基于叶绿体基因和微卫星的中国西南地区特有种泡核桃谱系地理学和群体结构研究
发布时间：2021-10-11 01:36
中国西南地区具有活跃的构造,形成了一个动态的、严重侵蚀的景观,从而影响动、植物居群的遗传结构。泡核桃是中国特有的落叶经济树种,已经长期栽培,营养价值高。另外泡核桃是乔木,枝繁叶茂,具有净化空气的能力,常常用于绿化和观赏。本研究使用5个叶绿体DNA序列片段和22个核微卫星位点标记对中国西南地区的36个野生泡核桃居群共765个个体进行了基因测序,推断泡核桃的遗传多样性、遗传结构、遗传分化和当代/历史基因流水平。本次研究的结果表和结论如下:1、泡核桃的遗传多样性。基于cpDNA标记,泡核桃确实具有相对较低的遗传多样性（Hd=0.2026;π=0.00080）。基于EST-SSR标记,36个居群的期望杂合度（HE）低于胡桃属的其他种（黑核桃:HE=0.807;胡桃楸:HE=0.77）。导致这个现象的原因可能是:泡核桃是地方性物种,具有相对较小的种群规模,由于基因漂变、奠基者效应和其他随机原因,通常会比那些更常见和分布更广的物种具有较低的遗传多样性。2、泡核桃的遗传分化。在母系遗传cpDNA标记中居群遗传分化...
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于溯祖方法对群体中个体谱系的理论模型
2.1 样品的采集根据国家标本平台（NSII；http://www.nsii.org.cn/2017/home.php）和中国数字标本馆（CVH；http://www.cvh.ac.cn/class）泡核桃物种分布范围标本数据的记录。在 2015-201年期间，我们对大多数泡核桃的自然地理分布区进行了全面的野外调查和样品采集，本研究的植物样品均采自云南和贵州两省的山林，林道或者村庄附近，一共采集了 36 个居群，765 个个体。样本详细信息可于表一中查询（表 2.1），样本点地理位置见图 2.1所有取样的树木都是成熟、健康的成年树，每个采样个体之间至少相隔 50 m，根据物种分布和种群大小不同，每个居群采集 6-31 个个体的新鲜叶片，并置于放硅胶的塑封袋中密封干燥，保存于西北大学进化实验室内。所有样本均根据中国植物志鉴定[Flora oChina, 1999]。同时测定并记录每个采集样点的经纬度和海拔。然后使用 ArcGIS v10.（ESRI Inc., Redlands, California, USA）绘制所有样本点的地理分布图。
图 2.2 3 个泡核桃的预测进化历史情景模式Fig 2.2 3 predict evolutionary historical scenarios patterns for J. sigillata i附注 1：N1，N2 代表有效群体大小附注 2：t 代表世代数附注 3：Pop1 包括泡核桃 22 个居群的 377 个个体，Pop2 包括泡核桃 14 个居群的Note1: N1, N2 show effective population sizeNote2: t shows generation numbersNote3: Pop1 includes 377 individuals in 22 populations and Pop2 includes 388populations
【参考文献】：
期刊论文
[1]分子钟假说的基本原理及在古生物等学科中的应用[J]. 刘晓枫,张爱兵. 古生物学报. 2016(03)
[2]胡桃属植物分子系统发育和生物地理研究进展[J]. 赵鹏,周惠娟,刘占林,Keith E. Woeste,呼东峰,党萌,李忠虎,王玛丽,赵桂仿. 林业科学. 2014(11)
[3]珍贵树种核桃楸的生态学问题及培育前景[J]. 马万里,罗菊春,荆涛,Joni Kujansuu. 内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版). 2005(04)
[4]云南省珍稀濒危植物及国家保护植物区系成分分析[J]. 邹新慧,何平,陈建民,马洪菊. 西南师范大学学报(自然科学版). 2002(06)
[5]种间杂交培育的5个核桃早实新品系[J]. 范志远,习学良. 湖南林业科技. 2002(01)
