菠萝蜜EST-SSR标记发掘利用及遗传图谱构建
发布时间：2021-11-20 23:00
鉴于目前可用于菠萝蜜遗传研究的分子标记数量少,遗传图谱构建研究进度慢,为了提高菠萝蜜分子标记辅助育种效率,促进菠萝蜜遗传改良,本研究通过菠萝蜜EST-SSR标记的稳定性和多态性揭示能力分析,尝试将其用于菠萝蜜种质资源遗传多样性和遗传图谱构建研究。主要研究结果如下:（1）本研究共设计出479对EST-SSR引物,其中399对在菠萝蜜随机选取的8份种质的叶片DNA上能有效扩增,282对具有多态性,多态性扩增引物占58.87%。（2）从中选择60对能够清晰扩增的多态性引物,分析了64份菠萝蜜种质资源的遗传多样性。这60对EST-SSR引物共扩增出188条带,不同引物的扩增条带数在211之间,平均为3.13条;其中有168条为多态性条带,多态性率为89.36%;每对引物的多态性信息含量（PIC）范围为0.40770.9589,平均PIC值为0.7922。证实了EST-SSR标记多态性揭示能力较强。（3）由UPGMA聚类分析可知,在遗传相似系数0.6881处,可将64份菠萝蜜种质资源分成2大类群;在遗传相似系数0.7325处,第二大类群虽又可分成4个亚...
【文章来源】：广东海洋大学广东省
【文章页数】：41 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 菠萝蜜简介
1.2 菠萝蜜种质资源遗传多样性研究现状
1.3 ESR-SSR标记开发与应用
1.3.1 EST-SSR标记概述
1.3.2 EST-SSR标记的开发
1.3.3 EST-SSR标记在遗传多样性和遗传连锁作图中的应用
1.4 多年生木本植物遗传连锁图谱构建现状与原理
1.4.1 多年生木本植物的遗传连锁图谱构建现状
1.4.2 多年生木本植物的遗传连锁图谱构建原理
1.5 研究目的与意义
2 菠萝蜜种质资源遗传多样性分析
2.1 材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 基因组总DNA提取
2.1.3 DNA纯度与浓度检测
2.1.4 EST-SSR引物设计
2.1.5 EST-SSR标记筛选与SSR序列分析
2.1.6 遗传多样性分析
2.2 结果与分析
2.2.1 菠萝蜜EST-SSR引物的筛选
2.2.2 菠萝蜜种质遗传多样性分析
2.2.3 菠萝蜜种质的聚类分析
2.3 讨论
3 菠萝蜜遗传连锁图谱的构建
3.1 材料与方法
3.1.1 遗传连锁作图群体构建
3.1.2 DNA的提取与检测
3.1.3 EST-SSR基因分型
3.1.4 连锁遗传图谱构建
3.2 结果与分析
3.2.1 DNA提取结果
3.2.2 多态性引物筛选
3.2.3 基因分型与偏分离检测
3.2.4 遗传连锁图谱构建
3.3 讨论
4 结论
4.1 EST-SSR标记在菠萝蜜种质遗传多样性分析中的作用
4.2 EST-SSR标记在菠萝蜜遗传连锁图谱上的分布
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于EST-SSR标记的胡椒栽培种质遗传多样性研究[J]. 伍宝朵,胡丽松,范睿,邬华松,郝朝运. 中国热带农业. 2016(01)
[2]菠萝蜜果实成熟过程中香气成分组成及变化规律研究[J]. 贺书珍,张彦军,徐飞,朱科学,谭乐和,吴刚,付莉莉. 热带作物学报. 2015(09)
[3]菠萝蜜种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 吴刚,胡丽松,黄丽芳,郝朝运,谭乐和. 热带作物学报. 2015(08)
[4]不同株系菠萝蜜染色体倍性及基因组大小分析[J]. 杨转英,吴传龙,丰锋,吕庆芳,王俊宁,叶春海. 果树学报. 2015(04)
[5]松属EST-SSR引物开发及马尾松-湿地松种间特异性鉴别引物筛选[J]. 贾婕,冯源恒,杨章旗,黄永利. 分子植物育种. 2014(05)
[6]高效液相色谱法测定菠萝蜜果实中的葡萄糖、果糖和蔗糖[J]. 李映志,刘胜辉,朱祝英,杨玉梅. 食品科学. 2014(12)
[7]小麦穗部组织EST-SSR标记引物开发及其在小麦遗传多样性分析中的应用[J]. 刘泽涛,苑少华,杨迪,王玉昆,张立平,赵昌平,刘丽华,李宏博,庞斌双. 麦类作物学报. 2013(06)
[8]菠萝蜜果实糖苷酶和多聚半乳糖醛酸酶的活性变化[J]. 董黎梨,汪永保,李映志,李洪波,张佳琦,叶春海. 南方农业学报. 2013(06)
[9]顶空固相微萃取和气相色谱-质谱法测定菠萝蜜果肉中的香气成分[J]. 李洪波,刘胜辉,李映志,毛琪,叶春海. 热带作物学报. 2013(04)
