梅花垂枝性状候选基因PmWND1的克隆及表达分析
发布时间：2022-01-14 18:35
梅花（Prunus mume Sieb.et Zucc.）是中国的传统名花,具有较高的观赏价值和重要的文化内涵。垂枝作为植物界广泛存在的一种枝条形态的变异,具其独特的观赏价值,但目前关于垂枝的研究多集中在激素对枝条发育的影响及构建连锁图谱进行QTL定位的初级阶段,其形成机理尚不清楚。前人研究发现,NAC转录因子对调控植物次生生长具有重要作用,对木本植物枝条的生长发育具有重要影响。课题组前期对梅花垂枝性状进行QTL定位发现,梅花Pm024260基因（N4C转录因子,拟南芥SND1同源基因）位于候选区域内。本研究围绕Pm024260对梅花垂枝性状的影响,采用生物信息学的方法对梅花全基因组NAC转录因子家族进行鉴定及分析;以’六瓣’梅和’粉台垂枝’梅杂交所得F1代为试验材料,采用RT-PCR的方法克隆目的基因Pm024260,并将其命名为PmWND1;采用实时荧光定量的方法对其在直枝梅和垂枝梅枝条中的时空表达进行分析;采用半薄切片和石蜡切片的方法观察直枝和垂枝梅一年生枝条解剖结构。主要结论如下:1、梅花基因组共有114个NAC基因,分布在梅花8条连锁群和scaffold上;构建系统进化树将梅...
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１植物ＮＡＣ转录因子结构示意图（Ｏｏｋａ＾ＯＣＢ）??．－ｒｉ２
苒功能与Ａ＾Ｍ部分相似，ｃｗｃ２突变体不能形成正常的顶端分生组织。第??一次对Ｍ４Ｃ家族蛋白的全面系统分析是Ｏｏｋａ等（２００３）进行的，其研究分析了?ＮＡＣ??蛋白序列的＃构（图１－１）；将预测得到的１０５个拟南芥ＮＡＣ蛋白和７５个水稻ＮＡＣ??蛋白构建系４进化树，分析其进化关系，并与已知序列及功能的ＮＡＣ蛋白进行分??析，将拟南并和水稻ＮＡＣ家族分为２个组，１８个亚组。随后，有研究将拟南芥和??水稻家族成员扩充为１３８和１５８个（Ｊｉｎ?ｅｔａｌ．，?２０１４），之后陆续在其他物种中发??现ｉＶ／ｉＣ家族ａ目前已经鉴定出的基因玉米（ＺＭｗａｊ〇１７７个（张进艳，２０１４），??小麦ａａ＂ｖｗｗ）１３４?个（Ｊｉｎ?ｅｔ?ａｌ．５?２０１４），大显（Ｇ／少ｃ／服?／７７〇ｘ）１５２?个（Ｌｅ?ｅｔ?ａｌ．，??２０１１），毛果杨／Ｗｃ／２〇ｃａ＾７ａ）１６３?个（Ｈｕ?ｅｔ?ａｌ．５?２０１０），桉树（￡＾（办／血５１??ｇｒａ加ｆｏ）１８９?条（Ｈｕｓｓｅｙ?ｅｔ?ａｌ”?２０１５），桃（／Ｗ／／７ｗｐｅｒ＊ｓ７ｃＧ）１１５?条（张春华，２０１２）等。??Ｉ??ｖｆＡＣ?ｄｏｍａｉｎ?Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ?ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ??广??？???ｉ?（??厂丨?Ｗ?＼??＜ｘＨ￡ＨＺＺｊ＜５Ｊ｛３?ｒ￣￣￣￣￣Ｔ￣??图１－１植物ＮＡＣ转录因子结构示意图（Ｏｏｋａ＾ＯＣＢ）??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｐｌａｎｔ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ?ｆａｃｔｏｒ?ＮＡＣ?ｐｒｏｔｅｉｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｄｉａｇｒａｍ?（Ｏｏｋａ
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【参考文献】：
期刊论文
[1]柱型和普通型苹果枝条木质部导管分子观察[J]. 刘国娟,刘殿红,王闯,徐宁,刘敏,孙晓慧. 江苏农业科学. 2016(05)
[2]矮生山茶‘恨天高’GA20ox1的克隆及其对转基因烟草株形的影响[J]. 王江英,吴斌,刘伟鑫,范正琪,李纪元. 园艺学报. 2015(08)
[3]桃PpNST1和PpSND1转录因子基因的克隆与表达分析[J]. 胡昊,刘勇,刘悦萍,邬瑞杰,花宝光,王有年. 植物生理学报. 2012(06)
[4]桃NAC基因家族生物信息学分析[J]. 张春华,上官凌飞,俞明亮,张彦苹,马瑞娟. 江苏农业学报. 2012(02)
[5]植物NAC转录因子的种类、特征及功能[J]. 李伟,韩蕾,钱永强,孙振元. 应用与环境生物学报. 2011(04)
[6]观察植物木质部的3种切片方法比较[J]. 朱登峰,唐冬英,李明芳,刘选明. 湖南农业科学. 2010(07)
[7]金坪矮垂栗有性后代性状表现[J]. 涂淑萍,邱富兴. 园艺学报. 2007(03)
