J]. 张士刚. 山东农业科学. 2014(05)
[2]玉米TCP家族基因生物信息学鉴定与分析[J]. 王玉红,徐立华,李军. 山东农业科学. 2014(04)
[3]黄瓜转录因子TCP基因家族的鉴定及结构分析[J]. 袁伟,顾掌根,褚伟雄,叶立华,杨国志. 分子植物育种. 2014(02)
[4]Two Lycopene β-Cyclases Genes from Sweet Orange （Citrus sinensis L. Osbeck） Encode Enzymes With Different Functional Efficiency During the Conversion of Lycopene-to-Provitamin A[J]. ZHANG Jian-cheng,ZHOU Wen-jing,XU Qiang,TAO Neng-guo,YE Jun-li,GUO Fei,XU Juan,DENG Xiu-xin. Journal of Integrative Agriculture. 2013(10)
[5]分子系统发育分析的生物信息学方法[J]. 张树波,赖剑煌. 计算机科学. 2010(08)
[6]乙烯信号转导与果实成熟衰老的研究进展[J]. 殷学仁,张波,李鲜,陈昆松. 园艺学报. 2009(01)
[7]苹果加工品种的糖积累与蔗糖代谢相关酶活性[J]. 宋烨,刘金豹,王孝娣,翟衡. 果树学报. 2006(01)
[8]不同来源桃种质果实糖酸组分含量特点的研究[J]. 牛景,赵剑波,吴本宏,李绍华,刘国杰,姜全. 园艺学报. 2006(01)
[9]柑橘果实糖积累与蔗糖代谢酶活性的研究[J]. 刘永忠,李道高. 园艺学报. 2003(04)
[10]荔枝果实成熟期间糖积累和糖代谢相关酶活性变化[J]. 李建国,罗诗,袁炜群. 华南农业大学学报. 2003(02)
博士论文
[1]锦橙晚熟性状机理探讨及候选基因的鉴定[D]. 张雅剑.华中农业大学 2015
[2]柑桔果实有机酸代谢生理和奉节脐橙芽变株系的AFLP分析研究[D]. 罗安才.西南农业大学 2003
硕士论文
[1]矮牵牛PhTCP2基因的克隆、表达分析及超量表达研究[D]. 王会平.西南大学 2013
[2]农杆菌介导的豌豆花瓣瞬间表达系统的建立及利用该系统对百脉根TCP基因亚细胞定位的研究[D]. 李超.上海交通大学 2009
[3]柑橘特征糖酸组成及其与果汁褐变关系研究[D]. 李云康.华中农业大学 2006
本文编号：3351232
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
1 前言
1.1 课题提出
1.2 果实成熟相关研究进展
1.2.1 果实品质研究进展
1.2.2 果实成熟相关激素研究进展
1.2.3 TCP转录因子研究进展
1.3 生物信息学研究进展
1.4 本研究的目的和意义
1.5 实验思路及技术路线
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌株与质粒
2.1.3 主要酶与生化试剂及实验仪器
2.2 实验方法
2.2.1 柑橘CsTCPs家族生物信息学分析
2.2.2 植物基因组DNA的提取（CTAB法）
2.2.3 植物RNA提取（试剂盒法）
2.2.4 实时定量PCR
2.2.5 柑橘CsTCP1的克隆
2.2.6 植物表达载体的构建
2.2.7 农杆菌感受态的制备及转化方法
2.2.8 农杆菌介导番茄的转化
2.2.9 转基因植株的检测
3 结果与分析
3.1 柑橘TCP家族生物信息学分析
3.1.1 柑橘TCP家族基因的序列特征鉴定
3.1.2 柑橘TCP家族系统进化关系及其基因结构分析
3.1.3 柑橘TCP家族基因保守结构域及系统发育关系分析
3.2 柑橘CsTCPs基因表达量分析
3.2.1 柑橘CsTCPs基因在不同组织中的表达量分析
3.2.2 柑橘TCP基因在‘兴锦 101’及晚熟芽变中的表达分析
3.3 柑橘CsTCP1基因的克隆
3.4 CsTCP1基因的功能验证
3.4.1 亚细胞定位表达载体的构建
3.4.2 CsTCP1基因超表达载体的构建
3.4.3 转基因番茄植株的鉴定
3.4.4 转基因番茄植株的表型观察
3.4.5 CsTCP1基因介导果实成熟相关基因的调控
4 讨论
4.1 柑橘TCP家族成员基于生物信息学的探讨
4.2 CsTCPs家族基因的时空表达
4.3 CsTCP1基因的功能探讨
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]苹果TCP转录因子家族生物信息学分析[J]. 张士刚. 山东农业科学. 2014(05)
[2]玉米TCP家族基因生物信息学鉴定与分析[J]. 王玉红,徐立华,李军. 山东农业科学. 2014(04)
[3]黄瓜转录因子TCP基因家族的鉴定及结构分析[J]. 袁伟,顾掌根,褚伟雄,叶立华,杨国志. 分子植物育种. 2014(02)
[4]Two Lycopene β-Cyclases Genes from Sweet Orange （Citrus sinensis L. Osbeck） Encode Enzymes With Different Functional Efficiency During the Conversion of Lycopene-to-Provitamin A[J]. ZHANG Jian-cheng,ZHOU Wen-jing,XU Qiang,TAO Neng-guo,YE Jun-li,GUO Fei,XU Juan,DENG Xiu-xin. Journal of Integrative Agriculture. 2013(10)
[5]分子系统发育分析的生物信息学方法[J]. 张树波,赖剑煌. 计算机科学. 2010(08)
[6]乙烯信号转导与果实成熟衰老的研究进展[J]. 殷学仁,张波,李鲜,陈昆松. 园艺学报. 2009(01)
[7]苹果加工品种的糖积累与蔗糖代谢相关酶活性[J]. 宋烨,刘金豹,王孝娣,翟衡. 果树学报. 2006(01)
[8]不同来源桃种质果实糖酸组分含量特点的研究[J]. 牛景,赵剑波,吴本宏,李绍华,刘国杰,姜全. 园艺学报. 2006(01)
[9]柑橘果实糖积累与蔗糖代谢酶活性的研究[J]. 刘永忠,李道高. 园艺学报. 2003(04)
[10]荔枝果实成熟期间糖积累和糖代谢相关酶活性变化[J]. 李建国,罗诗,袁炜群. 华南农业大学学报. 2003(02)
博士论文
[1]锦橙晚熟性状机理探讨及候选基因的鉴定[D]. 张雅剑.华中农业大学 2015
[2]柑桔果实有机酸代谢生理和奉节脐橙芽变株系的AFLP分析研究[D]. 罗安才.西南农业大学 2003
硕士论文
[1]矮牵牛PhTCP2基因的克隆、表达分析及超量表达研究[D]. 王会平.西南大学 2013
[2]农杆菌介导的豌豆花瓣瞬间表达系统的建立及利用该系统对百脉根TCP基因亚细胞定位的研究[D]. 李超.上海交通大学 2009
[3]柑橘特征糖酸组成及其与果汁褐变关系研究[D]. 李云康.华中农业大学 2006
本文编号：3351232
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