番茄OFP20基因的克隆及功能初步分析
发布时间：2021-11-20 23:54
番茄（Solanum lycopersicum）是非常重要的蔬菜作物,也是研究果实发育、成熟和形状的模式植物。果实形状作为番茄的重要外观品质,直接影响果实的商品价值。OVATE family proteins（OFPs）是植物特有的蛋白家族,在调控植物生长发育尤其是果实的发育方面起着非常重要的作用。番茄的OFP家族包含31个成员,但目前除了OVATE被证明可以调控番茄果实的长度之外,其余OFP家族成员中SlOFP20在开花当天的花中表达量最高。为了明确SlOFP20是否在番茄果形调控方面起作用,本研究克隆了SlOFP20基因,构建了SlOFP20的过表达及沉默表达载体,并分别遗传转化番茄,获得了过表达转基因株系,初步明确了其在番茄果实发育中的作用。主要研究结果如下:1.生物信息学分析发现,SlOFP20的DNA序列无内含子,S1OFP20定位在细胞核中且OVATE结构域位于第259-315个氨基酸之间。SlOFP20的ATG上游2Kb区域共有22个顺式作用元件,其中能够与MYB转录因子结合的有1个,能够参与调控赤霉素、生长素生物合成的顺式作用位点有3个。2.同源进化分析发现,S1OFP...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１?ＲＮＡ－ｓｅｑ分析５７０／＾２０在野生型番茄种ＬＡ１５８９?（Ａ）和栽培种Ｈｅｉｎｚ?（Ｂ）中各组织器官及果实发育不同时期的??表达量（数据来源于番前基因组网站ｈｔｔｐｓ：／／ｓｏｌｇｅｎｏｍｉｃｓ．ｎｅ?
先使用Ｑｕｂｉｔ２．０进行初步定量，稀释文库至库的插入片段长度（ｉｎｓｅｒｔ?ｓｉｚｅ）进行检测，ｉｎｓｅｒｔ?ｓｉｚ对文库的有效浓度进行准确定量（文库有效浓度＞２，把不同文库按照有效浓度及目标下机数据量的需学分析流程??序列（Ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ?Ｒｅａｄｓ）后，在有相关物种参考序流程进行生物信息分析：??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄转录组学研究进展[J]. 刘冠,赵婷婷,杨欢欢,张冬野,姜景彬,李景富,许向阳. 基因组学与应用生物学. 2016(10)
[2]番茄基因组学研究进展[J]. 张立慧,王志敏,郭航,吕焕青,安礼渝,汤青林,宋明. 园艺学报. 2014(09)
[3]蔬菜作物果形研究进展[J]. 潘玉朋,孟焕文,陈书霞,李玉红,申晓青,程智慧. 中国蔬菜. 2013(04)
[4]番茄畸形果的发生与防治[J]. 常丽,李敏慧. 农村科学实验. 2011(10)
[5]园艺作物果形遗传研究进展[J]. 乔军,刘富中,陈钰辉,连勇. 园艺学报. 2011(07)
[6]番茄心室形成的遗传规律初探(英文)[J]. 李悦,李天来,王丹. 遗传学报. 2007(11)
[7]番茄畸形果研究进展[J]. 赵建锋,秦进华,孙玉东,朱明超,刘友华. 安徽农业科学. 2007(31)
[8]GSDS:基因结构显示系统[J]. 郭安源,朱其慧,陈新,罗静初. 遗传. 2007(08)
[9]植物LEAFY同源基因的研究进展[J]. 马月萍,陈凡,戴思兰. 植物学通报. 2005(05)
[10]影响番茄花芽分化的因素及与畸形果发生的关系[J]. 杨晖,蒋新龙,陈先知. 长江蔬菜. 2005(02)
博士论文
[1]水稻OsOFP转录因子家族基因克隆与功能分析[D]. 于慧.吉林大学 2015
[2]控制茄子果型相关性状关键基因的克隆及功能研究[D]. 韩洪强.上海交通大学 2014
[3]拟南芥微管结合蛋白WDL3调控下胚轴生长的分子机理[D]. 刘小敏.中国农业大学 2014
[4]番茄耐寒种质低温胁迫下的转录组分析及相关基因功能鉴定[D]. 刘辉.华中农业大学 2012
[5]水稻粒形、粒重基因GS5及垩白基因Chalk5的克隆与功能研究[D]. 李一博.华中农业大学 2011
硕士论文
[1]葡萄果形相关基因的克隆及功能分析[D]. 宋新新.南京农业大学 2014
[2]拟南芥spe1及da1增强子与抑制子的筛选鉴定[D]. 田媛媛.东北大学 2010
[3]番茄在中国的传播及其影响研究[D]. 刘玉霞.南京农业大学 2007
本文编号：3508337
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１?ＲＮＡ－ｓｅｑ分析５７０／＾２０在野生型番茄种ＬＡ１５８９?（Ａ）和栽培种Ｈｅｉｎｚ?（Ｂ）中各组织器官及果实发育不同时期的??表达量（数据来源于番前基因组网站ｈｔｔｐｓ：／／ｓｏｌｇｅｎｏｍｉｃｓ．ｎｅ?
