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番茄光尾拟短体线虫的形态和分子鉴定

发布时间:2021-08-31 00:41
  [目的]拟短体属线虫(Pratylenchoides spp.)是一类迁移性植物内寄生线虫,从青海长势衰弱的番茄植株根系及根围土样中分离到1种拟短体线虫群体,本文对该群体进行形态学特征鉴定和分子特征分析,旨在为今后拟短体线虫属种类鉴定提供参考依据。[方法]通过形态特征观察和测计值比较,利用贝叶斯法和最大似然法构建拟短体属线虫群体的rDNA 18S、28S-D2/D3以及ITS系统进化树,对青海线虫群体进行种类鉴定。[结果]青海线虫群体形态学特征与光尾拟短体线虫(Pratylenchoides leiocauda)相似,其主要形态特征为:侧线6条;唇区无明显缢缩,唇环3~4个;口针较粗壮,口针基部球宽圆形,明显向后倾斜;食道腺背侧覆盖肠端,覆盖长度为1~2个最大体宽;背食道腺核位于食道腺与肠交接处之前,至少有1个亚腹食道腺核位于肠与食道腺交接处后方;尾圆柱形,末端光滑或有1~3条环纹;雄虫交合刺较长,交合伞较大包裹到尾端。系统进化树显示:青海线虫群体与齿尾拟短体线虫(P.crenicauda)、埃尔祖鲁姆拟短体线虫(P.erzurumensis)以及侧尾拟短体线虫(P.laticauda... 

【文章来源】:南京农业大学学报. 2020,43(06)北大核心CSCD

【文章页数】:9 页

【部分图文】:

番茄光尾拟短体线虫的形态和分子鉴定


光尾短体线虫的光学显微镜照片

序列,线虫,进化树,序列


拟短体线虫属种类间的形态特征差别比较细微,近似种之间较难区分,仅靠形态学鉴定难度较大,因此对青海线虫群体进行分子生物学特征鉴定。青海群体18S序列长度为1 456 bp,GenBank登录号为MN510991。用贝叶斯法构建的18S区序列系统进化树(图2)显示:青海群体形成1个单独小支,与阿尔肯拟短体线虫、齿尾拟短体线虫(P.crenicauda)、埃尔祖鲁姆拟短体线虫、耐瓦登拟短体线虫(P.nevadensis)以及里特拟短体线虫等聚类在1个大分支上,且这些拟短体线虫与内格尔线虫属(Nagelus)、大默林线虫属、默林线虫属、居中线虫属(Geocenamus)以及楯垫线虫属成员亲缘关系较近。青海线虫群体测序所得28S-D2/D3序列长度为776 bp,GenBank登录号为MN510993。用贝叶斯法构建的28S-D2/D3区序列系统进化树(图3)显示:青海群体与1种拟短体线虫中国群体(KY424321)聚类在1个单独小支上,与阿尔肯拟短体线虫、齿尾拟短体线虫、埃尔祖鲁姆拟短体线虫、侧尾拟短体线虫、大尾拟短体线虫、耐瓦登拟短体线虫、波斯拟短体线虫、里特拟短体线虫、尤他拟短体线虫以及多变拟短体线虫等聚类在1个大分支上,而且这些拟短体线虫与内格尔线虫属、大默林线虫属、默林线虫属、居中线虫属以及楯垫线虫属成员亲缘关系较近。

序列,线虫,进化树,序列


青海线虫群体测序所得28S-D2/D3序列长度为776 bp,GenBank登录号为MN510993。用贝叶斯法构建的28S-D2/D3区序列系统进化树(图3)显示:青海群体与1种拟短体线虫中国群体(KY424321)聚类在1个单独小支上,与阿尔肯拟短体线虫、齿尾拟短体线虫、埃尔祖鲁姆拟短体线虫、侧尾拟短体线虫、大尾拟短体线虫、耐瓦登拟短体线虫、波斯拟短体线虫、里特拟短体线虫、尤他拟短体线虫以及多变拟短体线虫等聚类在1个大分支上,而且这些拟短体线虫与内格尔线虫属、大默林线虫属、默林线虫属、居中线虫属以及楯垫线虫属成员亲缘关系较近。青海线虫群体测序所得ITS序列长度为842 bp,GenBank登录号为MT509390。用最大似然法构建的ITS区序列系统进化树(图4)显示:青海群体与1种拟短体线虫中国群体(KY424249)聚类在1个单独的小支上,与另外2个拟短体线虫韩国群体(KY468918、KY468919)聚类在1个大分支上,而且这些拟短体线虫与大默林线虫属、默林线虫属、居中线虫属以及螺旋线虫属(Helicotylenchus)成员亲缘关系较近。


本文编号:3373827

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