MicroRNA对番茄花青素合成调控的研究

发布时间：2021-11-26 04:55

　　果蔬中的花青素含量因其抗氧化功能,有益健康,倍受人们关注。番茄是常见的食用果蔬作物,但普通野生番茄果实却很少积累花青素,因此,探索花青素合成的分子机制,培育富含花青素的番茄果实,一直是育种科学家的研究目标。Aft基因型番茄LA1996,源于野生种（Solanum.chilense）,果实中可积累花青素且受光诱导调控。研究表明,除了转录调控因子和结构基因参与光调控花青素的合成代谢外,Small RNA也参与并调控了花青素的合成,但这些sRNA在番茄果实光诱导花青素合成代谢的分子调控基理还不清楚。本研究以Aft型番茄为主要试材,对Aft番茄不同时期果实进行光照和黑暗处理。将处理的番茄果实提取总RNA后,纯化短片段RNA并进行小RNA深度测序分析,得到了 microRNA828和microRNA858两个重要miRNA,预测其靶基因并鉴定作用位点。检测不同品种不同时期在光诱导下的花青素差异表达以及相关转录因子的差异表达;根据 ceRNA（competing endogenous RNAs）理论构建 miR828 相关的 pCAMBIA1300重组植物表达载体并通过农杆菌介导法分别侵染了拟南芥... 

【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－３?Ｓｌ－Ｉ－Ｄ样品中ｍｉｃｒｏＲＮＡ的酋位碱基偏好性??

?２不同发育时期番茄果实小ＲＮＡ深度测序分析及相关靶基因验证???ｍｉＲＮＡ?Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ?Ｂｉａｓ?ａｉ?Ｅａｃｈ?Ｐｏｓｉｔｉｏｎ?（Ｓ１＿１＿Ｄ）??丨綱??１?２?３?ｔ?５?６?７?８?９?１０?１１?１２?１３?１４?１５?－６?１７?１８?１９?２Ｃ?２１?２２??Ｐｏｓｉｔｉｏｎ??图２－４?Ｓ?ｉ－ＮＤ样品中ｍｉｃｒｏＲＮＡ各个位置碱基的偏好性??２．４．１．５?ＧＯ富集分析??ＧＯ数据库适用于各个物种，能对基因、蛋白质进行限定和描述。ＧＯ分析按照细??胞组分?Ｃｅｌｌｕｌａｒ?Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ、分子功能?Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?Ｆｕｎｃｔｉｏｎ、生物学过程?Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ??Ｐｒｏｃｅｓｓ对基因进行分类，从而给出差异表达ｍｉＲＮＡ靶基因与哪些生物学功能显著相关??（附图１）。??２．４．１．６?ＫＥＧＣ；通路分析??在植物中，不同的基因虽然有着不同功能但基因间的相互合作与影响也是不ｉｉＪ■忽视??的，因此基于Ｐａｔｈｗａｙ分析可以帮助理解不同基因的功能。ＫＥＧＧ收录了大Ｍ?Ｐａｔｈｗａｙ??数据库，针对预测出的新ｍｉＲＮＡ以及其靶基「Ａ？丨推测该ｍｉＲＮＡ行驶的功能。通过??ＫＥＧＧ分析发现朽一个差异表达的蕋闪参心了类黄刚的．生物合成通路，候选靶越因ＩＤ??为?Ｓｏｌｙｃ０４ｇ０６３２１０．３?和?Ｓｏｌｙｃ０１ｇ００９３７０．２?（附图?２）。??２．４．１．７光照／黑暗诱导下的ｍｉＲＮＡ与花青素合成代谢基因的差异表达分析??ｍｉ?ＲＮＡ劳异表达的输入数据为ｍｉＲＮＡ表达水平分析中得到的ｒｅａｄｃｏｕｎｔ数据。对??于有生物学重复的样品，分析我们采用基于负二项分布的ＤＥＳｅｑ标准

图２－７巢式ＰＣＲ结果??Ｍ：ＤＭ２０００；?１：?ＳＧＮ－Ｕ?３１９３８６；?２：?ＳＧＮ－Ｕ３１７６９４；?３：?ＳＧＮ－Ｕ３２８７４６；?４：?ＳＧＮ－Ｅ７４６７４７??

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3519439