草莓EST-SSR引物的开发及四季草莓成花机理的初步研究
发布时间：2021-11-23 08:06
草莓（Fragaria ananassa Duchesne）香气浓郁,酸甜宜人,倍受广大消费者的喜爱,是重要的经济果树。由于草莓品种繁多且表型相似,难以靠肉眼区分,加大了培育优质草莓的难度,需借助分子辅助手段对草莓品种进行鉴定。EST-SSR分子标记因其高重复性、易操作的特性深受国内外科研工作者的青睐,草莓EST-SSR引物也被陆续开发出来,但相较于其他果树而言,草莓的有效EST-SSR标记数量仍然偏少。因此本研究利用公共数据库公布的草莓EST序列搜索并筛选合适的SSR位点,设计并合成草莓EST-SSR引物,在分子遗传方面对25个草莓品种进行鉴定及区分。此外,草莓有一季草莓与四季草莓之分,研究草莓周年成花机制以促进草莓花芽分化具有较大的实际应用价值。故本研究以四季草莓‘蒙特瑞’和一季草莓‘章姬’为材料,比较不同生长发育阶段中两种草莓植株的碳氮比差异以及Fa LFY、Fa SOC1、Fa AP1、Fa FT、miR156和miR172基因的表达模式差异,以期初步探讨四季草莓的成花机制,为其他农作物培育四季品种提供理论依据。具体研究结果如下:1.从NCBI上搜索并下载59795条草莓EST...
【文章来源】：杭州师范大学浙江省
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
二核苷酸重复类型中不同基元所占百分比Figure2-1Percentageofdifferentmotifsindinucleotide
杭州师范大学硕士学位论文草莓EST-SSR标记的开发及25个草莓品种指纹图谱的构建20图2-1二核苷酸重复类型中不同基元所占百分比Figure2-1PercentageofdifferentmotifsindinucleotideSSR图2-2三核苷酸重复类型中不同基元所占百分比Figure2-2PercentageofdifferentmotifsinTrinucleotideSSR从重复长度角度分析，二核苷酸重复变化范围最大，从10~130bp；其次为三核苷酸，从15~60bp；六核苷酸重复的平均长度最大，达到31bp，而二核苷酸重复长度仅15.56bp，是所有重复类型中最小的（表2-5）。
杭州师范大学硕士学位论文草莓EST-SSR标记的开发及25个草莓品种指纹图谱的构建231003CAACAGCATCCCAGAACTCACCACCACGAAAGCCAAATAC（CT）55822100.01822GCCGCATCCCTCTTTTCTATTGATTGGGTGAGACGGTGAC（TC）55822100.09140ACTCGCTTTCTGAATCTCCCCAGCACGATCCTCTGCACTA（CCT）75611100.0合计Summary584781.02.3.4草莓指纹图谱的建立最终按照电泳图结果，挑选出了7对扩增效果好且多态性信息多样的核心引物，引物编码分别为：0573（A）、4494（B）、1245（C）、2863（D）、2828（E）、8149（F）和3378（G），再根据这7对核心引物的扩增情况，分析它们在25个草莓品种中多态性扩增的带型，结果发现标记A-G分别有4、3、7、5、5、6、5种带型（图2-3）。7对引物的扩增结果如图2-4、2-5、2-6、2-7、2-8、2-9、2-10所示。图2-37个核心引物在25个草莓品种中扩增的多态性带型注：1-7：带型数。Figure2-3Polymorphicbandtypesobtainedfromisolatesusing7coremarkersin25cultivarsNote:1-7:Numberofbelttype.图2-4引物ASSR扩增结果Figure2-4AmplificationresultsofAprimer
【参考文献】：
期刊论文
[1]温度和盐胁迫对草莓开花进程和相关基因表达的影响[J]. 董天宇,朱旭东,张克坤,房经贵,石倩蔚,贾海锋. 西北植物学报. 2019(04)
