番茄SELF-PRUNING基因家族及株形调控功能研究进展
发布时间:2021-09-17 09:00
番茄SP (SELF-PRUNING)基因调控植株的有限型生长习性,其与金鱼草CEN(CENRORADIALIS)基因和拟南芥TFL1(TERMINAL FLOWER 1)基因同源,属于调控植物生长习性和开花的同一类基因。目前已报道了番茄SP基因家族8个成员(SP、SP9D、SP2I、SP3D、SP5G、SP6A、SIGI和SPGB),该基因家族能直接或间接调控番茄植株的生长习性,影响其株形。对番茄SP家族基因结构特征、亲缘关系、表达特性以及株形调控功能等研究进展进行综述,以期为调控番茄生长习性,获得紧凑型株系、实现均一化和现代机械化采收提供有效的技术支撑。
【文章来源】:园艺学报. 2020,47(09)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【部分图文】:
番茄SP与同源家族蛋白系统发生树分析
笔者从NCBI数据库和茄科基因组数据库中检索获得8个番茄(Solanum lycopersicum)SP基因家族成员基因序列,并利用MEGA 7.0.26软件邻接法和GSDS 2.0在线软件(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)进行聚类及基因作图(图2),发现SIGI不含内含子,由5′、3′两端UTR和一段CDS区构成;SPGB由3个CDS、2个内含子和3′端UTR区构成,5′端没有UTR区;SIGI和SPGB聚在一起,亲缘关系较近。其余6个基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP、SP9D和SP2G)均由4个外显子和3个内含子构成。其中SP2G的5′端没有UTR序列,3个内含子区域较另外5个基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP和SP9D)长,单独聚为一类;SP6A和SP9D的5′和3′端均没有UTR序列,但亲缘关系较远,而SP9D与SP聚为一类,表明二者亲缘关系较近;SP3D、SP5G和SP包含完整的两端UTR区、4个外显子和3个内含子,但并未聚在一起,而是SP3D、SP6A和SP5G聚为一类;SP3D较以上基因包含很长的2个内含子区域,结构差异明显(Shalit et al.,2009,Krieger et al.,2010)。2 番茄SP基因家族的表达
【参考文献】:
期刊论文
[1]番茄封顶花序节位的遗传差异及SSR分子标记研究[J]. 毛秀杰,王帅,王宇,曹霞,孙中峰,武春成. 北方园艺. 2018(21)
[2]串番茄主要株型性状的遗传研究[J]. 冯辉,王五宏,徐娜,鲁博,张婷,陈红波. 中国农业科学. 2008(12)
[3]番茄主要株型参数主基因—多基因混合模型分析[J]. 鲁博,冯辉,王五宏,刘娜. 沈阳农业大学学报. 2008(03)
博士论文
[1]航天诱变番茄无限生长习性突变体的选育及其诱变机理研究[D]. 王艳芳.浙江大学 2006
硕士论文
[1]SELF PRUNING 5G(SP5G)调控番茄开花时间的机制研究[D]. 焦志成.中国农业科学院 2018
[2]利用Solanum pennellii渐渗群体对番茄果实、株型和育性相关位点的遗传定位分析[D]. 周慧.中国农业科学院 2015
本文编号:3398392
【文章来源】:园艺学报. 2020,47(09)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【部分图文】:
番茄SP与同源家族蛋白系统发生树分析
笔者从NCBI数据库和茄科基因组数据库中检索获得8个番茄(Solanum lycopersicum)SP基因家族成员基因序列,并利用MEGA 7.0.26软件邻接法和GSDS 2.0在线软件(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)进行聚类及基因作图(图2),发现SIGI不含内含子,由5′、3′两端UTR和一段CDS区构成;SPGB由3个CDS、2个内含子和3′端UTR区构成,5′端没有UTR区;SIGI和SPGB聚在一起,亲缘关系较近。其余6个基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP、SP9D和SP2G)均由4个外显子和3个内含子构成。其中SP2G的5′端没有UTR序列,3个内含子区域较另外5个基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP和SP9D)长,单独聚为一类;SP6A和SP9D的5′和3′端均没有UTR序列,但亲缘关系较远,而SP9D与SP聚为一类,表明二者亲缘关系较近;SP3D、SP5G和SP包含完整的两端UTR区、4个外显子和3个内含子,但并未聚在一起,而是SP3D、SP6A和SP5G聚为一类;SP3D较以上基因包含很长的2个内含子区域,结构差异明显(Shalit et al.,2009,Krieger et al.,2010)。2 番茄SP基因家族的表达
【参考文献】:
期刊论文
[1]番茄封顶花序节位的遗传差异及SSR分子标记研究[J]. 毛秀杰,王帅,王宇,曹霞,孙中峰,武春成. 北方园艺. 2018(21)
[2]串番茄主要株型性状的遗传研究[J]. 冯辉,王五宏,徐娜,鲁博,张婷,陈红波. 中国农业科学. 2008(12)
[3]番茄主要株型参数主基因—多基因混合模型分析[J]. 鲁博,冯辉,王五宏,刘娜. 沈阳农业大学学报. 2008(03)
博士论文
[1]航天诱变番茄无限生长习性突变体的选育及其诱变机理研究[D]. 王艳芳.浙江大学 2006
硕士论文
[1]SELF PRUNING 5G(SP5G)调控番茄开花时间的机制研究[D]. 焦志成.中国农业科学院 2018
[2]利用Solanum pennellii渐渗群体对番茄果实、株型和育性相关位点的遗传定位分析[D]. 周慧.中国农业科学院 2015
本文编号:3398392
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