菊芋果聚糖合成酶基因1-FFT启动子克隆与功能分析

发布时间：2021-08-26 10:15

　　本研究通过Tail-PCR方法分离到菊芋1-FFT基因上游长度为1 611 bp的片段（FFTP）。神经网络启动子在FFTP序列中预测到8个启动子核心结构,瞬时表达结果显示起始密码子上游400 bp的启动子核心结构域与1 611 bp的启动GUS基因表达的活性无明显差异,表明-296到-246区域就是1-FFT基因的启动子区域。PlantCARE分析表明,FFTP序列中除基本启动子元件（TATA-box和CAAT-box）外,还含有与MYB转录因子结合的元件3个,参与光调控的顺式作用元件12个,茉莉酸反应、厌氧过程、脱落酸、抗逆反应的元件各2个,昼夜节律控制、生长素和赤霉素反应的元件各1个。这些顺式作用元件的鉴定为1-FFT参与相应的生物学过程提供理论依据。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(06)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

1-FFT启动子Tail-PCR扩增电泳

为明晰1-FFT基因很有可能参与的生物学过程，通过PlantCARE对FFTP序列进行了生物信息学分析。FFTP序列中共检测到121个顺式作用元件，除启动子所具备的基本元件39个TATA-box和22个CAAT-box之外，尚有60个参与1-FFT基因表达调控的顺式作用元件。在60个顺式作用元件中，26个顺式作用元件能够预测其功能。参与光调控的12个，与MYB转录因子作用元件有3个，茉莉酸反应、厌氧过程、脱落酸、抗逆反应的有2个，昼夜节律控制、生长素和赤霉素反应的调控元件各有1个(表2)。2 讨论

使用Vector NTI 10生物学软件(Invitrogen)进行序列拼接及比对。Primer Primer 5.0软件设计引物。利用神经网络启动子预测分析NNPP(http://www.fruitfly.org/seq＿tools/promoter.html)软件进行启动子核心区域生物信息学分析，利用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在线软件预测顺式作用元件。作者贡献

【参考文献】：
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本文编号：3364053