[2]基于转录组测序的槜李EST-SSR标记开发[J]. 李军,李白,李斌,陆其华. 分子植物育种. 2020(01)
[3]低温对草莓花芽分化的影响[J]. 韩佩汝,张正伟,郑静,宋丹,梁佳惠,祝保英,王红清. 中国农业大学学报. 2019(01)
[4]龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析[J]. 胡文舜,陈秀萍,郑少泉. 园艺学报. 2019(07)
[5]基于转录组测序的油梨EST-SSR引物开发[J]. 应东山,唐浩,韩瑞玺,王文林,王明,王琴飞,汤秀华,张如莲. 热带作物学报. 2018(12)
[6]桃EST-SSR引物的开发及通用性分析[J]. 张勇,王清明,叶宇芸,汤浩茹. 分子植物育种. 2019(07)
[7]拟南芥和十字花科蔬菜花序发育调控机制研究进展[J]. 王小权,李晟男,张俊利,王志敏,魏大勇,汤青林. 园艺学报. 2018(09)
[8]蒙古黄芪转录组SSR标记开发及遗传多样性研究[J]. 贺润丽,韩毅丽,王芳,刘计权,王莉花. 中国中药杂志. 2018(09)
[9]福建省草莓主栽与引进品种的SSR分子标记鉴定[J]. 陈坚,郑益平,郭文杰,杨志敏,庄志鸿,朱炳耀. 福建农业学报. 2018(02)
[10]草莓的花芽分化及其影响因素研究进展[J]. 张学明,陈玉波,侯佳贤,姚环宇,郑亚杰. 吉林农业. 2017(21)
博士论文
[1]基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D]. 王丽鸳.中国农业科学院 2011
硕士论文
[1]光质调控番茄植株生长及果实品质的机理研究[D]. 张现征.山东农业大学 2018
[2]基于转录组测序枇杷EST-SSR标记的开发与利用[D]. 芶维.四川农业大学 2016
[3]丹参基因组SSR标记的开发及其在连锁图谱构建的应用[D]. 郭林林.山东农业大学 2016
[4]基于蔓越橘果实转录组的新型EST-SSR标记的开发及鉴定[D]. 耿金曼.吉林农业大学 2016
[5]日中性草莓花芽分化及生化物质变化研究[D]. 庞夫花.安徽大学 2015
[6]草莓成花相关基因的克隆及表达分析[D]. 邹冬梅.沈阳农业大学 2012
[7]分子标记辅助选择转移抗稻瘟病和白叶枯病基因改良水稻恢复系的研究[D]. 杜虎.江西农业大学 2012
[8]草莓miR156靶基因SPL9的克隆及表达分析[D]. 赵晓初.沈阳农业大学 2011
[9]草莓属（Fragaria）植物亲缘关系的RAPD研究[D]. 张颖君.河北农业大学 2003
本文编号：3513467
【文章来源】：杭州师范大学浙江省
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
二核苷酸重复类型中不同基元所占百分比Figure2-1Percentageofdifferentmotifsindinucleotide
杭州师范大学硕士学位论文草莓EST-SSR标记的开发及25个草莓品种指纹图谱的构建20图2-1二核苷酸重复类型中不同基元所占百分比Figure2-1PercentageofdifferentmotifsindinucleotideSSR图2-2三核苷酸重复类型中不同基元所占百分比Figure2-2PercentageofdifferentmotifsinTrinucleotideSSR从重复长度角度分析，二核苷酸重复变化范围最大，从10~130bp；其次为三核苷酸，从15~60bp；六核苷酸重复的平均长度最大，达到31bp，而二核苷酸重复长度仅15.56bp，是所有重复类型中最小的（表2-5）。
