基于SSR标记的香蕉品种指纹图谱及ID构建
发布时间：2021-11-26 00:52
在热带和亚热带地区,香蕉（Musa spp.）既是重要的经济作物也是重要的粮食作物,香蕉产业也是我国的农业支柱产业之一。高效培育优质、丰产和抗病性强的香蕉新品种是香蕉产业的关键所在。而利用分子标记辅助育种可以很大程度地提高育种效率。当前香蕉育种面临的最大的问题是种质资源的遗传背景不清,加上主栽品种单性结实、高度不育和复杂的基因组倍性水平等特点,导致育种亲本选择很困难。因此加快香蕉种质资源的鉴定是香蕉育种的基础。本研究通过利用16个香蕉品种对前期获得的SSR引物进一步筛选,根据SSR引物多态性、稳定性、条带的清晰度及特异性引物的潜力等共筛选出29对多态性较好SSR引物,再利用这29对引物对66个香蕉品种分别进行一代毛细管电泳和基于二代测序的SSR分析。将毛细管电泳结果进行数据处理和整合分析,对66个香蕉品种聚类,建立了42个香蕉品种的SSR指纹图谱库及ID。并对基于二代测序的SSR标记辅助鉴定进行了探究。主要结果如下:（1）利用16个香蕉品种,对前期已发表和初步筛选获得的117对引物进行进一步筛选,选择适用于香蕉SSR指纹图谱库建库的SSR引物,共计29对SSR引物用于下一步的香蕉品种指...
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
RFLP实验原理
图 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34图 2.2 引物 ITBB01 聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig. 2.2 polyacrylamide gel electrophoresis of primer ITBB01注：图 2.1 和图 2.2 从左到右用于本实验的香蕉品种为：巴西、桂蕉 1 号、桂蕉 6 号、南天黄、
第二章 基于聚丙烯酰胺凝胶电泳的 SSR 标记筛选后期的样品检测。如图 2.1，B34 具有作为 Z9 的特异性引物的潜力。图 2.2，ITBB01的条带清晰，位点多，多态信息含量高，PIC=0.9278。表 2.3 为筛选出 29 对具有较好多态性的 SSR 引物的序列信息，重复单元等信息。图 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34
【参考文献】：
期刊论文
[1]“Gros Michel”香蕉胚性细胞悬浮系及遗传转化体系的建立[J]. 邵秀红,吴少平,窦同心,邓贵明,盛鸥,毕方铖,胡春华,易干军,杨乔松. 分子植物育种. 2019(03)
[2]香蕉黑条叶斑病的防治药效试验[J]. 郭涛,黄琦,韦宝义,李成林,王忠文. 广西植保. 2018(03)
[3]植物品种SSR指纹分析专用软件SSR Analyser的研发[J]. 王凤格,李欣,杨扬,易红梅,江彬,张宪晨,霍永学,朱丽,葛建镕,王蕊,任洁,王璐,田红丽,赵久然. 中国农业科学. 2018(12)
[4]适于二碱基重复类型SSR引物指纹分析的连续多峰算法[J]. 王凤格,李欣,易红梅,江彬,任洁,王璐,霍永学,王蕊,葛建镕,杨杨,赵久然. 农业生物技术学报. 2018(06)
[5]利用4-香豆酸:CoA连接酶基因Mu4CL15提高香蕉植株的倒伏抗性[J]. 常胜合,孙威,许桂莺,魏卿,李敬阳,舒海燕. 分子植物育种. 2017(12)
[6]抗枯萎病香蕉新品种‘南天黄’选育[J]. 许林兵,张锡炎,李华平,陈彪,黄秉智,陈维信,冯岩,肖维强,周登博,甘东泉. 热带作物学报. 2017(06)
[7]中国香蕉生产布局的时空演变分析[J]. 顾天竹,周启凡. 江苏农业科学. 2017(05)
[8]香蕉CRISPR/Cas9基因编辑技术体系的建立[J]. 胡春华,邓贵明,孙晓玄,左存武,李春雨,邝瑞彬,杨乔松,易干军. 中国农业科学. 2017(07)
[9]广西香蕉种质资源的SSR分析[J]. 孙嘉曼,尹玲,张进忠,韦绍龙,李朝生,刘金成,卢江. 西南农业学报. 2016(08)
[10]香蕉抗（耐）枯萎病新品种桂蕉9号的选育及其高产栽培技术[J]. 韦绍龙,黄素梅,韦莉萍,韦弟,李朝生,覃柳燕,田丹丹,张进忠,周维,龙盛风,杨柳. 南方农业学报. 2016(04)
博士论文
[1]SSR分子标记开发和在香蕉种质资源遗传分析中的应用[D]. 王静毅.海南大学 2010
硕士论文
[1]应用SSR技术研究香蕉种质资源的遗传多样性[D]. 林丹銮.江西农业大学 2017
[2]香蕉种质资源基因组类型的分子标记及倍性鉴定[D]. 闫佼.江西农业大学 2016
[3]棉花品种的SSR标记鉴定及身份证构建[D]. 张小娟.安徽农业大学 2014
[4]芭蕉—中国园林艺术表现的国粹形态[D]. 丁杰.江西师范大学 2012
[5]香蕉（Musa spp.）种质资源的核型分析和变异的鉴定、筛选[D]. 劳世辉.西南大学 2011
[6]太湖地区水稻地方品种品质基因多样性及部分淀粉品质性状与SSR标记的关联研究[D]. 崔小芬.扬州大学 2011