先使用Ｑｕｂｉｔ２．０进行初步定量，稀释文库至库的插入片段长度（ｉｎｓｅｒｔ?ｓｉｚｅ）进行检测，ｉｎｓｅｒｔ?ｓｉｚ对文库的有效浓度进行准确定量（文库有效浓度＞２，把不同文库按照有效浓度及目标下机数据量的需学分析流程??序列（Ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ?Ｒｅａｄｓ）后，在有相关物种参考序流程进行生物信息分析：??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄转录组学研究进展[J]. 刘冠,赵婷婷,杨欢欢,张冬野,姜景彬,李景富,许向阳. 基因组学与应用生物学. 2016(10)
[2]番茄基因组学研究进展[J]. 张立慧,王志敏,郭航,吕焕青,安礼渝,汤青林,宋明. 园艺学报. 2014(09)
[3]蔬菜作物果形研究进展[J]. 潘玉朋,孟焕文,陈书霞,李玉红,申晓青,程智慧. 中国蔬菜. 2013(04)
[4]番茄畸形果的发生与防治[J]. 常丽,李敏慧. 农村科学实验. 2011(10)
[5]园艺作物果形遗传研究进展[J]. 乔军,刘富中,陈钰辉,连勇. 园艺学报. 2011(07)
[6]番茄心室形成的遗传规律初探(英文)[J]. 李悦,李天来,王丹. 遗传学报. 2007(11)
[7]番茄畸形果研究进展[J]. 赵建锋,秦进华,孙玉东,朱明超,刘友华. 安徽农业科学. 2007(31)
[8]GSDS:基因结构显示系统[J]. 郭安源,朱其慧,陈新,罗静初. 遗传. 2007(08)
[9]植物LEAFY同源基因的研究进展[J]. 马月萍,陈凡,戴思兰. 植物学通报. 2005(05)
[10]影响番茄花芽分化的因素及与畸形果发生的关系[J]. 杨晖,蒋新龙,陈先知. 长江蔬菜. 2005(02)
博士论文
[1]水稻OsOFP转录因子家族基因克隆与功能分析[D]. 于慧.吉林大学 2015
[2]控制茄子果型相关性状关键基因的克隆及功能研究[D]. 韩洪强.上海交通大学 2014
[3]拟南芥微管结合蛋白WDL3调控下胚轴生长的分子机理[D]. 刘小敏.中国农业大学 2014
[4]番茄耐寒种质低温胁迫下的转录组分析及相关基因功能鉴定[D]. 刘辉.华中农业大学 2012
[5]水稻粒形、粒重基因GS5及垩白基因Chalk5的克隆与功能研究[D]. 李一博.华中农业大学 2011
硕士论文
[1]葡萄果形相关基因的克隆及功能分析[D]. 宋新新.南京农业大学 2014
[2]拟南芥spe1及da1增强子与抑制子的筛选鉴定[D]. 田媛媛.东北大学 2010
[3]番茄在中国的传播及其影响研究[D]. 刘玉霞.南京农业大学 2007
本文编号：3508337
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