斑玉蕈不同生长阶段细菌特性分析及分离细菌作用研究
发布时间：2021-12-18 19:14
斑玉蕈Hypsizygus marmoreus,俗称真姬菇、海鲜菇,是我国工厂化栽培的重要食用菌之一,因味道鲜美、营养丰富广受人们青睐。目前斑玉蕈生产存在周期长、成本高、效率低等问题。本研究利用高通量测序分析斑玉蕈不同生长发育阶段细菌的群落结构、消长规律,并从菌包中分离获得优势细菌,分析该菌在斑玉蕈生长发育中的作用,为斑玉蕈生长发育机理研究缩短生产周期、提高生产效率奠定扎实基础。主要的研究结果如下:1.斑玉蕈不同生长阶段细菌群落结构和多样性分析斑玉蕈不同生长阶段高通量测序结果表明,斑玉蕈平板菌丝及不同生长阶段菌包内部（空白菌包、半袋期、满袋期、后熟期）5组样品中共检测出690个OTUs,隶属于34个门、79个纲、127个目、228个科、417个属。主要的优势菌门为厚壁菌门和变形菌门,优势菌属为Rummeliibacillus属、类芽孢杆菌属和赖氨酸芽孢杆菌属。在门水平上,厚壁菌门的细菌丰度随着菌丝的生长呈现出明显的下降趋势,变形菌门细菌丰度则呈现出上升的趋势,并在后熟期达到最大占比54.72%。在属水平上,Rummeliibacillus属、赖氨酸芽孢杆菌属和芽孢杆菌属的细菌丰度在满袋...
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
斑玉蕈样品HMPM:平板菌丝；HMCK:空白菌包；HMBH:半袋期；HMBF:满袋期；HMBm:后熟期
斑玉蕈不同生长阶段细菌特性分析及功能研究13417个属、289个种。不同样品OTU数量分布如图2-2所示。平板菌丝样品中OTU数量最多，共有495个OTUs，显著多于不同生长阶段菌包样品的OTU数量。半袋期、满袋期和后熟期的OTU数量呈现上升趋势，但样品之间差异不显著。图2-2样品中OTU数量分布图Fig.2-2OTUdistributionsofthesamples注：不同小写字母表示不同样品分组之间差异显著(P<0.05)Note:Differentlowercaselettersindicatedthattherewassignificantdifferenceamongthegroupsofdifferentsamples(P<0.05)3.2稀释性曲线分析稀释性曲线是用于验证测序数据量是否足以反映样品中的物种多样性。如图2-3所示，除了空白菌包样品，其他4组样品的稀释曲线均呈先上升后趋向平缓的趋势，说明这4组样品取样合理，能够比较真实地反映样品中细菌群落结构组成。空白菌包样品的稀释性曲线仍处于上升状态，说明更多的数据量还会产生新的OTU，因此该样品在反映真实OTU情况上可能存在一定的偏差，推测可能是由于空白菌包内细菌含量较少，加上样品总DNA提取过程中受栽培料基质影响较大的原因，使得提取的DNA含量不能满足一次测序需求。
第二章斑玉蕈不同生长时期细菌群落结构和多样性分析14图2-397%相似水平下样品的稀释曲线Fig.2-3Rarefactioncurvesatthe97%similaritylevel3.3斑玉蕈平板菌丝及不同生长阶段菌包内细菌群落结构及变化在门分类水平上（图2-4），5个样品共检测到34个细菌门，优势菌门依次是厚壁菌门Firmicutes（63.89%）、变形菌门Proteobacteria（30.63%）、拟杆菌门Bacteroidetes（2.61%）、放线菌门Actinobacteria（1.26%）、绿弯菌门Chloroflexi（0.40%）、酸杆菌门Acidobacteria（0.37%）、蓝细菌门Cyanobacteria（0.35%）、绿弯菌门Chloroflexi（0.40%）、芽单胞菌门Gemmatimonadetes（0.08%）、疣微菌门Verrucomicrobia（0.16%）和梭杆菌门Fusobacteria（0.19%）。在这十个细菌门中，仅放线菌门和厚壁菌门属于革兰氏阳性细菌，其余菌门均属于革兰氏阴性细菌。厚壁菌门在半袋期、满袋期和后熟期的细菌丰度占比分别为99.89%、95.53%、44.08%，随着菌包内菌丝的生长呈现下降趋势。变形菌门在半袋期、满袋期和后熟期的细菌丰度占比分别为0%、4.41%、54.72%，随着菌包内菌丝的生长呈现上升趋势。厚壁菌门中，细菌主要集中在芽孢杆菌纲Bacilli（58.26%）。变形菌门中的细菌主要集中在γ-变形菌纲Gammaproteobacteria（26.73%）、α-变形菌纲Alphaproteobacteria（1.90%）、β-变形菌纲Betaproteobacteria（1.38%）和δ-变形菌纲Deltaproteobacteria（0.4%），其中γ-变形菌纲作为变形菌门中的主要优势菌纲，其主要集中于肠杆菌目Enterobacteriales（21.04%）。此外，对比不同样品间门水平上的细菌群落分布，发现平板菌丝中的菌门种类多于不同生长阶段