杭州师范大学硕士学位论文草莓EST-SSR标记的开发及25个草莓品种指纹图谱的构建231003CAACAGCATCCCAGAACTCACCACCACGAAAGCCAAATAC（CT）55822100.01822GCCGCATCCCTCTTTTCTATTGATTGGGTGAGACGGTGAC（TC）55822100.09140ACTCGCTTTCTGAATCTCCCCAGCACGATCCTCTGCACTA（CCT）75611100.0合计Summary584781.02.3.4草莓指纹图谱的建立最终按照电泳图结果，挑选出了7对扩增效果好且多态性信息多样的核心引物，引物编码分别为：0573（A）、4494（B）、1245（C）、2863（D）、2828（E）、8149（F）和3378（G），再根据这7对核心引物的扩增情况，分析它们在25个草莓品种中多态性扩增的带型，结果发现标记A-G分别有4、3、7、5、5、6、5种带型（图2-3）。7对引物的扩增结果如图2-4、2-5、2-6、2-7、2-8、2-9、2-10所示。图2-37个核心引物在25个草莓品种中扩增的多态性带型注：1-7：带型数。Figure2-3Polymorphicbandtypesobtainedfromisolatesusing7coremarkersin25cultivarsNote:1-7:Numberofbelttype.图2-4引物ASSR扩增结果Figure2-4AmplificationresultsofAprimer
【参考文献】：
期刊论文
[1]温度和盐胁迫对草莓开花进程和相关基因表达的影响[J]. 董天宇,朱旭东,张克坤,房经贵,石倩蔚,贾海锋. 西北植物学报. 2019(04)
[2]基于转录组测序的槜李EST-SSR标记开发[J]. 李军,李白,李斌,陆其华. 分子植物育种. 2020(01)
[3]低温对草莓花芽分化的影响[J]. 韩佩汝,张正伟,郑静,宋丹,梁佳惠,祝保英,王红清. 中国农业大学学报. 2019(01)
[4]龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析[J]. 胡文舜,陈秀萍,郑少泉. 园艺学报. 2019(07)
[5]基于转录组测序的油梨EST-SSR引物开发[J]. 应东山,唐浩,韩瑞玺,王文林,王明,王琴飞,汤秀华,张如莲. 热带作物学报. 2018(12)
[6]桃EST-SSR引物的开发及通用性分析[J]. 张勇,王清明,叶宇芸,汤浩茹. 分子植物育种. 2019(07)
[7]拟南芥和十字花科蔬菜花序发育调控机制研究进展[J]. 王小权,李晟男,张俊利,王志敏,魏大勇,汤青林. 园艺学报. 2018(09)
[8]蒙古黄芪转录组SSR标记开发及遗传多样性研究[J]. 贺润丽,韩毅丽,王芳,刘计权,王莉花. 中国中药杂志. 2018(09)
[9]福建省草莓主栽与引进品种的SSR分子标记鉴定[J]. 陈坚,郑益平,郭文杰,杨志敏,庄志鸿,朱炳耀. 福建农业学报. 2018(02)
[10]草莓的花芽分化及其影响因素研究进展[J]. 张学明,陈玉波,侯佳贤,姚环宇,郑亚杰. 吉林农业. 2017(21)
博士论文
[1]基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D]. 王丽鸳.中国农业科学院 2011
硕士论文
[1]光质调控番茄植株生长及果实品质的机理研究[D]. 张现征.山东农业大学 2018
[2]基于转录组测序枇杷EST-SSR标记的开发与利用[D]. 芶维.四川农业大学 2016
[3]丹参基因组SSR标记的开发及其在连锁图谱构建的应用[D]. 郭林林.山东农业大学 2016
[4]基于蔓越橘果实转录组的新型EST-SSR标记的开发及鉴定[D]. 耿金曼.吉林农业大学 2016
[5]日中性草莓花芽分化及生化物质变化研究[D]. 庞夫花.安徽大学 2015
[6]草莓成花相关基因的克隆及表达分析[D]. 邹冬梅.沈阳农业大学 2012
[7]分子标记辅助选择转移抗稻瘟病和白叶枯病基因改良水稻恢复系的研究[D]. 杜虎.江西农业大学 2012
[8]草莓miR156靶基因SPL9的克隆及表达分析[D]. 赵晓初.沈阳农业大学 2011
[9]草莓属（Fragaria）植物亲缘关系的RAPD研究[D]. 张颖君.河北农业大学 2003
本文编号：3513467
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