[10]棉花EST-SSR新标记特征及其遗传多样性分析[J]. 梁维维,张大伟,陈全家,曲延英,高文伟. 新疆农业大学学报. 2013(02)
博士论文
[1]小麦高密度遗传图谱的构建和产量相关性状的QTL分析[D]. 高明刚.山东农业大学 2014
硕士论文
[1]越橘EST-SSR分子标记的开发及遗传多样性分析[D]. 郭瑞雪.吉林农业大学 2014
[2]菠萝蜜SSR分子标记的开发及其在种质资源遗传多样性分析中的应用[D]. 王艳红.广东海洋大学 2010
本文编号：3508253
【文章来源】：广东海洋大学广东省
【文章页数】：41 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 菠萝蜜简介
1.2 菠萝蜜种质资源遗传多样性研究现状
1.3 ESR-SSR标记开发与应用
1.3.1 EST-SSR标记概述
1.3.2 EST-SSR标记的开发
1.3.3 EST-SSR标记在遗传多样性和遗传连锁作图中的应用
1.4 多年生木本植物遗传连锁图谱构建现状与原理
1.4.1 多年生木本植物的遗传连锁图谱构建现状
1.4.2 多年生木本植物的遗传连锁图谱构建原理
1.5 研究目的与意义
2 菠萝蜜种质资源遗传多样性分析
2.1 材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 基因组总DNA提取
2.1.3 DNA纯度与浓度检测
2.1.4 EST-SSR引物设计
2.1.5 EST-SSR标记筛选与SSR序列分析
2.1.6 遗传多样性分析
2.2 结果与分析
2.2.1 菠萝蜜EST-SSR引物的筛选
2.2.2 菠萝蜜种质遗传多样性分析
2.2.3 菠萝蜜种质的聚类分析
2.3 讨论
3 菠萝蜜遗传连锁图谱的构建
3.1 材料与方法
3.1.1 遗传连锁作图群体构建
3.1.2 DNA的提取与检测
3.1.3 EST-SSR基因分型
3.1.4 连锁遗传图谱构建
3.2 结果与分析
3.2.1 DNA提取结果
3.2.2 多态性引物筛选
3.2.3 基因分型与偏分离检测
3.2.4 遗传连锁图谱构建
3.3 讨论
4 结论
4.1 EST-SSR标记在菠萝蜜种质遗传多样性分析中的作用
4.2 EST-SSR标记在菠萝蜜遗传连锁图谱上的分布
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于EST-SSR标记的胡椒栽培种质遗传多样性研究[J]. 伍宝朵,胡丽松,范睿,邬华松,郝朝运. 中国热带农业. 2016(01)
[2]菠萝蜜果实成熟过程中香气成分组成及变化规律研究[J]. 贺书珍,张彦军,徐飞,朱科学,谭乐和,吴刚,付莉莉. 热带作物学报. 2015(09)
[3]菠萝蜜种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 吴刚,胡丽松,黄丽芳,郝朝运,谭乐和. 热带作物学报. 2015(08)
[4]不同株系菠萝蜜染色体倍性及基因组大小分析[J]. 杨转英,吴传龙,丰锋,吕庆芳,王俊宁,叶春海. 果树学报. 2015(04)
[5]松属EST-SSR引物开发及马尾松-湿地松种间特异性鉴别引物筛选[J]. 贾婕,冯源恒,杨章旗,黄永利. 分子植物育种. 2014(05)
[6]高效液相色谱法测定菠萝蜜果实中的葡萄糖、果糖和蔗糖[J]. 李映志,刘胜辉,朱祝英,杨玉梅. 食品科学. 2014(12)
[7]小麦穗部组织EST-SSR标记引物开发及其在小麦遗传多样性分析中的应用[J]. 刘泽涛,苑少华,杨迪,王玉昆,张立平,赵昌平,刘丽华,李宏博,庞斌双. 麦类作物学报. 2013(06)
[8]菠萝蜜果实糖苷酶和多聚半乳糖醛酸酶的活性变化[J]. 董黎梨,汪永保,李映志,李洪波,张佳琦,叶春海. 南方农业学报. 2013(06)
[9]顶空固相微萃取和气相色谱-质谱法测定菠萝蜜果肉中的香气成分[J]. 李洪波,刘胜辉,李映志,毛琪,叶春海. 热带作物学报. 2013(04)
[10]棉花EST-SSR新标记特征及其遗传多样性分析[J]. 梁维维,张大伟,陈全家,曲延英,高文伟. 新疆农业大学学报. 2013(02)
博士论文
[1]小麦高密度遗传图谱的构建和产量相关性状的QTL分析[D]. 高明刚.山东农业大学 2014
硕士论文
[1]越橘EST-SSR分子标记的开发及遗传多样性分析[D]. 郭瑞雪.吉林农业大学 2014
[2]菠萝蜜SSR分子标记的开发及其在种质资源遗传多样性分析中的应用[D]. 王艳红.广东海洋大学 2010
本文编号：3508253
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/yylw/3508253.html