[6]运用RAPD对核桃属种间亲缘关系的研究[J]. 吴燕民,裴东,奚声珂,李嘉瑞. 园艺学报. 2000(01)
[7]云南麻核桃授粉特性研究[J]. 王大来,刘德良,张琴. 湖南林业科技. 1999(01)
硕士论文
[1]胡桃组植物遗传标记开发应用和中国核桃谱系进化历史研究[D]. 冯晓佳.西北大学 2018
[2]枹栎和短柄枹栎的居群遗传结构和谱系地理学研究[D]. 王雁红.西北大学 2015
本文编号：3429537
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于溯祖方法对群体中个体谱系的理论模型
2.1 样品的采集根据国家标本平台（NSII；http://www.nsii.org.cn/2017/home.php）和中国数字标本馆（CVH；http://www.cvh.ac.cn/class）泡核桃物种分布范围标本数据的记录。在 2015-201年期间，我们对大多数泡核桃的自然地理分布区进行了全面的野外调查和样品采集，本研究的植物样品均采自云南和贵州两省的山林，林道或者村庄附近，一共采集了 36 个居群，765 个个体。样本详细信息可于表一中查询（表 2.1），样本点地理位置见图 2.1所有取样的树木都是成熟、健康的成年树，每个采样个体之间至少相隔 50 m，根据物种分布和种群大小不同，每个居群采集 6-31 个个体的新鲜叶片，并置于放硅胶的塑封袋中密封干燥，保存于西北大学进化实验室内。所有样本均根据中国植物志鉴定[Flora oChina, 1999]。同时测定并记录每个采集样点的经纬度和海拔。然后使用 ArcGIS v10.（ESRI Inc., Redlands, California, USA）绘制所有样本点的地理分布图。
图 2.2 3 个泡核桃的预测进化历史情景模式Fig 2.2 3 predict evolutionary historical scenarios patterns for J. sigillata i附注 1：N1，N2 代表有效群体大小附注 2：t 代表世代数附注 3：Pop1 包括泡核桃 22 个居群的 377 个个体，Pop2 包括泡核桃 14 个居群的Note1: N1, N2 show effective population sizeNote2: t shows generation numbersNote3: Pop1 includes 377 individuals in 22 populations and Pop2 includes 388populations
【参考文献】：
期刊论文
[1]分子钟假说的基本原理及在古生物等学科中的应用[J]. 刘晓枫,张爱兵. 古生物学报. 2016(03)
[2]胡桃属植物分子系统发育和生物地理研究进展[J]. 赵鹏,周惠娟,刘占林,Keith E. Woeste,呼东峰,党萌,李忠虎,王玛丽,赵桂仿. 林业科学. 2014(11)
[3]珍贵树种核桃楸的生态学问题及培育前景[J]. 马万里,罗菊春,荆涛,Joni Kujansuu. 内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版). 2005(04)
[4]云南省珍稀濒危植物及国家保护植物区系成分分析[J]. 邹新慧,何平,陈建民,马洪菊. 西南师范大学学报(自然科学版). 2002(06)
[5]种间杂交培育的5个核桃早实新品系[J]. 范志远,习学良. 湖南林业科技. 2002(01)
[6]运用RAPD对核桃属种间亲缘关系的研究[J]. 吴燕民,裴东,奚声珂,李嘉瑞. 园艺学报. 2000(01)
[7]云南麻核桃授粉特性研究[J]. 王大来,刘德良,张琴. 湖南林业科技. 1999(01)
硕士论文
[1]胡桃组植物遗传标记开发应用和中国核桃谱系进化历史研究[D]. 冯晓佳.西北大学 2018
[2]枹栎和短柄枹栎的居群遗传结构和谱系地理学研究[D]. 王雁红.西北大学 2015
本文编号：3429537
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