本文编号：3543021
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
斑玉蕈样品HMPM:平板菌丝；HMCK:空白菌包；HMBH:半袋期；HMBF:满袋期；HMBm:后熟期
斑玉蕈不同生长阶段细菌特性分析及功能研究13417个属、289个种。不同样品OTU数量分布如图2-2所示。平板菌丝样品中OTU数量最多，共有495个OTUs，显著多于不同生长阶段菌包样品的OTU数量。半袋期、满袋期和后熟期的OTU数量呈现上升趋势，但样品之间差异不显著。图2-2样品中OTU数量分布图Fig.2-2OTUdistributionsofthesamples注：不同小写字母表示不同样品分组之间差异显著(P<0.05)Note:Differentlowercaselettersindicatedthattherewassignificantdifferenceamongthegroupsofdifferentsamples(P<0.05)3.2稀释性曲线分析稀释性曲线是用于验证测序数据量是否足以反映样品中的物种多样性。如图2-3所示，除了空白菌包样品，其他4组样品的稀释曲线均呈先上升后趋向平缓的趋势，说明这4组样品取样合理，能够比较真实地反映样品中细菌群落结构组成。空白菌包样品的稀释性曲线仍处于上升状态，说明更多的数据量还会产生新的OTU，因此该样品在反映真实OTU情况上可能存在一定的偏差，推测可能是由于空白菌包内细菌含量较少，加上样品总DNA提取过程中受栽培料基质影响较大的原因，使得提取的DNA含量不能满足一次测序需求。
第二章斑玉蕈不同生长时期细菌群落结构和多样性分析14图2-397%相似水平下样品的稀释曲线Fig.2-3Rarefactioncurvesatthe97%similaritylevel3.3斑玉蕈平板菌丝及不同生长阶段菌包内细菌群落结构及变化在门分类水平上（图2-4），5个样品共检测到34个细菌门，优势菌门依次是厚壁菌门Firmicutes（63.89%）、变形菌门Proteobacteria（30.63%）、拟杆菌门Bacteroidetes（2.61%）、放线菌门Actinobacteria（1.26%）、绿弯菌门Chloroflexi（0.40%）、酸杆菌门Acidobacteria（0.37%）、蓝细菌门Cyanobacteria（0.35%）、绿弯菌门Chloroflexi（0.40%）、芽单胞菌门Gemmatimonadetes（0.08%）、疣微菌门Verrucomicrobia（0.16%）和梭杆菌门Fusobacteria（0.19%）。在这十个细菌门中，仅放线菌门和厚壁菌门属于革兰氏阳性细菌，其余菌门均属于革兰氏阴性细菌。厚壁菌门在半袋期、满袋期和后熟期的细菌丰度占比分别为99.89%、95.53%、44.08%，随着菌包内菌丝的生长呈现下降趋势。变形菌门在半袋期、满袋期和后熟期的细菌丰度占比分别为0%、4.41%、54.72%，随着菌包内菌丝的生长呈现上升趋势。厚壁菌门中，细菌主要集中在芽孢杆菌纲Bacilli（58.26%）。变形菌门中的细菌主要集中在γ-变形菌纲Gammaproteobacteria（26.73%）、α-变形菌纲Alphaproteobacteria（1.90%）、β-变形菌纲Betaproteobacteria（1.38%）和δ-变形菌纲Deltaproteobacteria（0.4%），其中γ-变形菌纲作为变形菌门中的主要优势菌纲，其主要集中于肠杆菌目Enterobacteriales（21.04%）。此外，对比不同样品间门水平上的细菌群落分布，发现平板菌丝中的菌门种类多于不同生长阶段
本文编号：3543021
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