2种食用菌NADPH氧化酶A蛋白结构分析

发布时间：2021-11-03 03:29

　　NADPH氧化酶A （NADPH oxidase A,Nox A）为NADPH氧化酶亚家族一员,可催化产生ROS。通过检索Gen Bank中Nox A序列,利用生物信息学方法分析了2种食用菌Nox A蛋白结构特征。结果表明,在Gen Bank中仅搜索到平菇Nox A （Po Nox A）与双色蜡蘑Nox A （Lb Nox A）序列。进一步序列比对发现,2种Nox A序列同源性达80%,均包含2个FAD结合模体、4个NADPH结合模体以及4个亚铁红素结合位点（heme binding）中的保守组氨酸残基;蛋白结构分析表明,2种Nox A一级结构、二级结构及三级结构较为相似,但在结构数量上也存在一定差异;2种Nox A均属于跨膜蛋白,但Po Nox A蛋白N端存在5个跨膜结构,Lb Nox A蛋白N端存在6个跨膜结构,中间区域存在1个跨膜结构;2种Nox A蛋白质中均存在磷酸化位点修饰,具有潜在的磷酸激酶特性。但2种Nox A蛋白质中丝氨酸、苏氨酸及酪氨酸修饰位点个数和存在位置不同;进化分析表明,2种Nox A基因亲缘关系最近,位于进化树的同一分枝。因此推测2种食用菌Nox A氧化酶功能... 

【文章来源】：中国食用菌. 2020,39(08)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

Nox A蛋白序列比对结果

Ex PASy分析蛋白分子量与等电点结果表明，Po Nox A分子式为C2955H4422N780O777S23，理论分子量为64.04 k Da，理论等电点为9.30，在哺乳动物细胞中半衰期为30 h，脂肪系数为80.14，不稳定系数为34.43，为稳定蛋白；Lb Nox A分子式为C2908H4394N770O761S20，理论分子量为63.00 k Da，理论等电点为9.39，在哺乳动物细胞中半衰期为30 h，脂肪系数为87.66，不稳定系数为37.06，为稳定蛋白。2种Nox A蛋白分子量、等电点、脂肪系数、不稳定系数等均较接近。蛋白亲疏水特性分析结果见图2。由图2可知，Po Nox A蛋白最大亲水位点为第154位，氨基酸为异亮氨酸（I），分值为3.133；最小疏水位点均为第342位，氨基酸为赖氨酸（K），分值为-2.389，亲水性的总平均值（grand average of hydropathicity,GRAVY）为-0.060。Lb Nox A蛋白最大亲水位点为第153位，氨基酸为异亮氨酸（I），分值为3.178；最小疏水位点均为第392位，氨基酸为酪氨酸（Y），分值为-2.289,GRAVY为0.004。因此，2种Nox A蛋白最大亲水位点较为相似，但最小亲水位点不同。

SMART分析了Nox A蛋白结构特征，预测结果见图3。蛋白特征位点分析结果见表2。由图3、表2可知，在Po Nox A蛋白N端存在5个跨膜结构，2个低复杂度结构；而Lb Nox A蛋白N端存在6个跨膜结构，中间区域存在1个跨膜结构，未预测到低复杂度结构存在。因此，2种食用菌Nox A蛋白N端存在5个保守的跨膜结构结构，且存在位置基本一致，仅相差1个位点。


本文编号：3472950