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香蕉响应盐胁迫转录组及蛋白质组分析

发布时间:2021-10-25 19:41
  香蕉是我国具有国际竞争力优势农产品之一,但它属于盐敏感植物。生产上,我国香蕉种植最适宜区海南、广东湛江等地区,随着土地盐碱化日益严重,阻碍香蕉产业可持续发展。而有关转录组和蛋白质组研究香蕉响应盐胁迫未见报道,本实验采用RNA-Seq技术和iTRAQ技术研究我国主栽品种巴西蕉(Musa paradisiaca),在60 mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、12、24h根和叶片转录组和蛋白质组分析,有望揭示香蕉应答盐害逆境的分子生物学调控机制,为香蕉分子育种打下基础。研究结果如下:1、巴西蕉根和叶不同组织在响应盐胁迫过程中存在着差异。盐胁迫处理12 h根的差异基因有542个上调、924个下调;叶片的差异基因有2938个上调、2727个下调;盐胁迫处理24 h根的差异基因有507个上调、1582个下调;叶片差异基因有834个上调、893个下调;盐胁迫12h/24h根差异基因242个上调、1116个下调;叶差异基因有2014上调、2753个下调。从整体上分析,叶片差异基因数量比根多且多数上调,而根正好相反;叶片在12h差异基因数量比24h多,但根24h的差异基因数量比12 h多并且多数下调。... 

【文章来源】:海南大学海南省 211工程院校

【文章页数】:61 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

香蕉响应盐胁迫转录组及蛋白质组分析


图1根(A)和叶(B)样品间的差异基因统计??

功能注释,盐胁迫,离子载体,转导


activity)所占比例取局],禹子载体活性(electron?carrier?activity)、分子车f导活性??(molcculartransduceractivity)和信号转导活性(signaltransduceractivity)所占的比??例取低;叶片仅在离子载体活性(electron?carrier?activity)的比例最低(图2)。??12??

香蕉,盐胁迫,功能注释,比例


?香蕉响应盐胁迫转录组及蛋白质组分析???比例最高,根部在分子传导活性(molecular?transducer?activity)比例最低,叶片在转??录因子活性,结合蛋白(transcription?factor?activity,protein?binding)比例最低(图?3)。??

【参考文献】:
期刊论文
[1]实时荧光定量检测盐胁迫下香蕉幼苗CaM和Ca2+-ATPase基因的相对表达量[J]. 王文昌,周双云,乔飞,吉福桑,李元元,李新国.  分子植物育种. 2017(05)
[2]南方型紫花苜蓿苗期叶片盐胁迫差异蛋白分析[J]. 裴翠明,张振亚,马进.  农业生物技术学报. 2016(11)
[3]南方型紫花苜蓿叶片响应盐胁迫蛋白质组和转录组关联分析[J]. 马进,郑钢,裴翠明,张振亚.  核农学报. 2016(09)
[4]基于转录组和蛋白质组关联研究技术筛选紫花苜蓿耐盐相关候选基因[J]. 张振亚,裴翠明,马进.  植物生理学报. 2016(03)
[5]基于iTRAQ质谱分析技术筛选南方型紫花苜蓿根部响应盐胁迫差异表达蛋白[J]. 马进,郑钢,裴翠明,张振亚.  农业生物技术学报. 2016(04)
[6]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析[J]. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟.  分子植物育种. 2015(12)
[7]南方型紫花苜蓿叶片盐胁迫应答基因鉴定与分析[J]. 马进,郑钢.  农业生物技术学报. 2015(12)
[8]燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系[J]. 高彩婷,刘景辉,徐寿军,张玉芹,于华荣.  西北植物学报. 2015(07)
[9]花生中胁迫相关基因AhDHN1的克隆及非生物胁迫下表达分析[J]. 陈娜,胡冬青,潘丽娟,迟晓元,陈明娜,王通,王冕,杨珍,禹山林.  核农学报. 2014(12)
[10]盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析[J]. 陈嘉贝,张芙蓉,黄丹枫,张利达,张屹东.  植物生理学报. 2014(02)

博士论文
[1]白榆耐盐生理生态机制研究[D]. 刘炳响.河北农业大学 2012
[2]紫花苜蓿响应盐胁迫的蛋白质组研究[D]. 熊军波.中国农业科学院 2011
[3]小麦耐盐渐渗系山融3号根系盐胁迫转录组分析及相关基因功能研究[D]. 李朔.山东大学 2009

硕士论文
[1]紫花苜蓿耐盐生理特性及转录组分析[D]. 江超.山东农业大学 2014
[2]2种不同基因组类型香蕉耐盐生理响应及其盐胁迫下Ca2+的动态调节[D]. 周双云.海南大学 2014
[3]棉花苗期叶片盐胁迫差异蛋白质分析[D]. 许菲菲.中国农业科学院 2014
[4]盐胁迫下两个甜瓜品种的转录组分析[D]. 陈嘉贝.上海交通大学 2014
[5]基于RNA-Seq技术的国产沉香转录组测序及数字基因表达谱分析[D]. 吴宏清.江西农业大学 2013
[6]不同盐碱胁迫条件下玉米根部基因的差异表达谱分析[D]. 曲昕宁.吉林大学 2012
[7]盐胁迫下小麦叶片蛋白质组差异研究[D]. 金艳.河南农业大学 2009



本文编号:3458053

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