[8]LAZY1 controls rice shoot gravitropism through regulating polar auxin transport[J]. Peijin Li1;Yonghong Wang1;Qian Qian2;Zhiming Fu1;Mei Wang1;Dali Zeng1,2;Baohua Li1;Xiujie Wang1;Jiayang Li11 State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China2 State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310006, China. Cell Research. 2007(05)
[9]硼砂甲苯胺蓝染液在半薄切片染色上的应用[J]. 刘冬娟,祝素文,李艳杰. 中国医科大学学报. 2004(01)
[10]赤霉素对水平放置水曲柳幼苗的负向重性和木材形成的影响[J]. 江莎,中村辉子,山本福寿. 云南植物研究. 2003(03)
博士论文
[1]梅花高密度遗传图谱构建及部分观赏性状QTL分析[D]. 张杰.北京林业大学 2016
[2]梅花花器官发育相关MADS-box基因的功能分析[D]. 徐宗大.北京林业大学 2015
[3]化学成分对木材细胞壁力学性能影响的研究[D]. 张双燕.中国林业科学研究院 2011
[4]植物响应重力刺激的机理研究[D]. 崔大勇.中国科学院研究生院（上海生命科学研究院） 2004
硕士论文
[1]百合苯甲酸甲酯代谢相关LiBSMT基因的克隆与分析[D]. 王欢.北京林业大学 2015
[2]玉米NAC转录因子家族特性分析及与水分胁迫相关性[D]. 张进艳.甘肃农业大学 2014
[3]梅花垂枝性状形态解剖、激素生理和基因分子水平研究[D]. 王富廷.北京林业大学 2014
[4]苹果柱型性状形成的分子机制探讨[D]. 白牡丹.青岛农业大学 2013
[5]大豆茎倒伏突变体基因定位、转录组测序及2个木质素合成基因的克隆研究[D]. 殷静.南京农业大学 2013
[6]桃垂枝性状生理特性及SSR分子标记研究[D]. 李亚蒙.山东农业大学 2006
本文编号：3589002
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１植物ＮＡＣ转录因子结构示意图（Ｏｏｋａ＾ＯＣＢ）??．－ｒｉ２
苒功能与Ａ＾Ｍ部分相似，ｃｗｃ２突变体不能形成正常的顶端分生组织。第??一次对Ｍ４Ｃ家族蛋白的全面系统分析是Ｏｏｋａ等（２００３）进行的，其研究分析了?ＮＡＣ??蛋白序列的＃构（图１－１）；将预测得到的１０５个拟南芥ＮＡＣ蛋白和７５个水稻ＮＡＣ??蛋白构建系４进化树，分析其进化关系，并与已知序列及功能的ＮＡＣ蛋白进行分??析，将拟南并和水稻ＮＡＣ家族分为２个组，１８个亚组。随后，有研究将拟南芥和??水稻家族成员扩充为１３８和１５８个（Ｊｉｎ?ｅｔａｌ．，?２０１４），之后陆续在其他物种中发??现ｉＶ／ｉＣ家族ａ目前已经鉴定出的基因玉米（ＺＭｗａｊ〇１７７个（张进艳，２０１４），??小麦ａａ＂ｖｗｗ）１３４?个（Ｊｉｎ?ｅｔ?ａｌ．５?２０１４），大显（Ｇ／少ｃ／服?／７７〇ｘ）１５２?个（Ｌｅ?ｅｔ?ａｌ．，??２０１１），毛果杨／Ｗｃ／２〇ｃａ＾７ａ）１６３?个（Ｈｕ?ｅｔ?ａｌ．５?２０１０），桉树（￡＾（办／血５１??ｇｒａ加ｆｏ）１８９?条（Ｈｕｓｓｅｙ?ｅｔ?ａｌ”?２０１５），桃（／Ｗ／／７ｗｐｅｒ＊ｓ７ｃＧ）１１５?条（张春华，２０１２）等。??Ｉ??ｖｆＡＣ?ｄｏｍａｉｎ?Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ?ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ??广??？???ｉ?（??厂丨?Ｗ?＼??＜ｘＨ￡ＨＺＺｊ＜５Ｊ｛３?ｒ￣￣￣￣￣Ｔ￣??图１－１植物ＮＡＣ转录因子结构示意图（Ｏｏｋａ＾ＯＣＢ）??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｐｌａｎｔ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ?ｆａｃｔｏｒ?ＮＡＣ?ｐｒｏｔｅｉｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｄｉａｇｒａｍ?（Ｏｏｋａ
?＾?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｗａｌｌ?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｇｅｎｅｓ??Ｃｅｌｌｕｌｏｓｅ?Ｘｙｌａｎ，?Ｇｌｕｃｏｍａｎｎａｎ?Ｌｉｇｎｉｎ??图１－２次生壁生物合成调控网络示意图（Ｚｈｏｎｇ?ａｎｄ?Ｙｅ，２０１４）??Ｆｉｇ．?１－２?Ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ?ｎｅｔｗｏｒｋ?ｒｅｇｕｌａｔｉｎｇ?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｗａｌｌ?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ??（Ｚｈｏｎｇ?ａｎｄ?Ｙｅ，?２０１４）??１２??