[7]EMS诱变南高丛越橘（Vaccinium L.）及抗旱变异体的筛选[D]. 张敏.西南大学 2011
[8]农杆菌介导的巴西蕉横切薄片遗传转化体系研究[D]. 黄通谋.海南大学 2010
[9]中国主要蕉类形态学与分子系统学研究[D]. 姜燕.西南农业大学 2005
[10]基于SSR标记的玉米品种DNA指纹图谱的构建[D]. 佘花娣.河北农业大学 2004
本文编号：3519107
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
RFLP实验原理
图 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34图 2.2 引物 ITBB01 聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig. 2.2 polyacrylamide gel electrophoresis of primer ITBB01注：图 2.1 和图 2.2 从左到右用于本实验的香蕉品种为：巴西、桂蕉 1 号、桂蕉 6 号、南天黄、
第二章 基于聚丙烯酰胺凝胶电泳的 SSR 标记筛选后期的样品检测。如图 2.1，B34 具有作为 Z9 的特异性引物的潜力。图 2.2，ITBB01的条带清晰，位点多，多态信息含量高，PIC=0.9278。表 2.3 为筛选出 29 对具有较好多态性的 SSR 引物的序列信息，重复单元等信息。图 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝胶电泳图Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34
【参考文献】：
期刊论文
[1]“Gros Michel”香蕉胚性细胞悬浮系及遗传转化体系的建立[J]. 邵秀红,吴少平,窦同心,邓贵明,盛鸥,毕方铖,胡春华,易干军,杨乔松. 分子植物育种. 2019(03)
[2]香蕉黑条叶斑病的防治药效试验[J]. 郭涛,黄琦,韦宝义,李成林,王忠文. 广西植保. 2018(03)
[3]植物品种SSR指纹分析专用软件SSR Analyser的研发[J]. 王凤格,李欣,杨扬,易红梅,江彬,张宪晨,霍永学,朱丽,葛建镕,王蕊,任洁,王璐,田红丽,赵久然. 中国农业科学. 2018(12)
[4]适于二碱基重复类型SSR引物指纹分析的连续多峰算法[J]. 王凤格,李欣,易红梅,江彬,任洁,王璐,霍永学,王蕊,葛建镕,杨杨,赵久然. 农业生物技术学报. 2018(06)
[5]利用4-香豆酸:CoA连接酶基因Mu4CL15提高香蕉植株的倒伏抗性[J]. 常胜合,孙威,许桂莺,魏卿,李敬阳,舒海燕. 分子植物育种. 2017(12)
[6]抗枯萎病香蕉新品种‘南天黄’选育[J]. 许林兵,张锡炎,李华平,陈彪,黄秉智,陈维信,冯岩,肖维强,周登博,甘东泉. 热带作物学报. 2017(06)
[7]中国香蕉生产布局的时空演变分析[J]. 顾天竹,周启凡. 江苏农业科学. 2017(05)
[8]香蕉CRISPR/Cas9基因编辑技术体系的建立[J]. 胡春华,邓贵明,孙晓玄,左存武,李春雨,邝瑞彬,杨乔松,易干军. 中国农业科学. 2017(07)
[9]广西香蕉种质资源的SSR分析[J]. 孙嘉曼,尹玲,张进忠,韦绍龙,李朝生,刘金成,卢江. 西南农业学报. 2016(08)
[10]香蕉抗（耐）枯萎病新品种桂蕉9号的选育及其高产栽培技术[J]. 韦绍龙,黄素梅,韦莉萍,韦弟,李朝生,覃柳燕,田丹丹,张进忠,周维,龙盛风,杨柳. 南方农业学报. 2016(04)
博士论文
[1]SSR分子标记开发和在香蕉种质资源遗传分析中的应用[D]. 王静毅.海南大学 2010
硕士论文
[1]应用SSR技术研究香蕉种质资源的遗传多样性[D]. 林丹銮.江西农业大学 2017
[2]香蕉种质资源基因组类型的分子标记及倍性鉴定[D]. 闫佼.江西农业大学 2016
[3]棉花品种的SSR标记鉴定及身份证构建[D]. 张小娟.安徽农业大学 2014
[4]芭蕉—中国园林艺术表现的国粹形态[D]. 丁杰.江西师范大学 2012
[5]香蕉（Musa spp.）种质资源的核型分析和变异的鉴定、筛选[D]. 劳世辉.西南大学 2011
[6]太湖地区水稻地方品种品质基因多样性及部分淀粉品质性状与SSR标记的关联研究[D]. 崔小芬.扬州大学 2011
[7]EMS诱变南高丛越橘（Vaccinium L.）及抗旱变异体的筛选[D]. 张敏.西南大学 2011
[8]农杆菌介导的巴西蕉横切薄片遗传转化体系研究[D]. 黄通谋.海南大学 2010
[9]中国主要蕉类形态学与分子系统学研究[D]. 姜燕.西南农业大学 2005
[10]基于SSR标记的玉米品种DNA指纹图谱的构建[D]. 佘花娣.河北农业大学 2004
本文编号：3519107
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/yylw/3519107.html
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