中国辣椒热胁迫转录因子的全基因组鉴定及热胁迫响应的初步分析

发布时间：2021-12-28 12:52

　　采用生物信息学方法,从中国辣椒（Capsicum chinense Jacq.）全基因组序列中鉴定得到28个热胁迫转录因子（HSF）候选基因,并对这些候选基因的染色体分布、基因结构及编码蛋白的3D结构特征进行了分析。结果显示:28个候选基因的编码蛋白长度为128～526 aa;系统发育分析结果表明,HSF可分为A、B、C 3个亚家族。进一步对热胁迫处理后的中国辣椒种质进行转录组分析,共检测到27个HSF转录本,与对照组相比,实验组中有25个基因对热胁迫有不同程度的响应。 

【文章来源】：植物科学学报. 2020,38(02)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

中国辣椒HSF基因在染色体上的分布

本研究将拟南芥中的24个HSF基因及中国辣椒中筛选出的28个HSF候选基因构建系统发育树（图4）。结果显示，这些HSF基因序列可分为A、B、C 3个亚家族。其中，A族成员的数量最多，拟南芥中有17个，中国辣椒中有17个；B族成员其次，拟南芥中有5个，中国辣椒中有9个；C族成员最少，在拟南芥和中国辣椒中各有2个。图3 HSF基因蛋白的基序分析

HSF基因蛋白的基序分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄热激转录因子（Hsf）基因家族鉴定及表达分析[J]. 陈勇兵,王燕,张海利.  农业生物技术学报. 2015(04)



本文编号：3554092