【参考文献】：
期刊论文
[1]柱型和普通型苹果枝条木质部导管分子观察[J]. 刘国娟,刘殿红,王闯,徐宁,刘敏,孙晓慧. 江苏农业科学. 2016(05)
[2]矮生山茶‘恨天高’GA20ox1的克隆及其对转基因烟草株形的影响[J]. 王江英,吴斌,刘伟鑫,范正琪,李纪元. 园艺学报. 2015(08)
[3]桃PpNST1和PpSND1转录因子基因的克隆与表达分析[J]. 胡昊,刘勇,刘悦萍,邬瑞杰,花宝光,王有年. 植物生理学报. 2012(06)
[4]桃NAC基因家族生物信息学分析[J]. 张春华,上官凌飞,俞明亮,张彦苹,马瑞娟. 江苏农业学报. 2012(02)
[5]植物NAC转录因子的种类、特征及功能[J]. 李伟,韩蕾,钱永强,孙振元. 应用与环境生物学报. 2011(04)
[6]观察植物木质部的3种切片方法比较[J]. 朱登峰,唐冬英,李明芳,刘选明. 湖南农业科学. 2010(07)
[7]金坪矮垂栗有性后代性状表现[J]. 涂淑萍,邱富兴. 园艺学报. 2007(03)
[8]LAZY1 controls rice shoot gravitropism through regulating polar auxin transport[J]. Peijin Li1;Yonghong Wang1;Qian Qian2;Zhiming Fu1;Mei Wang1;Dali Zeng1,2;Baohua Li1;Xiujie Wang1;Jiayang Li11 State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China2 State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310006, China. Cell Research. 2007(05)
[9]硼砂甲苯胺蓝染液在半薄切片染色上的应用[J]. 刘冬娟,祝素文,李艳杰. 中国医科大学学报. 2004(01)
[10]赤霉素对水平放置水曲柳幼苗的负向重性和木材形成的影响[J]. 江莎,中村辉子,山本福寿. 云南植物研究. 2003(03)
博士论文
[1]梅花高密度遗传图谱构建及部分观赏性状QTL分析[D]. 张杰.北京林业大学 2016
[2]梅花花器官发育相关MADS-box基因的功能分析[D]. 徐宗大.北京林业大学 2015
[3]化学成分对木材细胞壁力学性能影响的研究[D]. 张双燕.中国林业科学研究院 2011
[4]植物响应重力刺激的机理研究[D]. 崔大勇.中国科学院研究生院（上海生命科学研究院） 2004
硕士论文
[1]百合苯甲酸甲酯代谢相关LiBSMT基因的克隆与分析[D]. 王欢.北京林业大学 2015
[2]玉米NAC转录因子家族特性分析及与水分胁迫相关性[D]. 张进艳.甘肃农业大学 2014
[3]梅花垂枝性状形态解剖、激素生理和基因分子水平研究[D]. 王富廷.北京林业大学 2014
[4]苹果柱型性状形成的分子机制探讨[D]. 白牡丹.青岛农业大学 2013
[5]大豆茎倒伏突变体基因定位、转录组测序及2个木质素合成基因的克隆研究[D]. 殷静.南京农业大学 2013
[6]桃垂枝性状生理特性及SSR分子标记研究[D]. 李亚蒙.山东农业大学 2006
本文编号：3589002
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